| 1. |
- Abdellah, Tebani, et al.
(author)
-
Integration of molecular profiles in a longitudinal wellness profiling cohort.
- 2020
-
In: Nature communications. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2041-1723. ; 11:1
-
Journal article (peer-reviewed)abstract
- An important aspect of precision medicine is to probe the stability in molecular profiles among healthy individuals over time. Here, we sample a longitudinal wellness cohort with 100 healthy individuals and analyze blood molecular profiles including proteomics, transcriptomics, lipidomics, metabolomics, autoantibodies andimmune cell profiling, complementedwith gut microbiota composition and routine clinical chemistry. Overall, our results show high variation between individuals across different molecular readouts, while the intra-individual baseline variation is low. The analyses show that each individual has a unique and stable plasma protein profile throughout the study period and that many individuals also show distinct profiles with regards to the other omics datasets, with strong underlying connections between the blood proteome and the clinical chemistry parameters. In conclusion, the results support an individual-based definition of health and show that comprehensive omics profiling in a longitudinal manner is a path forward for precision medicine.
|
|
| 2. |
|
|
| 3. |
|
|
| 4. |
- Egesten, Arne, et al.
(author)
-
The proinflammatory CXC-chemokines GRO-α/CXCL1 and MIG/CXCL9 are concomitantly expressed in ulcerative colitis and decrease during treatment with topical corticosteroids
- 2007
-
In: International Journal of Colorectal Disease. - : Springer Science and Business Media LLC. - 0179-1958 .- 1432-1262. ; 22:12, s. 1421-1427
-
Journal article (peer-reviewed)abstract
- Background Ulcerative colitis is characterized by relapsing mucosal inflammation where the lesions include tissue-damaging granulocytes. In addition, T cells and natural killer (NK) cells play important pathophysiologic roles. Chemokines are a large family of peptides that play key roles in the regulation of inflammation. The CXC-chemokines, growth-related oncogene (GRO)-α/CXCL1 and interleukin (IL)-8/CXCL8, both recruit neutrophils and possess mitogenic properties, whereas the interferon-dependent CXC-chemokines monokine induced by gamma-interferon (MIG)/CXCL9, interferon-γ inducible protein of 10 kD/CXCL10, and IFN-inducible T cell alpha chemoattractant/CXCL11 recruit and activate T cells and NK cells. Materials and methods The expression of CXC-chemokines was studied in eight controls and in 11 patients suffering from ulcerative colitis in the distal part of the colon, before and during topical treatment with corticosteroids. Perfusates (obtained before, after 7 days, and after 28 days of treatment) and pinch biopsies (obtained before and after 28 days of treatment) were collected by colonoscopy. The rectal release of GRO-α and MIG was determined by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), and tissue expression of the chemokines was detected in colonic tissue by immunohistochemistry. Results In perfusates, high levels of GRO-α, IL-8, and MIG were detected compared with controls (p = 0.02, 0.005, and p = 0.03, respectively). During treatment with corticosteroids, both GRO-α and MIG decreased. In clinical nonresponders, characterized by sustained inflammation, the levels of GRO-α and MIG remained elevated. Both epithelial cells and granulocytes, present in the submucosa, expressed GRO-α and MIG as detected by immunohistochemistry. Conclusions CXC-chemokines are likely to be important in the pathophysiology of ulcerative colitis and may become targets for novel treatment strategies. In addition, GRO-α may serve as a marker of disease activity.
|
|
| 5. |
- Gustavsson, Anders, 1950-, et al.
(author)
-
Utrymme för att tänka nytt : En uppföljning av 89 projekt om autism och adhd
- 2010
-
Reports (other academic/artistic)abstract
- Den här rapporten är en uppföljning av sammanlagt 89 projekt, som under perioden 1993 till 2006, fått anslag genom Allmänna Arvsfonden. Till denna målgrupp brukar räknas autism och autismliknande tillstånd (Asperger och Tourettes syndrom) samt adhd (Attention-Deficit/Hyperactivity disorder) och damp (Decificits in Attention, Motor control and Perception). Totalt har cirka 150 miljoner kronor beviljats till de projekt som omfattas av uppföljningen. Syftet med uppföljningen har varit att undersöka vilka spår som lämnats av de projekt om autism och autismliknande tillstånd, samt adhd och damp, som Arvsfonden beviljat medel för under perioden, samt att ge en orientering om de tidigare viktigaste projekten, som Arvsfonden finansierat, inom området. Ett syfte har också varit att fördjupa förståelsen av hur Arvsfondens satsningar omsätts i verksamhetsutveckling och vilken betydelse detta har haft på utvecklingen inom området. Uppföljningen har gjorts med hjälp av flera undersökningsmetoder, av såväl kvalitativt som kvantitativt slag, i syfte att belysa projekten från olika perspektiv och att ge kunskap som kan ligga till grund för en diskussion om projektens betydelse för målgrupperna. Studien har genomförts i två steg –, dels som en kartläggning och översikt, och dels som en fördjupad fallstudie av två föreningar/organisationer samt av och fem enskilda projekt. Arbetet inleddes med en genomgång av det skriftliga material kring projekten, som fanns tillgängligt på Arvsfonden, främst ansökningshandlingar, redovisningar och slutrapporter. Materialet kategoriserades med utgångspunkt från att få en bred bild av projektens syfte och inriktning, men också för att hitta aspekter och intressanta projekt för de fördjupade fallbeskrivningarna. Den innehållsliga kategoriseringen resulterade i följande kategorier: metodutvecklingsprojekt, informations- och kunskapsspridningsprojekt, kunskapsutvecklingsprojekt, projekt inriktade på aktivitet och socialt gemenskapsinriktade projekt samt kultur- och demokratiprojekt. Mot bakgrund av den inledande kategoriseringen sammanställdes en enkät med frågor till ansvariga för samtliga 89 projekt. Efter flera påminnelser fick vi svar från 55 av 89 projektansvariga, några mer än ett halvår efter utsatt datum. Med utgångspunkt i enkäter och dokument kunde vi ge en översiktlig bild ges av projektens verksamhet och betydelse, vilka spår de lämnat och under vilka betingelser de verkat, även i de fall vi inte fick svar. Resultatet av översiktsstudien låg också till grund för urvalet av de projekt och organisationer som valdes ut för den fördjupade fallstudien. I ett andra steg studerades enskilda projekt och organisationer med hjälp av besök, intervjuer, observationer samt fördjupade studier av den skriftliga dokumentation som fanns samlad om projekten. Analyserna av de enskilda fallen har resulterat i en beskrivning och analys av projekten på olika nivåer. För det första har vi beskrivit, dels som en beskrivning av projektens verksamhet och mål, vilka spår projekten lämnat, vilka faktorer som underlättat respektive försvårat projektets genomförande. För det andra har vi analyserat projekten i relation till teoretiska perspektiv. Den sammanställning som gjorts visar att av de granskade 89 projekten har vi underlag för att kategorisera spår i 80 projekt, varav sex bedöms leva vidare med annan finansiering, där projektets erfarenheter fått en spridning, nationellt och/eller internationellt och i vissa fall utvecklats i nya former och inspirerat till andra verksamheter. Men i de flesta projekt lever dock erfarenheterna vidare, en del med annan finansiering och andra på annat sätt, även om de inte fått så stor spridning. Några projekt har runnit ut i sanden, där finns inga spår och man har av olika skäl, inte lyckats genomföra sin plan. Ett projekts framgång kan också ta sig väldigt olika uttryck; ibland blir framgången inte synlig i ett enskilt projekt utan först när man ser på hur det samverkar med andra. Ett intressant fynd i studien är att Allmänna arvsfondens innovationsmål tycks fungera i välfärdssamhällen av vår typ, där det ofta redan existerar en sorts stöd eller service till den målgrupp som projektet riktar sig till. En konsekvens blir att det innovativa ofta får karaktären av opposition mot något existerande, t.ex. en behandlingsform, en form av verksamheter som vänder sig till personer med en viss funktionsnedsättning eller en viss form av organisering av sådana verksamheter. Projekten blir ofta ett sorts motprojekt, i relation till etablerade perspektiv och synsätt De ideella föreningarna har med hjälp av projekten spritt en ny syn på såväl autism och autismliknande tillstånd som adhd. Här kan man se den ideella sektorn och det civila samhället som en frizon för nytänkande, som växer fram bland människor med egen erfarenhet Utrymme för att tänka nytt 6 av vad det innebär att leva med funktionsnedsättningen. I hög grad har projekten gett röst åt människor med egen erfarenhet av diagnoserna. Genom att projekten har fört människor med likartade erfarenheter samman har de också fått ett slags ökad, kollektiv makt över sina livssituationer. Allmänna arvsfondens projektstöd tycks vara ett viktigt bränsle för denna typ av nytänkande.
|
|
| 6. |
|
|
| 7. |
|
|
| 8. |
- Lood, Christian, et al.
