SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:7f5e95b2-2227-428e-9353-e25b4e07f4f0"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:7f5e95b2-2227-428e-9353-e25b4e07f4f0" > The structure of hu...

LIBRIS Formathandbok  (Information om MARC21)
FältnamnIndikatorerMetadata
00006349naa a2200469 4500
001oai:lup.lub.lu.se:7f5e95b2-2227-428e-9353-e25b4e07f4f0
003SwePub
008210310s2021 | |||||||||||000 ||eng|
0247 a https://lup.lub.lu.se/record/7f5e95b2-2227-428e-9353-e25b4e07f4f02 URI
0247 a https://doi.org/10.1039/d0sc05971d2 DOI
040 a (SwePub)lu
041 a engb eng
042 9 SwePub
072 7a art2 swepub-publicationtype
072 7a ref2 swepub-contenttype
1001 a Hasan, Mahmudulu Lund University,Lunds universitet,Biokemi och Strukturbiologi,Centrum för Molekylär Proteinvetenskap,Kemiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Biochemistry and Structural Biology,Center for Molecular Protein Science,Department of Chemistry,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH4 aut0 (Swepub:lu)med-mmh
2451 0a The structure of human dermatan sulfate epimerase 1 emphasizes the importance of C5-epimerization of glucuronic acid in higher organisms
264 c 2021
264 1b Royal Society of Chemistry (RSC),c 2021
300 a 17 s.
520 a Dermatan sulfate epimerase 1 (DS-epi1, EC 5.1.3.19) catalyzes the conversion of d-glucuronic acid to l-iduronic acid on the polymer level, a key step in the biosynthesis of the glycosaminoglycan dermatan sulfate. Here, we present the first crystal structure of the catalytic domains of DS-epi1, solved at 2.4 Å resolution, as well as a model of the full-length luminal protein obtained by a combination of macromolecular crystallography and targeted cross-linking mass spectrometry. Based on docking studies and molecular dynamics simulations of the protein structure and a chondroitin substrate, we suggest a novel mechanism of DS-epi1, involving a His/double-Tyr motif. Our work uncovers detailed information about the domain architecture, active site, metal-coordinating center and pattern of N-glycosylation of the protein. Additionally, the structure of DS-epi1 reveals a high structural similarity to proteins from several families of bacterial polysaccharide lyases. DS-epi1 is of great importance in a range of diseases, and the structure provides a necessary starting point for design of active site inhibitors.
650 7a MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAPx Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaperx Cell- och molekylärbiologi0 (SwePub)301082 hsv//swe
650 7a MEDICAL AND HEALTH SCIENCESx Basic Medicinex Cell and Molecular Biology0 (SwePub)301082 hsv//eng
650 7a NATURVETENSKAPx Biologix Biokemi och molekylärbiologi0 (SwePub)106022 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Biological Sciencesx Biochemistry and Molecular Biology0 (SwePub)106022 hsv//eng
7001 a Khakzad, Hamedu École normale supérieure Paris-Saclay4 aut
7001 a Happonen, Lottau Lund University,Lunds universitet,Molekylär patogenes,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUBIN Lab- Lunds laboratorium för neurokirurgisk hjärnskadeforskning,BioMS,Molecular Pathogenesis,Lund University Research Groups,LUBIN Lab- Lund Brain Injury laboratory for Neurosurgical research4 aut0 (Swepub:lu)immu-loh
7001 a Sundin, Andersu Lund University,Lunds universitet,Centrum för analys och syntes,Kemiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Bioteknik,Centrum för tillämpade biovetenskaper,Centre for Analysis and Synthesis,Department of Chemistry,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH,Biotechnology,Center for Applied Life Sciences,Faculty of Engineering, LTH4 aut0 (Swepub:lu)ok2-aps
7001 a Unge, Johanu University of California, Los Angeles4 aut0 (Swepub:lu)mbfy-jun
7001 a Mueller, Uweu Helmholtz Association of German Research Centers4 aut
7001 a Malmström, Johanu Lund University,Lunds universitet,Infection Medicine Proteomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUBIN Lab- Lunds laboratorium för neurokirurgisk hjärnskadeforskning,SEBRA Sepsis and Bacterial Resistance Alliance,epIgG,BioMS,Lund University Research Groups,LUBIN Lab- Lund Brain Injury laboratory for Neurosurgical research4 aut0 (Swepub:lu)medk-jma
7001 a Westergren-Thorsson, Gunillau Lund University,Lunds universitet,Lungbiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Lund University Bioimaging Center,Medicinska fakulteten,WCMM- Wallenberg center för molekylär medicinsk forskning,Lung Biology,Lund University Research Groups,Faculty of Medicine,WCMM-Wallenberg Centre for Molecular Medicine4 aut0 (Swepub:lu)medk-gwt
7001 a Malmström, Larsu Lund University,Lunds universitet,LUBIN Lab- Lunds laboratorium för neurokirurgisk hjärnskadeforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,epIgG,LUBIN Lab- Lund Brain Injury laboratory for Neurosurgical research,Lund University Research Groups4 aut0 (Swepub:lu)elma-lma
7001 a Ellervik, Ulfu Lund University,Lunds universitet,Lungbiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Centrum för analys och syntes,Kemiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Bioteknik,Centrum för tillämpade biovetenskaper,Lung Biology,Lund University Research Groups,Centre for Analysis and Synthesis,Department of Chemistry,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH,Biotechnology,Center for Applied Life Sciences,Faculty of Engineering, LTH4 aut0 (Swepub:lu)ok2-uel
7001 a Malmström, Andersu Lund University,Lunds universitet,Matrixbiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,WCMM- Wallenberg center för molekylär medicinsk forskning,Medicinska fakulteten,Matrix Biology,Lund University Research Groups,WCMM-Wallenberg Centre for Molecular Medicine,Faculty of Medicine4 aut0 (Swepub:lu)medk-ama
7001 a Tykesson, Emilu Lund University,Lunds universitet,Matrixbiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Matrix Biology,Lund University Research Groups4 aut0 (Swepub:lu)med-elt
7102 a Biokemi och Strukturbiologib Centrum för Molekylär Proteinvetenskap4 org
7730 t Chemical Scienced : Royal Society of Chemistry (RSC)g 12:5, s. 1869-1885q 12:5<1869-1885x 2041-6520x 2041-6539
8564 u http://dx.doi.org/10.1039/d0sc05971dx freey FULLTEXT
8564 u https://pubs.rsc.org/en/content/articlepdf/2021/sc/d0sc05971d
8564 8u https://lup.lub.lu.se/record/7f5e95b2-2227-428e-9353-e25b4e07f4f0
8564 8u https://doi.org/10.1039/d0sc05971d

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy