Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/152492" >
Differential coexpr...
Differential coexpression analysis of obesity-associated networks in human subcutaneous adipose tissue.
- Artikel/kapitelEngelska2012
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2011-03-22
-
Springer Science and Business Media LLC,2012
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/152492
-
https://gup.ub.gu.se/publication/152492URI
-
https://doi.org/10.1038/ijo.2011.22DOI
Kompletterande språkuppgifter
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Objective:To use a unique obesity-discordant sib-pair study design to combine differential expression analysis, expression quantitative trait loci (eQTLs) mapping and a coexpression regulatory network approach in subcutaneous human adipose tissue to identify genes relevant to the obese state.Study design:Genome-wide transcript expression in subcutaneous human adipose tissue was measured using Affymetrix U133 Plus 2.0 microarrays (Affymetrix, Santa Clara, CA, USA), and genome-wide genotyping data was obtained using an Applied Biosystems (Applied Biosystems; Life Technologies, Carlsbad, CA, USA) SNPlex linkage panel.Subjects:A total of 154 Swedish families ascertained through an obese proband (body mass index (BMI) >30kgm(-2)) with a discordant sibling (BMI>10kgm(-2) less than proband).Results:Approximately one-third of the transcripts were differentially expressed between lean and obese siblings. The cellular adhesion molecules (CAMs) KEGG grouping contained the largest number of differentially expressed genes under cis-acting genetic control. By using a novel approach to contrast CAMs coexpression networks between lean and obese siblings, a subset of differentially regulated genes was identified, with the previously GWAS obesity-associated neuronal growth regulator 1 (NEGR1) as a central hub. Independent analysis using mouse data demonstrated that this finding of NEGR1 is conserved across species.Conclusion:Our data suggest that in addition to its reported role in the brain, NEGR1 is also expressed in subcutaneous adipose tissue and acts as a central 'hub' in an obesity-related transcript network.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Jacobson, Peter,1962Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine(Swepub:gu)xjacop
(författare)
-
Falchi, M
(författare)
-
Bottolo, L
(författare)
-
Andersson, Johanna,1974Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine(Swepub:gu)xanjoh
(författare)
-
Petretto, E
(författare)
-
Bonnefond, A
(författare)
-
Vaillant, E
(författare)
-
Lecoeur, C
(författare)
-
Vatin, V
(författare)
-
Jernås, Margareta,1961Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine(Swepub:gu)xjernm
(författare)
-
Balding, D
(författare)
-
Petteni, M
(författare)
-
Park, Y S
(författare)
-
Aitman, T
(författare)
-
Richardson, S
(författare)
-
Sjöström, LarsGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine(Swepub:gu)xsjosl
(författare)
-
Carlsson, Lena M S,1957Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine(Swepub:gu)xcarle
(författare)
-
Froguel, P
(författare)
-
Göteborgs universitetInstitutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:International Journal of Obesity: Springer Science and Business Media LLC36:1, s. 137-1471476-54970307-0565
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Walley, A J
-
Jacobson, Peter, ...
-
Falchi, M
-
Bottolo, L
-
Andersson, Johan ...
-
Petretto, E
-
visa fler...
-
Bonnefond, A
-
Vaillant, E
-
Lecoeur, C
-
Vatin, V
-
Jernås, Margaret ...
-
Balding, D
-
Petteni, M
-
Park, Y S
-
Aitman, T
-
Richardson, S
-
Sjöström, Lars
-
Carlsson, Lena M ...
-
Froguel, P
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Genetik
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
- Artiklar i publikationen
-
International Jo ...
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet