SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-96650"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-96650" > CTCF Interacts with...

  • Chernukhin, Igor (författare)

CTCF Interacts with and Recruits the Largest Subunit of RNA Polymerase II to CTCF Target Sites Genome-Wide

  • Artikel/kapitelEngelska2007

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2007
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-96650
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-96650URI
  • https://doi.org/10.1128/MCB.01993-06DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:14542486URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • CTCF is a transcription factor with highly versatile functions ranging from gene activation and repression to the regulation of insulator function and imprinting. Although many of these functions rely on CTCF-DNA interactions, it is an emerging realization that CTCF-dependent molecular processes involve CTCF interactions with other proteins. In this study, we report the association of a subpopulation of CTCF with the RNA polymerase II (Pol II) protein complex. We identified the largest subunit of Pol II (LS Pol II) as a protein significantly colocalizing with CTCF in the nucleus and specifically interacting with CTCF in vivo and in vitro. The role of CTCF as a link between DNA and LS Pol II has been reinforced by the observation that the association of LS Pol II with CTCF target sites in vivo depends on intact CTCF binding sequences. "Serial" chromatin immunoprecipitation (ChIP) analysis revealed that both CTCF and LS Pol II were present at the β-globin insulator in proliferating HD3 cells but not in differentiated globin synthesizing HD3 cells. Further, a single wild-type CTCF target site (N-Myc-CTCF), but not the mutant site deficient for CTCF binding, was sufficient to activate the transcription from the promoterless reporter gene in stably transfected cells. Finally, a ChIP-on-ChIP hybridization assay using microarrays of a library of CTCF target sites revealed that many intergenic CTCF target sequences interacted with both CTCF and LS Pol II. We discuss the possible implications of our observations with respect to plausible mechanisms of transcriptional regulation via a CTCF-mediated direct link of LS Pol II to the DNA.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Shamsuddin, Shaharum (författare)
  • Kang, Sung Yun (författare)
  • Bergström, RositaKarolinska Institutet,Uppsala universitet,Zoologisk utvecklingsbiologi (författare)
  • Kwon, Yoo-Wook (författare)
  • Yu, WenQiang (författare)
  • Whitehead, JoanneUppsala universitet,Zoologisk utvecklingsbiologi (författare)
  • Mukhopadhyay, RituparnaUppsala universitet,Zoologisk utvecklingsbiologi (författare)
  • Docquier, France (författare)
  • Farrar, Dawn (författare)
  • Morrison, Ian (författare)
  • Vigneron, Marc (författare)
  • Wu, Shwu-Yuan (författare)
  • Chiang, Sheng-Ming (författare)
  • Loukinov, Dimitri (författare)
  • Ohlsson, RolfKarolinska Institutet,Uppsala universitet,Zoologisk utvecklingsbiologi(Swepub:uu)rolfohls (författare)
  • Klenova, Elena (författare)
  • Chiang, CM (författare)
  • Lobanenkov, V (författare)
  • Uppsala universitetZoologisk utvecklingsbiologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Molecular and Cellular Biology27:5, s. 1631-16480270-73061098-5549

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy