Sökning: onr:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:132204074" >
Novel PRD-like home...
-
Tohonen, VKarolinska Institutet
(författare)
Novel PRD-like homeodomain transcription factors and retrotransposon elements in early human development
- Artikel/kapitelEngelska2015
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2015-09-11
-
Springer Science and Business Media LLC,2015
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:prod.swepub.kib.ki.se:132204074
-
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:132204074URI
-
https://doi.org/10.1038/ncomms9207DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Transcriptional program that drives human preimplantation development is largely unknown. Here, by using single-cell RNA sequencing of 348 oocytes, zygotes and single blastomeres from 2- to 3-day-old embryos, we provide a detailed analysis of the human preimplantation transcriptome. By quantifying transcript far 5′-ends (TFEs), we include in our analysis transcripts that derive from alternative promoters. We show that 32 and 129 genes are transcribed during the transition from oocyte to four-cell stage and from four- to eight-cell stage, respectively. A number of identified transcripts originates from previously unannotated genes that include the PRD-like homeobox genes ARGFX, CPHX1, CPHX2, DPRX, DUXA, DUXB and LEUTX. Employing de novo promoter motif extraction on sequences surrounding TFEs, we identify significantly enriched gene regulatory motifs that often overlap with Alu elements. Our high-resolution analysis of the human transcriptome during preimplantation development may have important implications on future studies of human pluripotent stem cells and cell reprograming.
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Katayama, SKarolinska Institutet
(författare)
-
Vesterlund, LKarolinska Institutet
(författare)
-
Jouhilahti, EMKarolinska Institutet
(författare)
-
Sheikhi, M
(författare)
-
Madissoon, E
(författare)
-
Filippini-Cattaneo, G
(författare)
-
Jaconi, M
(författare)
-
Johnsson, AKarolinska Institutet
(författare)
-
Burglin, TR
(författare)
-
Linnarsson, SKarolinska Institutet
(författare)
-
Hovatta, OKarolinska Institutet
(författare)
-
Kere, JKarolinska Institutet
(författare)
-
Karolinska Institutet
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Nature communications: Springer Science and Business Media LLC6, s. 8207-2041-1723
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Tohonen, V
-
Katayama, S
-
Vesterlund, L
-
Jouhilahti, EM
-
Sheikhi, M
-
Madissoon, E
-
visa fler...
-
Filippini-Cattan ...
-
Jaconi, M
-
Johnsson, A
-
Burglin, TR
-
Linnarsson, S
-
Hovatta, O
-
Kere, J
-
visa färre...
- Artiklar i publikationen
-
Nature communica ...
- Av lärosätet
-
Karolinska Institutet