SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:147605521"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:147605521" > Genome-wide associa...

  • Reus, LM (författare)

Genome-wide association study of frontotemporal dementia identifies a C9ORF72 haplotype with a median of 12-G4C2 repeats that predisposes to pathological repeat expansions

  • Artikel/kapitelEngelska2021

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2021-09-02
  • Springer Science and Business Media LLC,2021

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:prod.swepub.kib.ki.se:147605521
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:147605521URI
  • https://doi.org/10.1038/s41398-021-01577-3DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Genetic factors play a major role in frontotemporal dementia (FTD). The majority of FTD cannot be genetically explained yet and it is likely that there are still FTD risk loci to be discovered. Common variants have been identified with genome-wide association studies (GWAS), but these studies have not systematically searched for rare variants. To identify rare and new common variant FTD risk loci and provide more insight into the heritability of C9ORF72-related FTD, we performed a GWAS consisting of 354 FTD patients (including and excluding N = 28 pathological repeat carriers) and 4209 control subjects. The Haplotype Reference Consortium was used as reference panel, allowing for the imputation of rare genetic variants. Two rare genetic variants nearby C9ORF72 were strongly associated with FTD in the discovery (rs147211831: OR = 4.8, P = 9.2 × 10−9, rs117204439: OR = 4.9, P = 6.0 × 10−9) and replication analysis (P < 1.1 × 10−3). These variants also significantly associated with amyotrophic lateral sclerosis in a publicly available dataset. Using haplotype analyses in 1200 individuals, we showed that these variants tag a sub-haplotype of the founder haplotype of the repeat expansion that was previously found to be present in virtually all pathological C9ORF72 G4C2 repeat lengths. This new risk haplotype was 10 times more likely to contain a C9ORF72 pathological repeat length compared to founder haplotypes without one of the two risk variants (~22% versus ~2%; P = 7.70 × 10−58). In haplotypes without a pathologic expansion, the founder risk haplotype had a higher number of repeats (median = 12 repeats) compared to the founder haplotype without the risk variants (median = 8 repeats) (P = 2.05 × 10−260). In conclusion, the identified risk haplotype, which is carried by ~4% of all individuals, is a major risk factor for pathological repeat lengths of C9ORF72 G4C2. These findings strongly indicate that longer C9ORF72 repeats are unstable and more likely to convert to germline pathological C9ORF72 repeat expansions.

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Jansen, IE (författare)
  • Mol, MO (författare)
  • van Ruissen, F (författare)
  • van Rooij, J (författare)
  • van Schoor, NM (författare)
  • Tesi, N (författare)
  • Reinders, MJT (författare)
  • Huisman, MA (författare)
  • Holstege, H (författare)
  • Visser, PJ (författare)
  • de Boer, SCM (författare)
  • Hulsman, M (författare)
  • Ahmad, S (författare)
  • Amin, N (författare)
  • Uitterlinden, AG (författare)
  • Ikram, A (författare)
  • van Duijn, CM (författare)
  • Seelaar, H (författare)
  • Ramakers, IHGB (författare)
  • Verhey, FRJ (författare)
  • van der Lugt, A (författare)
  • Claassen, JAHR (författare)
  • Biessels, GJ (författare)
  • De Deyn, PP (författare)
  • Scheltens, P (författare)
  • van der Flier, WM (författare)
  • van Swieten, JC (författare)
  • Pijnenburg, YAL (författare)
  • van der Lee, SJ (författare)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Translational psychiatry: Springer Science and Business Media LLC11:1, s. 451-2158-3188

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy