Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:e20a5103-01ae-48a3-bf5d-93f79b9ea1b7" >
Nanoconfined Circul...
Nanoconfined Circular and Linear DNA: Equilibrium Conformations and Unfolding Kinetics
-
- Alizadehheidari, Mohammadreza, 1987 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Werner, Erik (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för fysik (GU),Department of Physics (GU)
-
- Noble, Charleston (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Fasta tillståndets fysik,Fysiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Genomgår omorganisation,Institutionen för astronomi och teoretisk fysik - Genomgår omorganisation,Naturvetenskapliga fakulteten,Solid State Physics,Department of Physics,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH,Computational Biology and Biological Physics - Undergoing reorganization,Department of Astronomy and Theoretical Physics - Undergoing reorganization,Faculty of Science
-
visa fler...
-
- Reiter-Schad, Michaela (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Genomgår omorganisation,Institutionen för astronomi och teoretisk fysik - Genomgår omorganisation,Naturvetenskapliga fakulteten,Computational Biology and Biological Physics - Undergoing reorganization,Department of Astronomy and Theoretical Physics - Undergoing reorganization,Faculty of Science
-
- Nyberg, Lena, 1979 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Fritzsche, Joachim, 1977 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Mehlig, Bernhard, 1964 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för fysik (GU),Department of Physics (GU)
-
- Tegenfeldt, Jonas (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Fasta tillståndets fysik,Fysiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Solid State Physics,Department of Physics,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH
-
- Ambjörnsson, Tobias (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Genomgår omorganisation,Institutionen för astronomi och teoretisk fysik - Genomgår omorganisation,Naturvetenskapliga fakulteten,Computational Biology and Biological Physics - Undergoing reorganization,Department of Astronomy and Theoretical Physics - Undergoing reorganization,Faculty of Science
-
- Persson, Fredrik (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för cell- och molekylärbiologi
-
- Westerlund, Fredrik, 1978 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2015-01-29
- 2015
- Engelska.
-
Ingår i: Macromolecules. - : American Chemical Society (ACS). - 0024-9297 .- 1520-5835. ; 48:3, s. 871-878
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10...
-
visa fler...
-
http://arxiv.org/pdf...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://research.cha...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Studies of circular DNA confined to nanofluidic channels are relevant both from a fundamental polymer-physics perspective and due to the importance of circular DNA molecules in vivo. We here observe the unfolding of confined DNA from the circular to linear configuration as a light-induced double-strand break occurs, characterize the dynamics, and compare the equilibrium conformational statistics of linear and circular configurations. This is important because it allows us to determine to what extent existing statistical theories describe the extension of confined circular DNA. We find that the ratio of the extensions of confined linear and circular DNA configurations increases as the buffer concentration decreases. The experimental results fall between theoretical predictions for the extended de Gennes regime at weaker confinement and the Odijk regime at stronger confinement. We show that it is possible to directly distinguish between circular and linear DNA molecules by measuring the emission intensity from the DNA. Finally, we determine the rate of unfolding and show that this rate is larger for more confined DNA, possibly reflecting the corresponding larger difference in entropy between the circular and linear configurations.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Fysik -- Den kondenserade materiens fysik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Physical Sciences -- Condensed Matter Physics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biofysik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biophysics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Fysik -- Annan fysik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Physical Sciences -- Other Physics Topics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Fysik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Physical Sciences (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Cellbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Cell Biology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Alizadehheidari, ...
-
Werner, Erik
-
Noble, Charlesto ...
-
Reiter-Schad, Mi ...
-
Nyberg, Lena, 19 ...
-
Fritzsche, Joach ...
-
visa fler...
-
Mehlig, Bernhard ...
-
Tegenfeldt, Jona ...
-
Ambjörnsson, Tob ...
-
Persson, Fredrik
-
Westerlund, Fred ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Fysik
-
och Den kondenserade ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biofysik
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Fysik
-
och Annan fysik
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Fysik
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Cellbiologi
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
- Artiklar i publikationen
-
Macromolecules
- Av lärosätet
-
Lunds universitet
-
Chalmers tekniska högskola
-
Göteborgs universitet
-
Uppsala universitet