SwePub
Sök i SwePub databas

  Utökad sökning

Träfflista för sökning "WFRF:(Karlsson Karin) "

Sökning: WFRF:(Karlsson Karin)

  • Resultat 1-50 av 954
Sortera/gruppera träfflistan
   
NumreringReferensOmslagsbildHitta
1.
  •  
2.
  •  
3.
  •  
4.
  • Ammenberg, Jonas, et al. (författare)
  • Biogas Research Center, BRC : Slutrapport för etapp 1
  • 2015
  • Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
    • Biogas Research Center (BRC) är ett kompetenscentrum för biogasforskning som finansieras av Energimyndigheten, LiU och ett flertal externa organisationer med en tredjedel vardera. BRC har en mycket bred tvärvetenskaplig inriktning och sammanför biogasrelaterad kompetens från flera olika områden för att skapa interaktion på flera olika plan:mellan näringsliv, akademi och samhälle,mellan olika perspektiv, samtmellan olika discipliner och kompetensområden.BRC:s vision är:Resurseffektiva biogaslösningar finns genomförda i många nya tillämpningar och bidrar till en mer hållbar energiförsörjning, förbättrat miljötillstånd och goda affärer.BRC:s särskilda roll för att uppnå denna vision är att bidra med kunskapsförsörjning och process-/teknikutveckling för att facilitera utveckling, innovation och implementering av biogaslösningar. Resurseffektivitet är ett nyckelord, vilket handlar om att förbättra befintliga processer och system samt utveckla biogaslösningar i nya sektorer och möjliggöra användning av nya substrat.For BRC:s etapp 1, den första tvåårsperioden mellan 2012-2014, var forskningsprojekten organiserade enligt tabellen nedan. Den visar viktiga utmaningar för biogasproducenter och andra intressenter, samt hur dessa ”angreps” med åtta forskningsprojekt. Fem av projekten var av explorativ karaktär i bemärkelsen att de var bredare och mer framtidsorienterade - exempelvis utvärderade flera möjliga tekniska utvecklingsmöjligheter (EP1-5). Tre projekt hade ett tydligare fokus på teknik- och processutveckling (DP6-8).I den här slutrapporten ges en kortfattad bakgrundsbeskrivning och det finns en introduktion till vad den här typen av kompetenscentrum innebär generellt. Därefter finns mer detaljerad information om BRC, exempelvis gäller det centrumets etablering, relevans, vision, hörnstenar och utveckling. De deltagande organisationerna presenteras, både forskargrupperna vid Linköpings universitet och partners och medlemmar. Vidare finns en mer utförlig introduktion till och beskrivning av utmaningarna i tabellen och kortfattat information om forskningsprojekten, följt av ett kapitel som berör måluppfyllelse och den externa utvärdering som gjorts av BRC:s verksamhet. Detaljerad, listad information finns till stor del i bilagorna.Kortfattat kan det konstateras att måluppfyllelsen överlag är god. Det är speciellt positivt att så många vetenskapliga artiklar publicerats (eller är på gång att publiceras) kopplat till forskningsprojekten och även i det vidare centrumperspektivet. Helt klart förekommer en omfattande verksamhet inom och kopplat till BRC. I etapp 2 är det viktigt att öka andelen mycket nöjda partner och medlemmar, där nu hälften är nöjda och hälften mycket nöjda. Det handlar framför allt om stärkt kommunikation, interaktion och projektledning. Under 2015 förväntas åtminstone två doktorsexamina, där avhandlingarna har stor koppling till forskningen inom etapp 1.I början på år 2014 skedde en extern utvärdering av verksamheten vid BRC med huvudsyftet att bedöma hur väl centrumet lyckats med etableringen samt att granska om det fanns förutsättningar för framtida framgångsrik verksamhet. Generellt var utfallet mycket positivt och utvärderarna konstaterade att BRC på kort tid lyckats etablera en verksamhet som fungerar väl och engagerar det stora flertalet deltagande aktörer, inom relevanta områden och där de flesta involverade ser BRC som en befogad och väl fungerande satsning, som de har för avsikt att även fortsättningsvis stödja. Utvärderingen bidrog också med flera relevant tips och till att belysa utmaningar.Utöver denna slutrapport finns separata publikationer från forskningsprojekten.Arbetet som presenteras i rapporten har finansierats av Energimyndigheten och de medverkande organisationerna.
  •  
5.
  • Arver, Brita, et al. (författare)
  • Bilateral Prophylactic Mastectomy in Swedish Women at High Risk of Breast Cancer: A National Survey.
  • 2011
  • Ingår i: Annals of surgery. - : Lippincott Williams and Wilkins; 1999. - 1528-1140 .- 0003-4932. ; 253:6, s. 1147-1154
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • BACKGROUND/OBJECTIVE:: This study attempted a national inventory of all bilateral prophylactic mastectomies performed in Sweden between 1995 and 2005 in high-risk women without a previous breast malignancy. The primary aim was to investigate the breast cancer incidence after surgery. Secondary aims were to describe the preoperative risk assessment, operation techniques, complications, histopathological findings, and regional differences. METHODS:: Geneticists, oncologists and surgeons performing prophylactic breast surgery were asked to identify all women eligible for inclusion in their region. The medical records were reviewed in each region and the data were analyzed centrally. The BOADICEA risk assessment model was used to calculate the number of expected/prevented breast cancers during the follow-up period. RESULTS:: A total of 223 women operated on in 8 hospitals were identified. During a mean follow-up of 6.6 years, no primary breast cancer was observed compared with 12 expected cases. However, 1 woman succumbed 9 years post mastectomy to widespread adenocarcinoma of uncertain origin. Median age at operation was 40 years. A total of 58% were BRCA1/2 mutation carriers. All but 3 women underwent breast reconstruction, 208 with implants and 12 with autologous tissue. Four small, unifocal, invasive cancers and 4 ductal carcinoma in situ were found in the mastectomy specimens. The incidence of nonbreast related complications was low (3%). Implant loss due to infection/necrosis occurred in 21 women (10%) but a majority received a new implant later. In total, 64% of the women underwent at least 1unanticipated secondary operation. CONCLUSIONS:: Bilateral prophylactic mastectomy is safe and efficacious in reducing future breast cancer in asymptomatic women at high risk. Unanticipated reoperations are common. Given the small number of patients centralization seems justified.
  •  
6.
  • Assenhöj, Maria, et al. (författare)
  • Protein interaction, monocyte toxicity and immunogenic properties of cerium oxide crystals with 5% or 14% gadolinium, cobalt oxide and iron oxide nanoparticles–an interdisciplinary approach
  • 2021
  • Ingår i: Nanotoxicology. - : Taylor and Francis Ltd.. - 1743-5390 .- 1743-5404. ; 15:8, s. 1035-1038
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • Metal oxide nanoparticles are widely used in both consumer products and medical applications, but the knowledge regarding exposure-related health effects is limited. However, it is challenging to investigate nanoparticle interaction processes with biological systems. The overall aim of this project was to improve the possibility to predict exposure-related health effects of metal oxide nanoparticles through interdisciplinary collaboration by combining workflows from the pharmaceutical industry, nanomaterial sciences, and occupational medicine. Specific aims were to investigate nanoparticle-protein interactions and possible adverse immune reactions. Four different metal oxide nanoparticles; CeOx nanocrystals with 5% or 14% Gd, Co3O4, and Fe2O3, were characterized by dynamic light scattering and high-resolution transmission electron microscopy. Nanoparticle-binding proteins were identified and screened for HLA-binding peptides in silico. Monocyte interaction with nanoparticle–protein complexes was assessed in vitro. Herein, for the first time, immunogenic properties of nanoparticle-binding proteins have been characterized. The present study indicates that especially Co3O4-protein complexes can induce both ‘danger signals’, verified by the production of inflammatory cytokines and simultaneously bind autologous proteins, which can be presented as immunogenic epitopes by MHC class II. The clinical relevance of these findings should be further evaluated to investigate the role of metal oxide nanoparticles in the development of autoimmune disease. The general workflow identified experimental difficulties, such as nanoparticle aggregate formation and a lack of protein-free buffers suitable for particle characterization, protein analyses, as well as for cell studies. This confirms the importance of future interdisciplinary collaborations. © 2021 The Author(s). 
  •  
7.
  •  
8.
  •  
9.
  • Björklund, Karin, 1979, et al. (författare)
  • Hydrodynamic modelling of the influence of stormwater and combined sewer overflows on receiving water quality: Benzo(a)pyrene and copper risks to recreational water
  • 2018
  • Ingår i: Journal of Environmental Management. - : Elsevier BV. - 0301-4797 .- 1095-8630. ; 207, s. 32-42
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • The risk from chemical substances in surface waters is often increased during wet weather, due to surface runoff, combined sewer overflows (CSOs) and erosion of contaminated land. There are strong incentives to improve the quality of surface waters affected by human activities, not only from ecotoxicity and ecosystem health perspectives, but also for drinking water and recreational purposes. The aim of this study is to investigate the influence of urban stormwater discharges and CSOs on receiving water in the context of chemical health risks and recreational water quality. Transport of copper (Cu) and benzo[a]pyrene (BaP) in the Göta River (Sweden) was simulated using a hydrodynamic model. Within the 16 km modelled section, 35 CSO and 16 urban stormwater point discharges, as well as the effluent from a major wastewater treatment plant, were included. Pollutant concentrations in the river were simulated for two rain events and investigated at 13 suggested bathing sites. The simulations indicate that water quality guideline values for Cu are exceeded at several sites, and that stormwater discharges generally give rise to higher Cu and BaP concentrations than CSOs. Due to the location of point discharges and the river current inhibiting lateral mixing, the north shore of the river is better suited for bathing. Peak concentrations have a short duration; increased concentrations of the pollutants may however be present for several days after a rain event. Monitoring of river water quality indicates that simulated Cu and BaP concentrations are in the same order of magnitude as measured concentrations. It is concluded that hydrodynamic modelling is a useful tool for identifying suitable bathing sites in urban surface waters and areas of concern where mitigation measures should be implemented to improve water quality.
  •  
10.
  • Bohlin, I, et al. (författare)
  • Mapping potential location for bilberry picking with remote sensing, local field data andphone application
  • 2023
  • Konferensbidrag (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
    • The aim of the study was to create a practical method for identifying potential locations for bilberry picking with help of remote sensing, local field data and phone application to support the development of the local berry value chain. Local field data w as collected 2021 and 2022 and consisted 503 and 525 plots from a study area of circa 25x45km in Västerbotten, Sweden. The potential for bilberry production was evaluated by measuring the shrub cover and amount of raw berries. Wall to wall remote sensing d ata included a Sentinel 2 image from same summer, airborne laser scanning data from 2020 and other map products. We created classification models for bilberry shrub and yield using both logistic regression (2 classes) and ordinal regression (3 classes) mod els using 2021 data, and validated and calibrated models with 2022 data. Predictor variables consisted of spectral metrics from satellite data; structural metrics from laser data; existing raster maps of tree species, stand attributes, site index, soil moi sture and land use classes. The 2 class models performed better than three class models, delivering the AUC 0.73, overall accuracy 0.83 and kappa value 0.51 for best bilberry shrub model and 0.75, 0.77 and 0.50 respectively for best bilberry yield model. T he best models included both laser based structural metrics describing e.g canopy closure and spectral metrics, but also e.g. volume of pine, soil moisture and site index were found significant predictor variables. Calibration of the models improved annual predictions and the validation of the 2021 raster maps with 2022 data produced similar AUC, OA, and kappa values for bilberry yield (0.73, 0.74 and 0.46), but lower for bilberry shrub (0.61, 0.68 and 0.24). A dedicated phone application was developed duri ng the project, which was used both for collecting the field data and for presenting the potential locations of berry yields. Local berry maps can help berry pickers easier to find the berries in forest landscape and therefore support local berry value cha in. This study is part of the FAIRCHAIN project, which has received funding from the European Union’s funding programme H2020 research and innovation programme under grand agreement 101000723.
  •  
11.
  •  
12.
  • Bondelind, Mia, 1980, et al. (författare)
  • Hydrodynamic modelling of traffic-related microplastics discharged with stormwater into the Göta River in Sweden
  • 2020
  • Ingår i: Environmental Science and Pollution Research. - : Springer Science and Business Media LLC. - 0944-1344 .- 1614-7499. ; 27:19, s. 24218-24230
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • Microplastics (MP) are transported from land-based sources from rivers to marine waters. However, there is currently little knowledge about MP fate from land sources to marine waters. Traffic is estimated to be one of the largest sources of MP; hence, stormwater is expected to be an important transportation route of MP to marine waters. The aim of this study was to investigate the effect of the size and density of tyre wear particles in road run-off on their fate in the Gota River in Sweden using hydrodynamic modelling. The model of the stretch of Gota River, Sweden's largest river, passing through Gothenburg (Sweden's second largest city) and out to the sea, was set up using MIKE 3 FM software. Literature data were used to define the MP characteristics: concentrations in stormwater, prevalent particle sizes, density of MP commonly occurring in road run-off and settling velocities. Results show that higher concentrations of MP are found on the south side of the river, compared with the north side, due to higher annual average daily traffic loads along the south side of the river. The mixing processes in the river and the MP concentrations were generally influenced by the vertical water density gradient caused by saline water from the Kattegat strait. While most MP with higher density and larger size settle in the river, smaller MP with density close to 1.0 g/cm(3) do not settle in the river and therefore reach the Kattegat strait and the marine environments. Further research is needed to describe the fate and transport of microplastics in the stormwater system, including treatment facilities, i.e. biofouling, aggregation, degradation and/or further fragmentation and settling.
  •  
13.
  • Bondelind, Mia, 1980, et al. (författare)
  • Influence of stormwater and CSOs on copper and benzo[a]pyrene in receiving waters – hydrodynamic modelling approach
  • 2017
  • Ingår i: Conference Proceedings, 14th IWA/IAHR International Conference on Urban Drainage, September 10-15, 2017, Prague, Czech Republic. ; , s. 540-543
  • Konferensbidrag (refereegranskat)abstract
    • In this study the influence of urban stormwater discharges and combined sewer overflows on receiving water was investigated in the context of chemical risks and recreational water quality. Transport of copper and benzo[a]pyrene in the Göta River, running through the city of Gothenburg (Sweden), was simulated using a hydrodynamic model. The modelling results showed that during rain events the water quality along the river deteriorates for different periods of time, at times exceeding the guideline values established by the city of Gothenburg. The model can be used as an effective tool to prognosticate the water quality in the river.
  •  
14.
  • Bäckman, Karin, et al. (författare)
  • Vårdens alltför svåra val? : kartläggning av prioriteringsarbete och analys av riksdagens principer och riktlinjer för prioriteringar i hälso- och sjukvården
  • 2007
  • Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
    • PrioriteringsCentrum har på uppdrag av Socialstyrelsen genomfört en kartläggning av på vilket sätt hälso- och sjukvårdens huvudmän och andra centrala aktörer arbetar med prioriteringar och har utvärderat hur detta arbete överensstämmer med intentionerna i riksdagens beslut om prioriteringar. Vi har även analyserat innehållet i och tillämpningen av riksdagens riktlinjer för prioriteringar i hälso- och sjukvården. Det har skett genom en etisk analys och mot bakgrund av ett stort antal intervjuer i landsting och kommuner samt med representanter för statliga myndigheter och yrkesorganisationer och med ledning av vad som framkommit i tidigare uppföljningar. Vi föreslår i rapporten ett anta förändringar och förtydliganden av riktlinjerna.Vi kan konstatera att sättet att arbeta med prioriteringar i landsting och kommuner inte är helt olikt det som gällde när Prioriteringsdelegationen redovisade en motsvarande uppföljning år 2001. Fortfarande finns knappast några öppna beslut om fördelning och prioritering av resurser om man med öppenhet avser att beslutsfattaren medvetet överväger flera alternativ och att grunderna för besluten är kända för dem som önskar ta del av dem.I situationer då tillgängliga resurser inte befinner sig i paritet med  önskvärda ambitioner får sjukvårdspersonalen ta det största ansvaret för att besluta om och genomföra ransonering av vården. Förutom på chefsnivå tycks dock sjukvårdpersonal fortfarande i liten utsträckning vara medveten om de etiska principer som enligt riksdagsbeslutet ska styra prioriteringar i vården. Få känner till den etiska plattformen med de tre etiska principerna. Lokala mallar eller styrdokument för prioriteringar är ovanliga. Det saknas nödvändiga förutsättningar för att tillämpa riksdagens prioriteringsbeslut och det finns inte heller några tydliga strategier för hur man vill skapa sådana förutsättningar inom landstingen.Den kommunala vård- och omsorgsverksamheten upplever sig fortfarande i ringa utsträckning berörd av den etiska plattformen och prioriteringsprinciperna. Någon gemensam prioritering mellan huvudmännen sker knappast alls.Medborgarna är i mycket liten utsträckning involverade i prioriteringsarbetet. Den ökade öppenheten gentemot brukare innebär oftast att viss information om prioriteringar sker genom traditionella kanaler som patientorganisationer, pensionärsråd och handikappråd och synpunkter inhämtas via allmänna patientenkäter medan klagomål hanteras genom patientnämnder.Vi har också funnit tydliga skillnader när det gäller hur arbetet med prioriteringar bedrivs idag jämfört med för sex år sedan. Genom Socialstyrelsen och Läkemedelsförmånsnämnden har staten tagit  ledningen när det gäller att visa hur prioriteringar kan göras på ett systematiskt och öppet sätt. Detta arbete har resulterat i en tydlig metodutveckling. Idag finns det dessutom flera exempel på konkret utvecklingsarbete och samverkan mellan huvudmän kring det vidare begreppet kunskapsstyrd vård till vilket systematiska prioriteringar är starkt relaterat. Vi kan också notera olika initiativ till vertikala prioriteringar i verksamheten där det framförallt är läkarkåren som engagerat sig; men också enstaka försök med systematiska politiska prioriteringar. Det finns dessutom flera lovande utvecklingsprojekt rörande prioriteringar som initierats av och drivs av sjukvårdspersonal både lokalt och nationellt. Yrkesförbunden är också mer aktiva idag när det gäller att sprida kunskap om prioriteringar....
  •  
15.
  • Cutts, Briony, 1976, et al. (författare)
  • Nf1 deficiency cooperates with oncogenic K-RAS to induce acute myeloid leukemia in mice.
  • 2009
  • Ingår i: Blood. - : American Society of Hematology. - 1528-0020 .- 0006-4971. ; 114:17, s. 3629-32
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • Hyperactive RAS signaling is caused by mutations in RAS genes or a deficiency of the neurofibromatosis gene (NF1) and is common in myeloid malignancies. In mice, expression of oncogenic K-RAS or inactivation of Nf1 in hematopoietic cells results in myeloproliferative disorders (MPDs) that do not progress to acute myeloid leukemia (AML). Because NF1 is a RAS-GTPase-activating protein it has been proposed that NF1 deficiency is functionally equivalent to an oncogenic RAS. It is not clear, however, whether Nf1 deficiency would be redundant in K-RAS-induced MPD development or whether the 2 mutations would cooperate in leukemogenesis. Here, we show that the simultaneous inactivation of Nf1 and expression of K-RAS(G12D) in mouse hematopoietic cells results in AML that was fatal in primary mice within 4 weeks and transplantable to sublethally irradiated secondary recipients. The data point to a strong cooperation between Nf1 deficiency and oncogenic K-RAS.
  •  
16.
  • de Peppo, Giuseppe Maria, et al. (författare)
  • Osteogenic response of human mesenchymal stem cells to well-defined nanoscale topography in vitro
  • 2014
  • Ingår i: International Journal of Nanomedicine. - 1176-9114 .- 1178-2013. ; 9:1, s. 2499-2515
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • Background: Patterning medical devices at the nanoscale level enables the manipulation of cell behavior and tissue regeneration, with topographic features recognized as playing a significant role inthe osseointegration of implantable devices. Methods: In this study, we assessed the ability of titanium-coated hemisphere-like topographic nanostructures of different sizes (approximately 50, 100, and 200 nm) to influence the morphology, proliferation, and osteogenic differentiation of human mesenchymal stem cells (hMSCs). Results: We found that the proliferation and osteogenicdifferentiation of hMSCs was influenced by the size of the underlying structures, suggesting that size variations in topographic features at the nanoscale level, independently of chemistry, can be exploited to control hMSC behavior in a size-dependent fashion. Conclusion: Our studies demonstrate that colloidal lithography, in combination with coating technologies, can be exploited to investigate the cell response to well defined nanoscale topography and to develop next-generation surfaces that guide tissue regeneration and promote implant integration.
  •  
17.
  • Falck, Eva, et al. (författare)
  • Loss of Glutathione peroxidase 3 expression is correlated with epigenetic mechanisms in endometrial adenocarcinoma
  • 2010
  • Ingår i: Cancer Cell International. - : BioMed Central (BMC). - 1475-2867. ; 10
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • Glutathione peroxidase 3 (GPX3) is one of the key enzymes in the cellular defense against oxidative stress and the hepatocyte growth factor receptor, (MET) has been suggested to be influenced by the GPX3 gene expression. In a previous microarray study performed by our group, Gpx3 was identified as a potential biomarker for rat endometrial adenocarcinoma (EAC), since the expression was highly downregulated in rat EAC tumors. Herein, we have investigated the mRNA expression and Gpx3 and Met in rat EAC by real time quantitative PCR (qPCR), and the methylation status of Gpx3. In addition we have examined the expression of GPX3 and MET in 30 human EACs of different FIGO grades and 20 benign endometrial tissues. We found that the expression of GPX3 was uniformly down regulated in both rat and human EAC, regardless of tumor grade or histopathological subtype, implying that the down-regulation is an early event in EAC. The rate of Gpx3 promoter methylation reaches 91%, where biallelic methylation was present in 90% of the methylated tumors. The expression of the Met oncogene was slightly upregulated in EACs that showed loss of expression of Gpx3, but no tumor suppressor activity of Gpx3/GPX3 was detected. Preliminary results also suggest that the production of H2O2 is higher in rat endometrial tumors with down-regulated Gpx3 expression. A likely consequence of loss of GPX3 protein function would be a higher amount of ROS in the cancer cell environment. Thus, the results suggest important clinical implications of the GPX3 expression in EAC, both as a molecular biomarker for EAC and as a potential target for therapeutic interventions.
  •  
18.
  • Fornander, Liselott, 1981- (författare)
  • How we talk : aspects of communication and team cognition of trauma resuscitation teams
  • 2024
  • Doktorsavhandling (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
    • A trauma team consists of professionals assembling in an ad hoc manner to resuscitate a patient with life-threatening injuries. In such a team, how the team manages to use non-technical skills, such as communication is important to achieve task management and decision making.  Communication is practised in simulations, and the simulation environment has also been used in research to understand teamwork processes. This thesis is based on video observations of trauma teams working in real life (IRL) and in situ simulations of trauma resuscitations. The aim was to assess the creation of team cognition IRL and in simulation, to analyse verbal communication in the teams and the effects of real-time communication on team structure. In Study I, a grounded theory analysis was undertaken to understand how verbal and non-verbal interactions create team cognition. The analysis resulted in a theory pointing to “split vision” as a team’s ability to alter process modes between team positioning and sensitivity to the patient that was dependent on patient and situational values absorbed from team members’ implicit actions. In Study II, the verbal response modes taxonomy was applied to analyse both the grammatical and pragmatic meaning of verbal interactions that were compared between team roles. In the six most communicative team roles in the context of IRL trauma teamwork, pure mode communication dominated the way of delivering messages. In Study III, the structures of four IRL and four simulated trauma teams were analysed using a social network analysis of real-time communication. Overall, the teams were highly centralised, with the examining physician functioning as an information hub. In Study IV, communication from the same teams was categorised according to information and task management, as well as different coordination behaviours. We compared the IRL and simulation domains based on the proportions of utterances of each category/code, and found that “Give information after request” and closed-loop communication were more prevalent in simulation. Observing real-time communications using different methodologies gave a perspective on the conditions and possibilities for adaptation in terms of work prescriptions and team training, such as room for more communication and possible congestions of nodes in terms of occupancy and tacit communications and working modes thus far unnoticed by us and unreported. Such understanding complements established knowledge about coordination behaviours and interactive team cognition and should be taken into consideration in the practise and training of trauma teams.  
  •  
19.
  • Forsman, Huamei, et al. (författare)
  • Galectin 3 Aggravates Joint Inflammation and Destruction in Antigen-Induced Arthritis
  • 2011
  • Ingår i: ARTHRITIS AND RHEUMATISM. - : John Wiley and Sons, Ltd. - 0004-3591 .- 1529-0131. ; 63:2, s. 445-454
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • Objective. Galectin 3, an endogenous beta galactoside-binding lectin, plays an important role in the modulation of immune responses. The finding that galectin 3 is present in the inflamed synovium in patients with rheumatoid arthritis suggests that the protein is associated with the pathogenesis of this disease. We undertook this study to investigate the influence of galectin 3 deficiency in a murine model of arthritis. Methods. Wild-type (WT) and galectin 3-deficient (galectin 3(-/-)) mice were subjected to antigen-induced arthritis (AIA) through immunization with methylated bovine serum albumin. The concentration of serum cytokines (interleukin-6 [IL-6] and tumor necrosis factor alpha [TNF alpha]) and antigen-specific antibodies was evaluated using a cytometric bead array platform and enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Cellular IL-17 responses were examined by flow cytometry, ELISA, and enzyme-linked immunospot assay. Results. The joint inflammation and bone erosion of AIA were markedly suppressed in galectin 3(-/-) mice as compared with WT mice. The reduced arthritis in galectin 3(-/-) mice was accompanied by decreased levels of antigen-specific IgG and proinflammatory cytokines. The frequency of IL-17-producing cells in the spleen was reduced in galectin 3(-/-) mice as compared with WT mice. Exogenously added recombinant galectin 3 could partially restore the reduced arthritis and cytokines in galectin 3(-/-) mice. Conclusion. Our findings show that galectin 3 plays a pathogenic role in the development and progression of AIA and that the disease severity is accompanied by alterations of antigen-specific IgG levels, systemic levels of TNF alpha and IL-6, and frequency of IL-17-producing T cells. To our knowledge, this is the first report of in vivo evidence that galectin 3 plays a crucial role in the development of arthritis.
  •  
20.
  • Forsman, Huamei, et al. (författare)
  • Reactivation of Desensitized Formyl Peptide Receptors by Platelet Activating Factor: A Novel Receptor Cross Talk Mechanism Regulating Neutrophil Superoxide Anion Production
  • 2013
  • Ingår i: Plos One. - : Public Library of Science (PLoS). - 1932-6203. ; 8:3
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • Neutrophils express different chemoattractant receptors of importance for guiding the cells from the blood stream to sites of inflammation. These receptors communicate with one another, a cross talk manifested as hierarchical, heterologous receptor desensitization. We describe a new receptor cross talk mechanism, by which desensitized formyl peptide receptors (FPRdes) can be reactivated. FPR desensitization is induced through binding of specific FPR agonists and is reached after a short period of active signaling. The mechanism that transfers the receptor to a non-signaling desensitized state is not known, and a signaling pathway has so far not been described, that transfers FPRdes back to an active signaling state. The reactivation signal was generated by PAF stimulation of its receptor (PAFR) and the cross talk was uni-directional. LatrunculinA, an inhibitor of actin polymerization, induced a similar reactivation of FPRdes as PAF while the phosphatase inhibitor CalyculinA inhibited reactivation, suggesting a role for the actin cytoskeleton in receptor desensitization and reactivation. The activated PAFR could, however, reactivate FPRdes also when the cytoskeleton was disrupted prior to activation. The receptor cross talk model presented prophesies that the contact on the inner leaflet of the plasma membrane that blocks signaling between the G-protein and the FPR is not a point of no return; the receptor cross-talk from the PAFRs to the FPRdes initiates an actin-independent signaling pathway that turns desensitized receptors back to a signaling state. This represents a novel mechanism for amplification of neutrophil production of reactive oxygen species.
  •  
21.
  • Forsman, Huamei, et al. (författare)
  • The beta-galactoside binding immunomodulatory lectin galectin-3 reverses the desensitized state induced in neutrophils by the chemotactic peptide f-Met-Leu-Phe: role of reactive oxygen species generated by the NADPH-oxidase and inactivation of the agonist
  • 2008
  • Ingår i: Glycobiology. - : Oxford University Press (OUP). - 1460-2423 .- 0959-6658. ; 18:11, s. 905-12
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • Neutrophils interacting with a chemoattractant gradually become nonresponsive to further stimulation by the same agonist, a process known as desensitization. Receptor desensitization is a highly regulated process that involves different mechanisms depending on which receptor-ligand pair that is studied. Galectin-3, a member of a large family of beta-galactoside-binding lectins, has been suggested to be a regulator of the inflammatory process, augmenting or directly triggering the neutrophil functional repertoire. We show here that the desensitized state of neutrophils interacting with the chemotactic peptide fMLF is broken by galectin-3 and that this is achieved through an oxygen radical-mediated inactivation of the chemoattractant. The effect was inhibited by the competitor lactose and required the affinity of galectin-3 for N-acetyllactosamine, a saccharide typically found on cell surface glycoproteins. The latter was shown using a galectin-3 mutant that lacked N-acetyllactosamine binding activity, and this protein was not active. The mechanism behind the inactivation of the chemoattractant was found to depend on the ability of galectin-3 to induce a neutrophil generation/secretion of reactive oxygen species which in combined action with myeloperoxidase inactivated the peptides.
  •  
22.
  • Fransson, Kristin, et al. (författare)
  • Miljöhandbokför upphandlare
  • 2015
  • Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
    • Hållbar utveckling innefattar såväl social, ekonomisk som miljömässig hållbar utveckling.I Miljöhandboken kommer dessa tre aspekter av hållbar utveckling att behandlas,dock ligger störst fokus på miljöaspekterna.Miljöhandboken ska hjälpa upphandlare att ställa relevanta miljökrav vid upphandlingoch är ett komplement till exempelvis Konkurrensverkets (f.d. Miljöstyrningsrådets)upphandlingskriterier och ska bidra med fakta kring hur miljökrav kan ställas.Miljökrav vid upphandling kan innefatta bl. a. energianvändning, livslängd, skadligaämnen, strålning, återvinning och miljöledningssystem. Kravens betydelse påverkasbl. a. av upphandlingens omfattning och miljömognaden inom produktsegmentet. Imiljöhandboken presenteras inga specifika kriterier eller gränsvärden för olika miljöaspekter,i stället ges länkar till exempelvis lagstiftning, myndigheter och miljömärkningar.Detta för att kriterier och gränsvärden uppdateras kontinuerligt som en följdav teknikutveckling men också för att den samlade kunskapen om vad som är miljöproblemständigt växer och kan ge upphov till nya kriterier och gränsvärden. Tyngdpunkteni denna handbok ligger på miljöpåverkan ur ett livscykelperspektiv, vilket innebäratt hänsyn tas till miljöpåverkan från utvinning av råmaterial till resthantering aven produkt.
  •  
23.
  • Fromell, Karin, et al. (författare)
  • Designed protein binders in combination with nanocrystalline diamond for use in high-sensitivity biosensors
  • 2012
  • Ingår i: Analytical and Bioanalytical Chemistry. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1618-2642 .- 1618-2650. ; 404:6-7, s. 1643-1651
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • A platform for diagnostic applications showing signal-to-noise ratios that by far surpass those of traditional bioanalytical test formats has been developed. It combines the properties of modified nanocrystalline diamond (NCD) surfaces and those of polyethylene oxide and polypropylene oxide based block copolymers for surface passivation and binder conjugation with a new class of synthetic binders for proteins. The NCD surfaces were fluorine-, hydrogen-, or oxygen-terminated prior to further biofunctionalization and the surface composition was characterized by X-ray photoelectron spectroscopy. In a proof of principle demonstration targeting the C-reactive protein, an ELISA carried out using an F-terminated diamond surface showed a signal-to-noise ratio of 3,900 which compares well to the signal-to-noise of 89 obtained in an antibody-based ELISA on a polystyrene microtiter plate, a standard test format used in most life science laboratories today. The increase in signal-to-noise ratio is to a large extent the result of extremely efficient passivation of the diamond surface. The results suggest that significant improvements can be obtained in standardized test formats using new materials in combination with new types of chemical coatings and receptor molecules.
  •  
24.
  • Gunnarsson, Rebeqa, et al. (författare)
  • Array-based genomic screening at diagnosis and during follow-up in chronic lymphocytic leukemia
  • 2011
  • Ingår i: Haematologica. - : Ferrata Storti Foundation (Haematologica). - 1592-8721 .- 0390-6078. ; 96:8, s. 1161-1169
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • Background High-resolution genomic microarrays enable simultaneous detection of copy-number aberrations such as the known recurrent aberrations in chronic lymphocytic leukemia [del(11q), del(13q), del(17p) and trisomy 12], and copy-number neutral loss of heterozygosity. Moreover, comparison of genomic profiles from sequential patients' samples allows detection of clonal evolution. Design and Methods We screened samples from 369 patients with newly diagnosed chronic lymphocytic leukemia from a population-based cohort using 250K single nucleotide polymorphism-arrays. Clonal evolution was evaluated in 59 follow-up samples obtained after 5-9 years. Results At diagnosis, copy-number aberrations were identified in 90% of patients; 70% carried known recurrent alterations, including del(13q) (55%), trisomy 12 (10.5%), del(11q) (10%), and del(17p) (4%). Additional recurrent aberrations were detected on chromosomes 2 (1.9%), 4 (1.4%), 8 (1.6%) and 14 (1.6%). Thirteen patients (3.5%) displayed recurrent copy-number neutral loss of heterozygosity on 13q, of whom 11 had concurrent homozygous del(13q). Genomic complexity and large 13q deletions correlated with inferior outcome, while the former was linked to poor-prognostic aberrations. In the follow-up study, clonal evolution developed in 8/24 (33%) patients with unmutated IGHV, and in 4/25 (16%) IGHV-mutated and treated patients. In contrast, untreated patients with mutated IGHV (n=10) did not acquire additional aberrations. The most common secondary event, del(13q), was detected in 6/12 (50%) of all patients with acquired alterations. Interestingly, aberrations on, for example, chromosome 6q, 8p, 9p and 10q developed exclusively in patients with unmutated IGHV. Conclusions Whole-genome screening revealed a high frequency of genomic aberrations in newly diagnosed chronic lymphocytic leukemia. Clonal evolution was associated with other markers of aggressive disease and commonly included the known recurrent aberrations.
  •  
25.
  • Hansen, Karin, et al. (författare)
  • Trender i kvävenedfall över Sverige 1955-2011
  • 2013
  • Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
    • Kvävenedfallet har stor betydning för försurning och övergödning. Uppdraget har finansierats av Naturvårdsverket, med syfte att förbättra underlaget för att följa upp miljökvalitetsmålet Bara naturlig försurning . En ny, unik databas har etablerats, med de flesta mätningar som har skett i Sverige av nederbördsmängder och -kemi på öppet fält från 1955 och fram till idag. Beräkningar av nedfallet av oorganiskt kväve (NO3- + NH4+) med nederbörden (våtdepositionen) vid de sammanlagt 362 mätplatserna visar att nedfallet är högre i hela Sverige idag än när mätningarna startade 1955. Data visar en stor variation i kvävenedfallet mellan mätplatser och år, vilket gör det svårt att detektera statistiskt signifikanta förändringar över tid. Nedfallet av kväve med nederbörden till Sverige ökade signifikant under 20-årsperioden 1970-1989 i sydvästra Sverige, men inte i sydöstra eller norra Sverige. Under 20-årsperioden 1990-2009 skedde ingen förändring av nedfallet i norra eller sydvästra Sverige, men i sydöstra Sverige minskade nedfallet av olika kväveformer med nederbörden signifikant. Parallellt har kvävenedfallet uppskattats med MATCH-modellen med två olika simuleringar. Den ena simuleringen (TRENDMATCH) har använt indata från observerad meteorologi tillsammans med emissioner bestämda inom EMEP-programmet medan den andra (KLIMATMATCH) använder meteorologi från en klimatmodell och emissioner sammanställt för RCP4.5. Den med TRENDMATCH modellerade depositionen visar nedåtgående trender för såväl NO3- som NH4+ från 1990 till 2009 i alla regioner. Resultaten från KLIMATMATCH visar inte lika tydliga trender för NH4+, beroende på att de historiska emissionerna i RCP4.5 databasen både visar upp- och nedåtgående trender för perioden. Trender i kvävenedfall beräknade med MATCH-modellen är till mycket stor del styrda av trender i de emissioner som används av spridningsmodellen. Det kan finnas flera orsaker till att vi inte ser tydliga trender i kvävenedfallet under de senaste decennierna. Trendanalyser kräver data med långa tidsserier, vilket av olika orsaker ofta saknas. Om kvävenedfallet har förändrats, men förändringen är liten, så är det svårt eller omöjligt att urskilja detta ur de stora slumpmässiga mellanårsvariationerna. Det är också möjligt att nedfallet inte har förändrats, trots minskande emissioner i Europa, på grund av ändrade atmosfärskemiska förhållanden (t ex klimat och minskande svavelemissioner), eller om utsläppen av kväve från källor som är av vikt för Sverige inte har minskat i samma utsträckning som emissionerna för Europa som helhet har. Det är också svårt att uppskatta kväveemissioner, vilket i rapporten illustreras av de två emissionsuppskattningar som har använts, där den ena rapporterar minskande emissioner av ammoniak och den andra ökande. För att uppnå precision och statistiskt kunna säkerställa förhållandevis små förändringar i kvävenedfallet, i storleksordningen 20 procent under en period av 20 år, behövs mätningar vid ett stort antal platser runt om i landet. Vi föreslår en genomgång av hur de framtida mätningarna av kvävenedfallet, som utgör basen för övervakningen, bör utformas. En viktig punkt är att existerande stationer med långa tidsserier bör bevaras, något som kräver långsiktig finansiering.
  •  
26.
  •  
27.
  •  
28.
  •  
29.
  • Henriksson, Karin, et al. (författare)
  • A pilot study of facial, cranial and brain MRI morphometry in men with schizophrenia: Part 2.
  • 2006
  • Ingår i: Psychiatry Research. - : Elsevier BV. - 1872-7123 .- 0925-4927 .- 0165-1781. ; 147:2-3, s. 187-195
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • This pilot study applies a new 3D morphometric MR method to test the hypothesis that men with schizophrenia (vs. controls) have deviant facial shapes and landmark relations in cranio/facialibrain (CFB) regions. This constitutes Part 2 of paired articles in this issue of Psychiatry Research: Neuroimaging, in which Part 1 presents the new method in detail. MRI coordinates from CFB landmarks of 23 patients and 15 controls were identified and then aligned with the Procrustes model, leaving shape as the only unitless geometrical information. Men with schizophrenia had significantly longer mid- and lower-facial heights, and greater lower (left) facial depth, with a tendency toward rotation along the facial midline. This supports findings from earlier anthropometric and 3D studies of the "exterior" (face). In contrast, none of the patient-control differences for the new "interior" (cranial-brain) distances reached statistical significance. These results need to be retested on a larger sample of both sexes. (c) 2006 Elsevier Ireland Ltd. All rights reserved.
  •  
30.
  • Karlsson, Christina, et al. (författare)
  • Tissue microarray validation : a methodologic study with special reference to lung cancer
  • 2009
  • Ingår i: Cancer Epidemiology, Biomarkers and Prevention. - : American Association for Cancer Research. - 1055-9965 .- 1538-7755. ; 18:7, s. 2014-2021
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • BACKGROUND: Although tissue microarray (TMA) studies of histopathologic material have been frequently reported in studies of malignant diseases, the question of sample size (i.e., the diameter and the number of tissue cylinders investigated) has been rarely discussed. This study addresses the methodologic question of sample size in a variety of tumor types.MATERIAL AND METHODS: Material from 29 cases of lung carcinoma (small cell, squamous cell, and adenocarcinomas) was examined immunohistochemically for Ki-67 and p53 expression in virtually constructed cylinders of different diameters. The influence of tissue sample size (i.e., different numbers of virtual cylinders) was also investigated. Results from Ki-67 evaluation were analyzed as a continuous variable, whereas p53 expression was scored. p53 evaluations based on scoring in cylinders versus scoring of whole sections were also compared. Furthermore, 10 cases of endometrial and breast carcinomas were evaluated for estrogen receptor, Ki-67, and HER2 by scoring up to five cylinders.RESULTS AND CONCLUSIONS: Tissue cylinders of 0.6 and 1.0 mm diameters were compared and found equally informative about Ki-67 expression (intraclass correlation, 0.96). A statistical approach considering intraindividual and interindividual variation data is presented, indicating that in this specific setting three cylinders per case is an adequate sample size for TMA studies. Further sampling yields only a small gain in accuracy as determined by Ki-67 quantification and p53 scoring (kappa-coefficient, 0.9). For endometrial and breast tissues, TMA scoring of three cylinders yielded excellent agreement (kappa, >0.75) compared with whole-section scoring.
  •  
31.
  • Karlsson, Eva, et al. (författare)
  • Aspects of Self and Identity in Narrations About Recent Events : Communication With Individuals With Alzheimer's Disease Enabled by a Digital Photograph Diary
  • 2017
  • Ingår i: Journal of Gerontological Nursing. - : SLACK. - 0098-9134 .- 1938-243X. ; 43:6, s. 25-31
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • The ability to narrate autobiographical memories is important for maintaining the identity of individuals with Alzheimer's disease (AD). The current study explored how the sense of self is manifested in narrations about recent events, enabled via a digital photograph diary. Use of a digital photograph diary was tested with seven individuals with AD and their household members. Narrative analysis was used to analyze audiorecordings of the pairs' communication about recent events shown in the photographs. The results show how individuals with AD understand events illustrated in recent photographs in relation to their sense of self and associated skills and abilities that are facets of their selfhood. This type of digital photograph diary has the potential to support individuals with AD to maintain their sense of self and participation in everyday life, and strengthen their relationships with household members; it could be an important tool in person-centered care.
  •  
32.
  • Karlsson, Eva, et al. (författare)
  • "Carpe Diem" : Supporting conversations between individuals with dementia and their family members
  • 2014
  • Ingår i: Journal of Gerontological Nursing. - : SLACK, Inc.. - 0098-9134 .- 1938-243X. ; 40:2, s. 38-46
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • Remembrance of recent events is a major problem for individuals with dementia. Consequently, this article explores the process of acceptance and integration of a digital photograph diary (DPD) as a tool for remembrance of and conversations about daily life events. A design for multiple case studies was used. Seven couples, in which one individual in the couple had Alzheimer's disease, tested the DPD for 6 months. Data were collected in three sequences with interviews, observations, and screening instruments. In the analysis, all data were integrated to find common patterns of content. Some couples became regular users, while others used the DPD more sporadically. Factors contributing to regular use were how the DPD matched expectations, actual use, support, experienced usefulness, and reactions from family and friends. For those couples who became regular users, the DPD facilitated their conversation about recent daily activities
  •  
33.
  • Karlsson, Eva, et al. (författare)
  • Stories about life narrated by people with Alzheimer's disease
  • 2014
  • Ingår i: Journal of Advanced Nursing. - : Wiley. - 0309-2402 .- 1365-2648. ; 70:12, s. 2791-2799
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • AimTo explore how people with Alzheimer's disease present their life story.BackgroundLife story work is a key concept in a person-centred care. An important aspect in understanding the subjective experience and supporting the identity of people with dementia is to listen to their life stories.DesignA narrative design with interviews was used.MethodNine participants with Alzheimer's disease were encouraged to tell about their lives from childhood, adult life, to present life and about their thoughts on the future. The interviews were conducted between September 2010–March 2011 in the participants' homes, with their spouses present and were analysed with a method for analysis of narratives.FindingsContentment, Connectedness, Self-reliance and Personal growth were identified as core dimensions in the participants' life stories and shown like threads throughout life, from childhood, adult life to present life. All participants expressed an overall contentment with life, and connectedness was related to their relation with significant persons and to be included in the local community. Self-reliance was expressed as a strong confidence in the own ability and an overall curiosity throughout life as a sustained quest for personal growth.ConclusionsIt is important for healthcare professionals, who work with people with dementia, to understand that people with Alzheimer's disease can maintain an overall trusting and hopeful approach to life. It is also important to use life story work to enhance feelings of being connected to the world and thereby support their identity and sense of self.
  •  
34.
  •  
35.
  • Karlsson, Eva, et al. (författare)
  • The challenge of coming to terms with the use of a new digital assistive device : a case Study of two persons with mild dementia
  • 2011
  • Ingår i: Open Nursing Journal. - : Bentham Science Publishers Ltd.. - 1874-4346. ; 5, s. 102-110
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • There is an increased interest in supporting persons with dementia with technical services in daily life. The aim of this case study was to explore the complex issues involved in the process from a user driven development to the acceptance and usage of a new digital assistive device for persons with mild dementia. Even though it was developed in a user driven process and personalized to meet their individual needs they rarely used it. To deepening the understanding of this disparity between actual usage and perceived usefulness, the participants were studied whilst performing daily life activities through participant observations and interviews. Their partners were interviewed two years after the first observations to clarify the change in needs over time. The results show that the participant needs encompassed occupation, safety, social interaction, and memory support together with the receipt of general support. The overriding requirement for both participants was a need to maintain their self-image. When the digital assistive device did not correspond with the participants’ expectations or view of themselves, their interest in using it faded, since the digital assistive device failed to support their self-image. The acceptance of a digital assistive device by a person with dementia is a process that begins with identifying and personalizing the functions of the device according to individual needs, and then supporting the usage and the gradual integration of the device into daily life. During this process, the person’s selfimage must be taken into consideration and supported
  •  
36.
  • Karlsson, Karin, et al. (författare)
  • Sodium content in processed food items in Sweden compared to other countries : a cross-sectional multinational study
  • 2023
  • Ingår i: Frontiers In Public Health. - : Frontiers Media S.A.. - 2296-2565. ; 11
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • BackgroundDietary sodium has a dose-response relationship with cardiovascular disease, and sodium intake in Sweden exceeds national and international recommendations. Two thirds of dietary sodium intake comes from processed foods, and adults in Sweden eat more processed foods than any other European country. We hypothesized that sodium content in processed foods is higher in Sweden than in other countries. The aim of this study was to investigate sodium content in processed food items in Sweden, and how it differs from Australia, France, Hong Kong, South Africa, the United Kingdom and the United States. MethodsData were collected from retailers by trained research staff using standardized methods. Data were categorized into 10 food categories and compared using Kruskal-Wallis test of ranks. Sodium content in the food items was compared in mg sodium per 100 g of product, based on the nutritional content labels on the packages. ResultsCompared to other countries, Sweden had among the highest sodium content in the "dairy" and "convenience foods" categories, but among the lowest in "cereal and grain products," "seafood and seafood products" and "snack foods" categories. Australia had the overall lowest sodium content, and the US the overall highest. The highest sodium content in most analyzed countries was found in the "meat and meat products" category. The highest median sodium content in any category was found among "sauces, dips, spreads and dressings" in Hong Kong. ConclusionThe sodium content differed substantially between countries in all food categories, although contrary to our hypothesis, processed foods overall had lower sodium content in Sweden than in most other included countries. Sodium content in processed food was nonetheless high also in Sweden, and especially so in increasingly consumed food categories, such as "convenience foods".
  •  
37.
  • Karlsson, Per Erik, et al. (författare)
  • Luftföroreningar i Jämtlands län, Analys och lägesbeskrivning samt förslag till övervakningsprogram
  • 2009
  • Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
    • På uppdrag av Länsstyrelsen i Jämtlands län har IVL Svenska Miljöinstitutet AB tagit fram förslag till revision av Miljöövervakningsprogram för Jämtlands län vad gäller de delar som omfattar övervakning av deposition av svavel, kväve och tungmetaller samt halter av luftföroreningar i bakgrundsmiljö och tätort. En genomgång har gjorts av nuläge och tidsutveckling vad gäller halter och deposition. Två olika förslag till förändringar av luftövervakningsprogrammet har utformats för vardera tätortsmiljö och bakgrundsmiljö i enlighet med ”Riktlinjer för regionala miljöövervakningsprogram 2009-2014” samt med utgångspunkt från de krav som ställs i miljökvalitetsnormerna (MKN) och i Naturvårdsverkets MIKSA-utredning. Klimatet förändras i Jämtlands län. Modelleringar förutsäger att nederbördsmängderna i länet kommer att öka med den största ökningen i länets fjälltrakter. Observationerna för de senaste 15 åren visar en nederbördsökning främst för sommaren, medan det för övriga årstider varit oförändrat eller minskat. Totalt för året har dock nederbörden ökat i större delen av länet. Lufttemperaturerna kommer att öka i länets alla delar och under alla årstider. Resultaten av dessa klimatförändringar syns redan i länet i form av en tidigare start av växtsäsongen samt att trädgränsen i fjällen förflyttas mot högre höjder. Lufthalterna av svavel, nitrat- och ammoniumkväve samt sot i länet har sedan 1990 legat under 0,5 μg/m3, vilket är lågt jämfört med södra Sverige. Halterna har dessutom för de flesta av komponenterna minskat över tiden. Undantag är sot och partikelbundet ammonium, som under perioden legat relativt konstant eller i fallet sot möjligen ökat på senare tid. Ozonförekomsten inom länet är bland de lägsta i landet. Trots detta har det målvärde som enligt MKN inte bör överskridas till 2010, överskridits under två av de totalt tre år som mätningar med ozoninstrument pågått inom länet. De målvärden som anges i generations-perspektivet inom miljökvalitetsmålet Frisk Luft överskrids varje år inom länet, i likhet med alla övriga mätplatser inom landet. Halterna av tungmetaller har inom länet mätts i luft under endast ett år. Dock är lufthalterna av tungmetaller i luften över Jämtland sannolikt långt under de nedre tröskelvärden som anges inom MKN. Nedfallet av svavel till skogsekosystemen uppmätt under trädens kronor (krondropp) eller över öppet fält, är i länet avsevärt lägre jämfört med södra Sverige. Svavelnedfallet över Jämtland minskar över tiden, i synnerhet vid platser i skogslandet och vid trädgränsen vid fjällnära platser. Nedfallet av kväve som krondropp och över öppet fält i länet är i storleksordning 5-10 gånger lägre jämfört med södra Sverige. Nedfallet av nitratkväve över Jämtland minskar över tiden i skogslandet och medelhöga fjällnära platser, medan nedfallet av ammoniumkväve ökar. Det årliga sammanlagda nedfallet av oorganiskt kväve i nederbörden på hög höjd uppgår till över 2 kg N per hektar, vilket skulle kunna ha en viktig växtekologisk betydelse i kombination med klimatförändringarna. Det kan inte uteslutas att kvävenedfallet på nuvarande nivå kan påverka känsliga växtsamhällen på hög höjd. Ovanligt höga lufthalter av sot och ammoniumkväve och ovanligt hög deposition av ammoniumkväve uppmättes vid olika platser runt