Distinct genetic regions are associated with differential population susceptibility to chemical exposures

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-437743" > Distinct genetic re...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Kosnik, Marissa B.Stockholms universitet,Institutionen för miljövetenskap,Science for Life Laboratory (SciLifeLab) (författare)

Distinct genetic regions are associated with differential population susceptibility to chemical exposures

Artikel/kapitelEngelska2021

Förlag, utgivningsår, omfång ...

Elsevier,2021
electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-437743
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-437743URI
https://doi.org/10.1016/j.envint.2021.106488DOI
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-195566URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Interactions between environmental factors and genetics underlie the majority of chronic human diseases. Chemical exposures are likely an underestimated contributor, yet gene-environment (GxE) interaction studies rarely assess their modifying effects. Here, we describe a novel method to profile the human genome and identify regions associated with differential population susceptibility to chemical exposures. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) implicated in enriched chemical-disease intersections were identified and validated for three chemical classes with expected GxE interaction potential (neuroactive, hepatoactive, and cardioactive compounds). The same approach was then used to characterize consumer product classes with unknown risk for GxE interactions (washing products, cosmetics, and adhesives). Additionally, high-risk variant sets that may confer differential population susceptibility were identified for these consumer product groups through frequent itemset mining and pathway analysis. A dataset of 2454 consumer product chemical-disease linkages, with risk values, SNPs, and pathways for each association was developed, describing the interplay between environmental factors and genetics in human disease progression. We found that genetic hotspots implicated in GxE interactions differ across chemical classes (e.g., washing products had high-risk SNPs implicated in nervous system disease) and illustrate how this approach can discover new associations (e.g., washing product n-butoxyethanol implicated SNPs in the PI3K-Akt signaling pathway for Alzheimer's disease). Hence, our approach can predict high-risk genetic regions for differential population susceptibility to chemical exposures and characterize chemical modifying factors in specific diseases. These methods show promise for describing how chemical exposures can lead to varied health outcomes in a population and for incorporating inter-individual variability into chemical risk assessment.

Ämnesord och genrebeteckningar

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper Medicinsk genetik hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Basic Medicine Medical Genetics hsv//eng
NATURVETENSKAP Geovetenskap och miljövetenskap Miljövetenskap hsv//swe
NATURAL SCIENCES Earth and Related Environmental Sciences Environmental Sciences hsv//eng
NATURVETENSKAP Geovetenskap och miljövetenskap hsv//swe
NATURAL SCIENCES Earth and Related Environmental Sciences hsv//eng
Chemical exposures
Consumer products
Data integration
Gene-environment interactions
New approach methodologies
Risk assessment

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Enroth, Stefan,1976-Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Medicinsk genetik och genomik,Gyllensten(Swepub:uu)stenr451 (författare)
Karlsson, OskarStockholms universitet,Institutionen för miljövetenskap,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)(Swepub:su)oska6214 (författare)
Stockholms universitetInstitutionen för miljövetenskap (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Environment International: Elsevier1520160-41201873-6750

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Environment International (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Kosnik, Marissa ...; Enroth, Stefan, ...; Karlsson, Oskar

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Medicinsk geneti ...

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Geovetenskap och ...; och Miljövetenskap

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Geovetenskap och ...

Artiklar i publikationen: Environment Inte ...

Av lärosätet: Uppsala universitet; Stockholms universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se