Sökning: onr:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:138576159" >
IBD risk loci are e...
IBD risk loci are enriched in multigenic regulatory modules encompassing putative causative genes
-
- Momozawa, Y (författare)
- Unit of Animal Genomics, WELBIO, GIGA-R, Faculty of Veterinary Medicine, University of Liège (B34), Liège, Belgium; Laboratory for Genotyping Development, RIKEN Center for Integrative Medical Science, 1-7-22, Suehiro-cho, Tsurumi-ku, Yokohama, Kanagawa, Japan
-
Dmitrieva, J (författare)
-
Theatre, E (författare)
-
visa fler...
-
Deffontaine, V (författare)
-
Rahmouni, S (författare)
-
Charloteaux, B (författare)
-
Crins, F (författare)
-
Docampo, E (författare)
-
Elansary, M (författare)
-
Gori, AS (författare)
-
Lecut, C (författare)
-
Mariman, R (författare)
-
- Mni, M (författare)
- Karolinska Institutet
-
Oury, C (författare)
-
Altukhov, I (författare)
-
Alexeev, D (författare)
-
Aulchenko, Y (författare)
-
Amininejad, L (författare)
-
Bouma, G (författare)
-
Hoentjen, F (författare)
-
Lowenberg, M (författare)
-
Oldenburg, B (författare)
-
Pierik, MJ (författare)
-
vander Meulen-de Jong, AE (författare)
-
van der Woude, CJ (författare)
-
Visschedijk, MC (författare)
-
Lathrop, M (författare)
-
Hugot, JP (författare)
-
Weersma, RK (författare)
-
De Vos, M (författare)
-
Franchimont, D (författare)
-
Vermeire, S (författare)
-
Kubo, M (författare)
-
Louis, E (författare)
-
Georges, M (författare)
-
Abraham, C (författare)
-
Achkar, JP (författare)
-
Ahmad, T (författare)
-
Ananthakrishnan, AN (författare)
-
Andersen, V (författare)
-
Anderson, CA (författare)
-
Andrews, JM (författare)
-
Annese, V (författare)
-
Aumais, G (författare)
-
Baidoo, L (författare)
-
Baldassano, RN (författare)
-
Bampton, PA (författare)
-
Barclay, M (författare)
-
Barrett, JC (författare)
-
Bayless, TM (författare)
-
Bethge, J (författare)
-
Bitton, A (författare)
-
Boucher, G (författare)
-
Brand, S (författare)
-
Brandt, B (författare)
-
Brant, SR (författare)
-
Buning, C (författare)
-
Chew, A (författare)
-
- Halfvarson, Jonas, 1970- (författare)
- Örebro universitet,Institutionen för medicinska vetenskaper,Department of Gastroenterology
-
Cleynen, I (författare)
-
Cohain, A (författare)
-
Croft, A (författare)
-
Daly, MJ (författare)
-
- D'Amato, M (författare)
- Karolinska Institutet
-
Danese, S (författare)
-
De Jong, D (författare)
-
Denapiene, G (författare)
-
Denson, LA (författare)
-
Devaney, KL (författare)
-
Dewit, O (författare)
-
D'Inca, R (författare)
-
Dubinsky, M (författare)
-
Duerr, RH (författare)
-
Edwards, C (författare)
-
Ellinghaus, D (författare)
-
Essers, J (författare)
-
Ferguson, LR (författare)
-
Festen, EA (författare)
-
Fleshner, P (författare)
-
Florin, T (författare)
-
Franke, A (författare)
-
Fransen, K (författare)
-
Gearry, R (författare)
-
Gieger, C (författare)
-
Glas, J (författare)
-
Goyette, P (författare)
-
Green, T (författare)
-
Griffiths, AM (författare)
-
Guthery, SL (författare)
-
Hakonarson, H (författare)
-
Halfvarson, J (författare)
-
Hanigan, K (författare)
-
Haritunians, T (författare)
-
Hart, A (författare)
-
Hawkey, C (författare)
-
Hayward, NK (författare)
-
Hedl, M (författare)
-
Henderson, P (författare)
-
Hu, XH (författare)
-
Huang, HL (författare)
-
Hui, KY (författare)
-
Imielinski, M (författare)
-
Ippoliti, A (författare)
-
Jonaitis, L (författare)
-
Jostins, L (författare)
-
Karlsen, TH (författare)
-
Kennedy, NA (författare)
-
Khan, MA (författare)
-
Kiudelis, G (författare)
-
Krishnaprasad, K (författare)
-
Kugathasan, S (författare)
-
Kupcinskas, L (författare)
-
Latiano, A (författare)
-
Laukens, D (författare)
-
Lawrance, IC (författare)
-
Lee, JC (författare)
-
Lees, CW (författare)
-
Leja, M (författare)
-
Van Limbergen, J (författare)
-
