SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/318607"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/318607" > Pan-cancer analysis...

  • Larsson, PeterGothenburg University,Göteborgs universitet,Sahlgrenska Centrum för Cancerforskning (SCCR),Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Sahlgrenska Center for Cancer Research (SCCR),Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology (författare)

Pan-cancer analysis of genomic and transcriptomic data reveals the prognostic relevance of human proteasome genes in different cancer types.

  • Artikel/kapitelEngelska2022

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2022-09-19
  • Springer Science and Business Media LLC,2022

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/318607
  • https://gup.ub.gu.se/publication/318607URI
  • https://doi.org/10.1186/s12885-022-10079-4DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • The human proteasome gene family (PSM) consists of 49 genes that play a crucial role in cancer proteostasis. However, little is known about the effect of PSM gene expression and genetic alterations on clinical outcome in different cancer forms.Here, we performed a comprehensive pan-cancer analysis of genetic alterations in PSM genes and the subsequent prognostic value of PSM expression using data from The Cancer Genome Atlas (TCGA) containing over 10,000 samples representing up to 33 different cancer types. External validation was performed using a breast cancer cohort and KM plotter with four cancer types.The PSM genetic alteration frequency was high in certain cancer types (e.g. 67%; esophageal adenocarcinoma), with DNA amplification being most common. Compared with normal tissue, most PSM genes were predominantly overexpressed in cancer. Survival analysis also established a relationship with PSM gene expression and adverse clinical outcome, where PSMA1 and PSMD11 expression were linked to more unfavorable prognosis in≥30% of cancer types for both overall survival (OS) and relapse-free interval (PFI). Interestingly, PSMB5 gene expression was associated with OS (36%) and PFI (27%), and OS for PSMD2 (42%), especially when overexpressed.These findings indicate that several PSM genes may potentially be prognostic biomarkers and novel therapeutic targets for different cancer forms.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Pettersson, DaniellaGothenburg University,Göteborgs universitet,Sahlgrenska Centrum för Cancerforskning (SCCR),Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för medicinsk strålningsvetenskap,Sahlgrenska Center for Cancer Research (SCCR),Institute of Clinical Sciences, Department of Medical Radiation Sciences(Swepub:gu)xpetdy (författare)
  • Engqvist, Hanna,1985Gothenburg University,Göteborgs universitet,Sahlgrenska Centrum för Cancerforskning (SCCR),Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Sahlgrenska Center for Cancer Research (SCCR),Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology(Swepub:gu)xengha (författare)
  • Werner Rönnerman, Elisabeth,1970Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Sahlgrenska Centrum för Cancerforskning (SCCR),Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology,Sahlgrenska Center for Cancer Research (SCCR)(Swepub:gu)xwerel (författare)
  • Forssell-Aronsson, Eva,1961Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för medicinsk strålningsvetenskap,Sahlgrenska Centrum för Cancerforskning (SCCR),Institute of Clinical Sciences, Department of Medical Radiation Sciences,Sahlgrenska Center for Cancer Research (SCCR)(Swepub:gu)xforev (författare)
  • Kovács, Anikó,1961 (författare)
  • Karlsson, Per,1963Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology(Swepub:gu)xkperd (författare)
  • Helou, Khalil,1966Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Sahlgrenska Centrum för Cancerforskning (SCCR),Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology,Sahlgrenska Center for Cancer Research (SCCR)(Swepub:gu)xhelkh (författare)
  • Parris, Toshima Z,1978Gothenburg University,Göteborgs universitet,Sahlgrenska Centrum för Cancerforskning (SCCR),Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Sahlgrenska Center for Cancer Research (SCCR),Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology(Swepub:gu)xparto (författare)
  • Göteborgs universitetSahlgrenska Centrum för Cancerforskning (SCCR) (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:BMC cancer: Springer Science and Business Media LLC221471-2407

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy