Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-185642" >
Genome-Wide Associa...
-
Ramasamy, Adaikalavan
(författare)
Genome-Wide Association Studies of Asthma in Population-Based Cohorts Confirm Known and Suggested Loci and Identify an Additional Association near HLA
- Artikel/kapitelEngelska2012
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2012-09-28
-
Public Library of Science (PLoS),2012
-
electronicrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-185642
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-185642URI
-
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0044008DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Rationale: Asthma has substantial morbidity and mortality and a strong genetic component, but identification of genetic risk factors is limited by availability of suitable studies. Objectives: To test if population-based cohorts with self-reported physician-diagnosed asthma and genome-wide association (GWA) data could be used to validate known associations with asthma and identify novel associations. Methods: The APCAT (Analysis in Population-based Cohorts of Asthma Traits) consortium consists of 1,716 individuals with asthma and 16,888 healthy controls from six European-descent population-based cohorts. We examined associations in APCAT of thirteen variants previously reported as genome-wide significant (P < 5x10(-8)) and three variants reported as suggestive (P < 5 x 10(-7)). We also searched for novel associations in APCAT (Stage 1) and followed-up the most promising variants in 4,035 asthmatics and 11,251 healthy controls (Stage 2). Finally, we conducted the first genome-wide screen for interactions with smoking or hay fever. Main Results: We observed association in the same direction for all thirteen previously reported variants and nominally replicated ten of them. One variant that was previously suggestive, rs11071559 in RORA, now reaches genome-wide significance when combined with our data (P = 2.4x10(-9)). We also identified two genome-wide significant associations: rs13408661 near IL1RL1/IL18R1 (PStage1+Stage2 = 1.1x10(-9)), which is correlated with a variant recently shown to be associated with asthma (rs3771180), and rs9268516 in the HLA region (PStage1+Stage2 = 1.1x10(-8)), which appears to be independent of previously reported associations in this locus. Finally, we found no strong evidence for gene-environment interactions with smoking or hay fever status. Conclusions: Population-based cohorts with simple asthma phenotypes represent a valuable and largely untapped resource for genetic studies of asthma.
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Kuokkanen, Mikko
(författare)
-
Vedantam, Sailaja
(författare)
-
Gajdos, Zofia K.
(författare)
-
Alves, Alexessander Couto
(författare)
-
Lyon, Helen N.
(författare)
-
Ferreira, Manuel A. R.
(författare)
-
Strachan, David P.
(författare)
-
Zhao, Jing Hua
(författare)
-
Abramson, Michael J.
(författare)
-
Brown, Matthew A.
(författare)
-
Coin, Lachlan
(författare)
-
Dharmage, Shyamali C.
(författare)
-
Duffy, David L.
(författare)
-
Haahtela, Tari
(författare)
-
Heath, Andrew C.
(författare)
-
Janson, ChristerUppsala universitet,Lungmedicin och allergologi(Swepub:uu)chrisjn
(författare)
-
Kahonen, Mika
(författare)
-
Khaw, Kay-Tee
(författare)
-
Laitinen, Jaana
(författare)
-
Le Souef, Peter
(författare)
-
Lehtimaki, Terho
(författare)
-
Madden, Pamela A. F.
(författare)
-
Marks, Guy B.
(författare)
-
Martin, Nicholas G.
(författare)
-
Matheson, Melanie C.
(författare)
-
Palmer, Cameron D.
(författare)
-
Palotie, Aarno
(författare)
-
Pouta, Anneli
(författare)
-
Robertson, Colin F.
(författare)
-
Viikari, Jorma
(författare)
-
Widen, Elisabeth
(författare)
-
Wjst, Matthias
(författare)
-
Jarvis, Deborah L.
(författare)
-
Montgomery, Grant W.
(författare)
-
Thompson, Philip J.
(författare)
-
Wareham, Nick
(författare)
-
Eriksson, Johan
(författare)
-
Jousilahti, Pekka
(författare)
-
Laitinen, Tarja
(författare)
-
Pekkanen, Juha
(författare)
-
Raitakari, Olli T.
(författare)
-
O'Connor, George T.
(författare)
-
Salomaa, Veikko
(författare)
-
Jarvelin, Marjo-Riitta
(författare)
-
Hirschhorn, Joel N.
(författare)
-
Uppsala universitetLungmedicin och allergologi
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:PLOS ONE: Public Library of Science (PLoS)7:9, s. e44008-1932-6203
Internetlänk
Hitta via bibliotek
-
PLOS ONE
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Ramasamy, Adaika ...
-
Kuokkanen, Mikko
-
Vedantam, Sailaj ...
-
Gajdos, Zofia K.
-
Alves, Alexessan ...
-
Lyon, Helen N.
-
visa fler...
-
Ferreira, Manuel ...
-
Strachan, David ...
-
Zhao, Jing Hua
-
Abramson, Michae ...
-
Brown, Matthew A ...
-
Coin, Lachlan
-
Dharmage, Shyama ...
-
Duffy, David L.
-
Haahtela, Tari
-
Heath, Andrew C.
-
Janson, Christer
-
Kahonen, Mika
-
Khaw, Kay-Tee
-
Laitinen, Jaana
-
Le Souef, Peter
-
Lehtimaki, Terho
-
Madden, Pamela A ...
-
Marks, Guy B.
-
Martin, Nicholas ...
-
Matheson, Melani ...
-
Palmer, Cameron ...
-
Palotie, Aarno
-
Pouta, Anneli
-
Robertson, Colin ...
-
Viikari, Jorma
-
Widen, Elisabeth
-
Wjst, Matthias
-
Jarvis, Deborah ...
-
Montgomery, Gran ...
-
Thompson, Philip ...
-
Wareham, Nick
-
Eriksson, Johan
-
Jousilahti, Pekk ...
-
Laitinen, Tarja
-
Pekkanen, Juha
-
Raitakari, Olli ...
-
O'Connor, George ...
-
Salomaa, Veikko
-
Jarvelin, Marjo- ...
-
Hirschhorn, Joel ...
-
visa färre...
- Artiklar i publikationen
-
PLOS ONE
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet