Sökning: onr:"swepub:oai:research.chalmers.se:3b57172f-6dec-4c1d-8228-e97a6cd2e5c9" >
A consensus yeast m...
A consensus yeast metabolic network reconstruction obtained from a community approach to systems biology
-
Herrgård, Markus J (författare)
-
Swainston, Neil (författare)
-
Dobson, Paul (författare)
-
visa fler...
-
Dunn, Warwick B (författare)
-
Arga, K Yalçin (författare)
-
Arvas, Mikko (författare)
-
Blüthgen, Nils (författare)
-
Borger, Simon (författare)
-
Coestenoble, Roeland (författare)
-
Heinemann, Matthias (författare)
-
Hucka, Michael (författare)
-
Le Novère, Nicolas (författare)
-
Li, Peter (författare)
-
Liebermeister, Wolfram (författare)
-
Mo, Monica L (författare)
-
Oliveira, Ana Paula (författare)
-
- Petranovic Nielsen, Dina, 1975 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
Pettifer, Stephen (författare)
-
Simeonidis, Evangelos (författare)
-
Smallbone, Kieran (författare)
-
Spasić, Irena (författare)
-
Weichart, Dieter (författare)
-
Brent, Roger (författare)
-
Broomhead, David S (författare)
-
Westerhoff, Hans W (författare)
-
Kırdar, Betül (författare)
-
Penttilä, Merja (författare)
-
Klipp, Edda (författare)
-
Palsson, Bernhard Ø (författare)
-
Sauer, Uwe (författare)
-
Oliver, Stephen G (författare)
-
Mendes, Pedro (författare)
-
- Nielsen, Jens B, 1962 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
Kell, Douglas B (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2008
- 2008
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Biotechnology. ; 26:10, s. 1155-1160
- Relaterad länk:
-
https://research.cha...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Genomic data allow the large-scale manual or semi-automated assembly of metabolic network reconstructions, which provide highly curated organism-specific knowledge bases. Although several genome-scale network reconstructions describe Saccharomyces cerevisiae metabolism, they differ in scope and content, and use different terminologies to describe the same chemical entities. This make comparisons between them difficult and underscores the desirability of a consolidated metabolic network that collects and formalizes the 'community knowledge' of yeast metabolism. We describe how we have produced a consensus metabolic network reconstruction for S. cerevisiae. In drafting it, we placed special emphasis on referencing molecules to persistent databases or using database-independent forms, such as SMILES or InChl strings, as this permits their chemical structure to be represented unambiguously and in a manner that permits automated reasoning. The reconstruction is readily available via a publicly accessible database and in the Systems Biology Markup Language (http://www.comp-sys-bio.org/yeastnet). It can be maintained as a resource that serves as a common denominator for studying the systems biology of yeast. Similar strategies should benefit communities studying genome-scale metabolic networks of other organisms.
Ämnesord
- TEKNIK OCH TEKNOLOGIER -- Industriell bioteknik (hsv//swe)
- ENGINEERING AND TECHNOLOGY -- Industrial Biotechnology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Herrgård, Markus ...
-
Swainston, Neil
-
Dobson, Paul
-
Dunn, Warwick B
-
Arga, K Yalçin
-
Arvas, Mikko
-
visa fler...
-
Blüthgen, Nils
-
Borger, Simon
-
Coestenoble, Roe ...
-
Heinemann, Matth ...
-
Hucka, Michael
-
Le Novère, Nicol ...
-
Li, Peter
-
Liebermeister, W ...
-
Mo, Monica L
-
Oliveira, Ana Pa ...
-
Petranovic Niels ...
-
Pettifer, Stephe ...
-
Simeonidis, Evan ...
-
Smallbone, Kiera ...
-
Spasić, Irena
-
Weichart, Dieter
-
Brent, Roger
-
Broomhead, David ...
-
Westerhoff, Hans ...
-
Kırdar, Betül
-
Penttilä, Merja
-
Klipp, Edda
-
Palsson, Bernhar ...
-
Sauer, Uwe
-
Oliver, Stephen ...
-
Mendes, Pedro
-
Nielsen, Jens B, ...
-
Kell, Douglas B
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- TEKNIK OCH TEKNOLOGIER
-
TEKNIK OCH TEKNO ...
-
och Industriell biot ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
- Artiklar i publikationen
- Nature Biotechno ...
- Av lärosätet
-
Chalmers tekniska högskola