Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:43dc42a0-3a18-46a7-a7a3-9197a8a1f209" >
Association testing...
Association testing of variants in the hepatocyte nuclear factor 4 alpha gene with risk of type 2 diabetes in 7,883 people
- Artikel/kapitelEngelska2005
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
American Diabetes Association,2005
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:43dc42a0-3a18-46a7-a7a3-9197a8a1f209
-
https://lup.lub.lu.se/record/250624URI
-
https://doi.org/10.2337/diabetes.54.3.886DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Anmärkningar
-
Two recent publications reported association of common polymorphisms in the P2 promoter of hepatocyte nuclear factor 4alpha (HNF4alpha) (the MODY1 gene) with risk for type 2 diabetes. We attempted to reproduce this putative association by genotyping 11 single nucleotide polymorphism (SNPs) spanning the HNF4a coding region and the P2 promoter in >3,400 patients and control subjects from Sweden, Finland, and Canada. One SNP that was consistently associated in the two previous reports (rs1884613, in the P2 promoter region) also trended in the same direction in our sample, albeit with a lower estimated odds ratio (OR) of 1.11 (P = 0.05, one-tailed). We genotyped this SNP (rs1884613) in an additional 4,400 subjects from North America and Poland. In this sample, the association was not confirmed and trended in the opposite direction (OR 0.88). Meta-analysis of our combined sample of 7,883 people (three times larger than the two initial reports combined) yielded an OR of 0.97 (P = 0.27). Finally, we provide an updated analysis of haplotype structure in the region to guide any further investigation of common variation in HNF4alpha. Although our combined results fail to replicate the previously reported association of common variants in HNF4alpha with risk for type 2 diabetes, we cannot exclude an effect smaller than that originally proposed, heterogeneity among samples, variation in as-yet-unmeasured genotypic or environmental modifiers, or true association secondary to linkage disequilibrium (LD) with as-yet-undiscovered variant(s) in the region.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Graham, R R
(författare)
-
de Bakker, P I W
(författare)
-
Sun, M
(författare)
-
Almgren, PeterLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)endo-pal
(författare)
-
Tuomi, T
(författare)
-
Gaudet, D
(författare)
-
Hudson, T J
(författare)
-
Ardlie, K G
(författare)
-
Daly, M J
(författare)
-
Hirschhorn, J N
(författare)
-
Groop, LeifLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)endo-lgr
(författare)
-
Altshuler, D
(författare)
-
Genomik, diabetes och endokrinologiForskargrupper vid Lunds universitet
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Diabetes: American Diabetes Association54:3, s. 886-8921939-327X0012-1797
Internetlänk
Hitta via bibliotek
-
Diabetes
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Winckler, W
-
Graham, R R
-
de Bakker, P I W
-
Sun, M
-
Almgren, Peter
-
Tuomi, T
-
visa fler...
-
Gaudet, D
-
Hudson, T J
-
Ardlie, K G
-
Daly, M J
-
Hirschhorn, J N
-
Groop, Leif
-
Altshuler, D
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Endokrinologi oc ...
- Artiklar i publikationen
-
Diabetes
- Av lärosätet
-
Lunds universitet