onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-314649"
Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-314649" > Integrating mass sp...
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
- Landreh, Michael (författare)
Integrating mass spectrometry with MD simulations reveals the role of lipids in Na+/H+ antiporters
- Artikel/kapitelEngelska2017
Förlag, utgivningsår, omfång ...
- 2017-01-10
- Springer Science and Business Media LLC,2017
- electronicrdacarrier
Nummerbeteckningar
- LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-314649
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-314649URI
- https://doi.org/10.1038/ncomms13993DOI
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-139365URI
Kompletterande språkuppgifter
- Språk:engelska
- Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
- SwePubSwePub
Klassifikation
Anmärkningar
- Authors Marklund and Uzdavinys contributed equally to this work.
- Na+/H+ antiporters are found in all kingdoms of life and exhibit catalysis rates that are among the fastest of all known secondary-active transporters. Here we combine ion mobility mass spectrometry and molecular dynamics simulations to study the conformational stability and lipid-binding properties of the Na+/H+ exchanger NapA from Thermus thermophilus and compare this to the prototypical antiporter NhaA from Escherichia coli and the human homologue NHA2. We find that NapA and NHA2, but not NhaA, form stable dimers and do not selectively retain membrane lipids. By comparing wild-type NapA with engineered variants, we show that the unfolding of the protein in the gas phase involves the disruption of inter-domain contacts. Lipids around the domain interface protect the native fold in the gas phase by mediating contacts between the mobile protein segments. We speculate that elevator-type antiporters such as NapA, and likely NHA2, use a subset of annular lipids as structural support to facilitate large-scale conformational changes within the membrane.
Ämnesord och genrebeteckningar
- NATURVETENSKAP Biologi Strukturbiologi hsv//swe
- NATURAL SCIENCES Biological Sciences Structural Biology hsv//eng
- NATURVETENSKAP Data- och informationsvetenskap Bioinformatik hsv//swe
- NATURAL SCIENCES Computer and Information Sciences Bioinformatics hsv//eng
- NATURVETENSKAP Biologi Biofysik hsv//swe
- NATURAL SCIENCES Biological Sciences Biophysics hsv//eng
- NATURVETENSKAP Biologi hsv//swe
- NATURAL SCIENCES Biological Sciences hsv//eng
- Biologi med inriktning mot strukturbiologi
- Biology with specialization in Structural Biology
- Biochemistry
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
- Marklund, Erik GUppsala universitet,Biokemi,Erik Marklund(Swepub:uu)ermar499 (författare)
- Uzdavinys, PovilasStockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik(Swepub:su)pouz5783 (författare)
- Degiacomi, Matteo T. (författare)
- Coincon, MathieuStockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik(Swepub:su)mcoin (författare)
- Gault, Joseph (författare)
- Gupta, Kallol (författare)
- Liko, Idlir (författare)
- Benesch, Justin L. P. (författare)
- Drew, DavidStockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik(Swepub:su)drew (författare)
- Robinson, Carol V. (författare)
- Uppsala universitetBiokemi (creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
- Ingår i:Nature Communications: Springer Science and Business Media LLC82041-1723
Internetlänk
- https://doi.org/10.1038/ncomms13993Fulltext
- https://uu.diva-portal.org/smash/get/diva2:1071341/FULLTEXT01.pdffulltext:print
- https://www.nature.com/articles/ncomms13993.pdf
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-314649
- https://doi.org/10.1038/ncomms13993
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-139365
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Landreh, Michael
- Marklund, Erik G
- Uzdavinys, Povil ...
- Degiacomi, Matte ...
- Coincon, Mathieu
- Gault, Joseph
- visa fler...
- Gupta, Kallol
- Liko, Idlir
- Benesch, Justin ...
- Drew, David
- Robinson, Carol ...
- visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Strukturbiologi
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Data och informa ...
- och Bioinformatik
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Biofysik
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- Artiklar i publikationen
- Nature Communica ...
- Av lärosätet
- Uppsala universitet
- Stockholms universitet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