Lionetti, P (författare)
-
Liu, JZ (författare)
-
Mahy, G (författare)
-
Mansfield, J (författare)
-
Massey, D (författare)
-
Mathew, CG (författare)
-
McGovern, DPB (författare)
-
Milgrom, R (författare)
-
Mitrovic, M (författare)
-
Montgomery, GW (författare)
-
Mowat, C (författare)
-
Newman, W (författare)
-
Ng, A (författare)
-
Ng, SC (författare)
-
Ng, SME (författare)
-
Nikolaus, S (författare)
-
Ning, K (författare)
-
Nothen, M (författare)
-
Oikonomou, I (författare)
-
Palmieri, O (författare)
-
Parkes, M (författare)
-
Phillips, A (författare)
-
Ponsioen, CY (författare)
-
Potocnik, U (författare)
-
Prescott, NJ (författare)
-
Proctor, DD (författare)
-
Radford-Smith, G (författare)
-
Rahier, JF (författare)
-
Raychaudhuri, S (författare)
-
Regueiro, M (författare)
-
Rieder, F (författare)
-
Rioux, JD (författare)
-
Ripke, S (författare)
-
Roberts, R (författare)
-
Russell, RK (författare)
-
Sanderson, JD (författare)
-
Sans, M (författare)
-
Satsangi, J (författare)
-
Schadt, EE (författare)
-
Schreiber, S (författare)
-
Schulte, D (författare)
-
Schumm, LP (författare)
-
Scott, R (författare)
-
Seielstad, M (författare)
-
Sharma, Y (författare)
-
Silverberg, MS (författare)
-
Simms, LA (författare)
-
Skieceviciene, J (författare)
-
Spain, SL (författare)
-
Steinhart, AH (författare)
-
Stempak, JM (författare)
-
Stronati, L (författare)
-
Sventoraityte, J (författare)
-
Targan, SR (författare)
-
Taylor, KM (författare)
-
ter Velde, A (författare)
-
- Torkvist, L (författare)
- Karolinska Institutet
-
Tremelling, M (författare)
-
van Sommeren, S (författare)
-
Vasiliauskas, E (författare)
-
Verspaget, HW (författare)
-
Walters, T (författare)
-
Wang, K (författare)
-
Wang, MH (författare)
-
Wei, Z (författare)
-
Whiteman, D (författare)
-
Wijmenga, C (författare)
-
Wilson, DC (författare)
-
Winkelmann, J (författare)
-
Xavier, RJ (författare)
-
Zhang, B (författare)
-
Zhang, CK (författare)
-
Zhang, H (författare)
-
Zhang, W (författare)
-
- Zhao, HY (författare)
- Department of Biostatistics, School of Public Health, Yale University, New Haven CT, United States
-
Zhao, ZZ (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2018-06-21
- 2018
- Engelska.
-
Ingår i: Nature communications. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2041-1723. ; 9:1, s. 2427-
- Relaterad länk:
-
https://www.nature.c...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- GWAS have identified >200 risk loci for Inflammatory Bowel Disease (IBD). The majority of disease associations are known to be driven by regulatory variants. To identify the putative causative genes that are perturbed by these variants, we generate a large transcriptome data set (nine disease-relevant cell types) and identify 23,650 cis-eQTL. We show that these are determined by ∼9720 regulatory modules, of which ∼3000 operate in multiple tissues and ∼970 on multiple genes. We identify regulatory modules that drive the disease association for 63 of the 200 risk loci, and show that these are enriched in multigenic modules. Based on these analyses, we resequence 45 of the corresponding 100 candidate genes in 6600 Crohn disease (CD) cases and 5500 controls, and show with burden tests that they include likely causative genes. Our analyses indicate that ≥10-fold larger sample sizes will be required to demonstrate the causality of individual genes using this approach.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Momozawa, Y
-
Dmitrieva, J
-
Theatre, E
-
Deffontaine, V
-
Rahmouni, S
-
Charloteaux, B
-
visa fler...
-
Crins, F
-
Docampo, E
-
Elansary, M
-
Gori, AS
-
Lecut, C
-
Mariman, R
-
Mni, M
-
Oury, C
-
Altukhov, I
-
Alexeev, D
-
Aulchenko, Y
-
Amininejad, L
-
Bouma, G
-
Hoentjen, F
-
Lowenberg, M
-
Oldenburg, B
-
Pierik, MJ
-
vander Meulen-de ...