(author)
-
C1q inhibits immune complex-induced interferon-alpha production in plasmacytoid dendritic cells : a novel link between C1q deficiency and systemic lupus erythematosus pathogenesis
- 2009
-
In: Arthritis and Rheumatism. - : Wiley. - 0004-3591 .- 1529-0131. ; 60:10, s. 3081-3090
-
Journal article (peer-reviewed)abstract
- OBJECTIVE: C1q deficiency is the strongest risk factor known for the development of systemic lupus erythematosus (SLE), since almost all humans with a genetic deficiency of C1q develop this disease. Low C1q serum concentration is also a typical finding in SLE during flares, emphasizing the involvement of C1q in SLE pathogenesis. Recent studies have revealed that C1q has a regulatory effect on Toll-like receptor-induced cytokine production. Therefore, we undertook this study to investigate whether C1q could regulate production of interferon-alpha (IFNalpha). METHODS: Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) and plasmacytoid dendritic cells (PDCs) were stimulated with 3 known interferogenic stimuli and cultured with physiologic concentrations of C1q. IFNalpha production was determined by an immunoassay. RESULTS: C1q significantly inhibited PBMC IFNalpha production induced by RNA-containing immune complexes (ICs), herpes simplex virus (HSV), and CpG DNA. C1q also inhibited PDC IFNalpha production induced by ICs and CpG DNA but increased PDC IFNalpha production induced by HSV. The regulatory role of C1q was not specific for IFNalpha but was also seen for interleukin-6 (IL-6), IL-8, and tumor necrosis factor alpha. We demonstrated binding of C1q to PDCs both by surface plasmon resonance interaction analysis and by flow cytometry, and we also demonstrated intracellular detection of 2 C1q binding proteins. CONCLUSION: Our findings contribute to the understanding of why C1q deficiency is such a strong risk factor for SLE and suggest an explanation for the up-regulation of the type I IFN system seen in SLE patients.
|
|
| 9. |
- Lood, Christian, et al.
(author)
-
IgG glycan hydrolysis by endoglycosidase S diminishes the proinflammatory properties of immune complexes from patients with systemic lupus erythematosus: A possible new treatment?
- 2012
-
In: Arthritis and Rheumatism. - : Wiley. - 1529-0131 .- 0004-3591. ; 64:8, s. 2698-2706
-
Journal article (peer-reviewed)abstract
- Objective Systemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune disease with chronic or episodic inflammation in several organ systems, related to the presence of circulating and tissue-deposited immune complexes (ICs) that stimulate leukocytes through Fc? receptors (Fc?R) with subsequent inflammation. Treatment with endoglycosidase S (EndoS), an IgG glycanhydrolyzing bacterial enzyme from Streptococcus pyogenes, has shown beneficial effects in several experimental animal models of chronic inflammatory disease. This study was undertaken to investigate whether EndoS affects the proinflammatory properties of ICs and has the potential to be developed as a therapy for SLE. Methods ICs purified from SLE patients or RNA-containing ICs formed in vitro were treated with EndoS and used in several assays reflecting different important features of SLE pathogenesis, such as phagocytosis by polymorphonuclear cells (PMNs) and plasmacytoid dendritic cells (PDCs), complement activation, and interferon-a (IFNa) production by PDCs. Results EndoS treatment abolished all proinflammatory properties of the ICs investigated. This included Fc?R-mediated phagocytosis by PDCs (P = 0.001) and subsequent production of IFNa (P = 0.002), IC-induced classical pathway of complement activation (P = 0.008), chemotaxis, and oxidative burst activity of PMNs (P = 0.002). EndoS treatment also had a direct effect on the molecular structure of ICs, causing decreased IC size and glycosylation. Conclusion Our findings indicate that EndoS treatment has prominent effects on several pathogenetically important IC-mediated events, and suggest that EndoS has the potential to be developed as a novel therapy for SLE.
|
|
| 10. |
- Lood, Christian, et al.
(author)
-
IgG glycan hydrolysis by EndoS diminishes the pro-inflammatory properties of immune complexes from patients with SLE : a possible new treatment?
- 2012
-
In: Arthritis and Rheumatism. - : Wiley. - 0004-3591 .- 1529-0131. ; 64:8, s. 2698-2706
-
Journal article (peer-reviewed)abstract
- OBJECTIVESystemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune disease with chronic or episodic inflammation in several organ systems, related to the presence of circulating and tissue-deposited immune complexes (ICs) which stimulate leukocytes through FcγRs with subsequent inflammation. Treatment with EndoS, an IgG glycan hydrolyzing bacterial enzyme from Streptococcus pyogenes, has shown beneficial effects in several experimental animal models of chronic inflammatory disease. In the present study we asked if EndoS could affect pro-inflammatory properties of ICs and have the potential to be developed as a therapy in SLE.METHODSICs, purified from SLE patients or RNA-containing ICs formed in vitro, were treated with EndoS and used in several assays reflecting different important parts of SLE pathogenesis such as phagocytosis by polymorphonuclear neutrophils (PMNs) and plasmacytoid dendritic cells (pDCs), complement activation and IFNα production by pDCs.RESULTSOur results demonstrate that EndoS treatment could abolish all pro-inflammatory properties of ICs investigated. This includes FcγR-mediated phagocytosis by pDCs (p<0.0001) and subsequent production of IFNα (p<0.0001), IC-induced classical complement pathway activation (p<0.0001), chemotaxis and oxidative burst activity of PMNs (p=0.002). We could also demonstrate direct effects on the molecular structure of ICs after EndoS treatment with decreased size and glycosylation patterns.CONCLUSIONSProminent effects of EndoS treatment were seen in several pathogenetically important IC-mediated events and our data suggest that EndoS have the potential to be developed as a novel therapy in SLE.
|
|