-
van der Woude, C ...
-
Visschedijk, MC
-
Lathrop, M
-
Hugot, JP
-
Weersma, RK
-
De Vos, M
-
Franchimont, D
-
Vermeire, S
-
Kubo, M
-
Louis, E
-
Georges, M
-
Abraham, C
-
Achkar, JP
-
Ahmad, T
-
Ananthakrishnan, ...
-
Andersen, V
-
Anderson, CA
-
Andrews, JM
-
Annese, V
-
Aumais, G
-
Baidoo, L
-
Baldassano, RN
-
Bampton, PA
-
Barclay, M
-
Barrett, JC
-
Bayless, TM
-
Bethge, J
-
Bitton, A
-
Boucher, G
-
Brand, S
-
Brandt, B
-
Brant, SR
-
Buning, C
-
Chew, A
-
Halfvarson, Jona ...
-
Cleynen, I
-
Cohain, A
-
Croft, A
-
Daly, MJ
-
D'Amato, M
-
Danese, S
-
De Jong, D
-
Denapiene, G
-
Denson, LA
-
Devaney, KL
-
Dewit, O
-
D'Inca, R
-
Dubinsky, M
-
Duerr, RH
-
Edwards, C
-
Ellinghaus, D
-
Essers, J
-
Ferguson, LR
-
Festen, EA
-
Fleshner, P
-
Florin, T
-
Franke, A
-
Fransen, K
-
Gearry, R
-
Gieger, C
-
Glas, J
-
Goyette, P
-
Green, T
-
Griffiths, AM
-
Guthery, SL
-
Hakonarson, H
-
Halfvarson, J
-
Hanigan, K
-
Haritunians, T
-
Hart, A
-
Hawkey, C
-
Hayward, NK
-
Hedl, M
-
Henderson, P
-
Hu, XH
-
Huang, HL
-
Hui, KY
-
Imielinski, M
-
Ippoliti, A
-
Jonaitis, L
-
Jostins, L
-
Karlsen, TH
-
Kennedy, NA
-
Khan, MA
-
Kiudelis, G
-
Krishnaprasad, K
-
Kugathasan, S
-
Kupcinskas, L
-
Latiano, A
-
Laukens, D
-
Lawrance, IC
-
Lee, JC
-
Lees, CW
-
Leja, M
-
Van Limbergen, J
-
Lionetti, P
-
Liu, JZ
-
Mahy, G
-
Mansfield, J
-
Massey, D
-
Mathew, CG
-
McGovern, DPB
-
Milgrom, R
-
Mitrovic, M
-
Montgomery, GW
-
Mowat, C
-
Newman, W
-
Ng, A
-
Ng, SC
-
Ng, SME
-
Nikolaus, S
-
Ning, K
-
Nothen, M
-
Oikonomou, I
-
Palmieri, O
-
Parkes, M
-
Phillips, A
-
Ponsioen, CY
-
Potocnik, U
-
Prescott, NJ
-
Proctor, DD
-
Radford-Smith, G
-
Rahier, JF
-
Raychaudhuri, S
-
Regueiro, M
-
Rieder, F
-
Rioux, JD
-
Ripke, S
-
Roberts, R
-
Russell, RK
-
Sanderson, JD
-
Sans, M
-
Satsangi, J
-
Schadt, EE
-
Schreiber, S
-
Schulte, D
-
Schumm, LP
-
Scott, R
-
Seielstad, M
-
Sharma, Y
-
Silverberg, MS
-
Simms, LA
-
Skieceviciene, J
-
Spain, SL
-
Steinhart, AH
-
Stempak, JM
-
Stronati, L
-
Sventoraityte, J
-
Targan, SR
-
Taylor, KM
-
ter Velde, A
-
Torkvist, L
-
Tremelling, M
-
van Sommeren, S
-
Vasiliauskas, E
-
Verspaget, HW
-
Walters, T
-
Wang, K
-
Wang, MH
-
Wei, Z
-
Whiteman, D
-
Wijmenga, C
-
Wilson, DC
-
Winkelmann, J
-
Xavier, RJ
-
Zhang, B
-
Zhang, CK
-
Zhang, H
-
Zhang, W
-
Zhao, HY
-
Zhao, ZZ
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature communica ...
- Av lärosätet
-
Karolinska Institutet
-
Örebro universitet