om i Jämtlands län under senvåren och sommaren 2006. En analys visar att detta till mycket stor del orsakades av omfattande bränder i Ryssland och kringliggande länder under april och maj 2006. Långväga transporterade luftföroreningar kan således på ett betydande sätt påverka luftkvaliteten i Jämtlands län. Den nuvarande luftövervakningen i bakgrundsluften i Jämtlands län får i stort anses vara relativt väl utformad i relation till luftföroreningsproblematiken inom länet. Det regionala delmålet för Jämtlands län anger att minst 99 % av antalet sjöar och 95 % av sträckan i vattendragen skall vara opåverkade av försurning. Tillsammans med det faktum att det sura nedfallet överskrider kritisk belastning vid en viss andel av skogsmarken i Jämtland, motiverar detta en fortsatt övervakning av nedfallet av försurande ämnen i nederbörd och krondropp på nuvarande nivå. Även om nedfallet av kväve till växtekosystemen för närvarande ligger på låga nivåer, motiverar kvävets potentiellt stora betydelse för växtsamhällenas sammansättning en fortsatt övervakning av kvävenedfallet. Förekomsten av partiklar, PM10, i bakgrundsluften i länet är dock dåligt känd. Från och med 1 januari, 2009 kommer Naturvårdsverket att starta upp mätningar av såväl PM2,5 och PM10 vid Bredkälen, vilket kommer att förbättra kännedomen om partiklarna i länets bakgrundsluft avsevärt. De längsta mätserierna avseende tätortsluft i länet är från mätningarna i Östersunds urbana bakgrund. Haltutvecklingen har, liksom i övriga landet, varit nedåtgående för såväl NO2, SO2 som bensen. Under 2007/08 var halten av NO2 10 μg/m3. För bensen var halten ca 1 μg/m3. Vinterhalvårsmedelvärdena för SO2 ligger under 1 μg/m3. Uppmätta halter av SO2 och NO2 i tätorter indikerar att det inte föreligger någon risk för överskridande av vare sig MKN eller övre utvärderingströskel (ÖUT) för årsmedelvärdet för dessa ämnen. Halter av PM10 i urban bakgrund under vinterhalvår har mätts i tre av länets kommuner under 2000-talet. Mätningarna indikerar att man på dessa platser ligger långt ifrån antalet tillåtna dygn som överskrider MKN, maximalt 10 jämfört med tillåtna 35. ÖUT överskrids dock i Östersund redan under en sexmånaders period i urban bakgrund. Sannolikheten att Ragunda och Strömsund också överskrider ÖUT i urban bakgrund är stor. Den nuvarande luftövervakningen i tätorter i Jämtlands län är begränsad till mätningar under vinterhalvår i Östersunds urbana bakgrund. Mätningar i gaturum samt under helt kalenderår, vilket föreskrivs enligt MKN, saknas helt. Enligt MIKSA-förslaget krävs i ett län med Jämtlands invånarantal endast en kontinuerlig mätstation. Om man endast har en mätstation ska denna vara placerad i gaturum enligt Naturvårdsverkets föreskrifter om kontroll av miljökvalitetsnormer för utomhusluft. För att få en så heltäckande bild som möjligt över luftkvaliteten i tätorter i Jämtlands län föreslås utökade mätningar i de i länet förekommande typorterna ”större stad” och ”landsbygdstätort” såväl i gaturum som i urban bakgrund av främst NO2, PM10 och bensen. Vi redovisar två olika förslag till luftövervakningsprogram för bakgrundsluft samt två förslag till luftövervakningsprogram för tätorter. Programmen är i huvudsak avsedda att pågå under perioden 2009-2014, men vissa delar kan behöva utvärderas under perioden. I rapporten redovisas två olika förslag på omfattningen av en regional luftövervakning i Jämtlands län vad gäller bakgrundsmiljö, en med ökad och en med minskad ambition jämfört med de mätningar som för närvarande bedrivs inom länet. Båda förslagen förutsätter att Naturvårdsverket under perioden fortsätter med sin luftövervakning i länet i sin nuvarande omfattning, inklusive utökade mätningar vid Bredkälen vad gäller partiklar och metaller. I förslaget med en ökad ambition för mätningar i bakgrundsmiljö föreslår vi att de kontinuerliga mätningarna av ozon med instrument utökas med ytterligare en plats som kan ge representativa mätningar för hög höjd i fjällvärlden. Vidare föreslår vi en utökning med depositionsmätningar över öppet fält i skogslandet inom Krondroppsnätet. För att förstå mekanismerna för kvävedeposition bl.a. med avseende på våt- och torrdeposition är det av stort värde att ha parallella mätningar av krondropp och mätningar över öppet fält vid samma plats. I förslaget med minskad ambition föreslår vi att mätningarna av krondropp och över öppet fält vid fjällnära platser inom Krondroppsnätet dras ner. För närvarande mäts krondropp på medelhög höjd vid tre platser medan mätningar över öppet fält bedrivs på två höjder vid vardera två platser. Vi föreslår att detta dras ner till mätningar av krondropp vid två platser på medelhög höjd samt en mätning över öppet fält på hög höjd. Att behålla en mätning av depositionen på hög höjd motiverar vi med att växtekosystemen på dessa höjder kan vara mycket känsliga för förändringar i kvävetillgången. När det gäller tätortsmiljö så redovisas förslag till luftmätningar inom de två tätortsklassificeringarna större stad och landsbygdstätort i Jämtlands län. I mätprogrammet anges antal mätstationer per föroreningsparameter samt rekommenderad tidsupplösning för mätningar i olika typer av tätorter. Två alternativ har angetts som bygger på det absolut lägsta antalet mätningar som krävs enligt MKN samt ett rekommenderat antal utifrån andra mervärden med mätningarna såsom att ha en mätstation i varje klassificeringsområde. Generellt gäller att det krävs en kontinuerlig mätstation, av de luftföroreningar som riskerar att överskrida ÖUT, i gaturum i länet, vilken förslagsvis läggs i den största tätorten, Östersund. Den huvudsakliga luftövervakningen i bakgrunds- och tätortsmiljön i länet bedrivs inom ramen för olika nationella nätverk såsom Krondroppsnätet, URBAN-nätet samt Nederbördskemiska nätet. Detta medför en god kvalitetssäkring av mätmetodik och datauppföljning samt att mätvärden lagras hos datavärdar.
  •  
38.
  • Karlsson, Per Erik, et al. (författare)
  • Luftföroreningari Jämtlands län : Analys och lägesbeskrivning samtförslag till övervakningsprogram
  • 2009
  • Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
    • SammanfattningPå uppdrag av Länsstyrelsen i Jämtlands län har IVL Svenska Miljöinstitutet AB tagit fram förslagtill revision av Miljöövervakningsprogram för Jämtlands län vad gäller de delar som omfattarövervakning av deposition av svavel, kväve och tungmetaller samt halter av luftföroreningar ibakgrundsmiljö och tätort. En genomgång har gjorts av nuläge och tidsutveckling vad gäller halteroch deposition. Två olika förslag till förändringar av luftövervakningsprogrammet har utformats förvardera tätortsmiljö och bakgrundsmiljö i enlighet med ”Riktlinjer för regionalamiljöövervakningsprogram 2009-2014” samt med utgångspunkt från de krav som ställs imiljökvalitetsnormerna (MKN) och i Naturvårdsverkets MIKSA-utredning.Klimatet förändras i Jämtlands län. Modelleringar förutsäger att nederbördsmängderna i länetkommer att öka med den största ökningen i länets fjälltrakter. Observationerna för de senaste 15åren visar en nederbördsökning främst för sommaren, medan det för övriga årstider varitoförändrat eller minskat. Totalt för året har dock nederbörden ökat i större delen av länet.Lufttemperaturerna kommer att öka i länets alla delar och under alla årstider. Resultaten av dessaklimatförändringar syns redan i länet i form av en tidigare start av växtsäsongen samt attträdgränsen i fjällen förflyttas mot högre höjder.Lufthalterna av svavel, nitrat- och ammoniumkväve samt sot i länet har sedan 1990 legat under 0,5μg/m3, vilket är lågt jämfört med södra Sverige. Halterna har dessutom för de flesta avkomponenterna minskat över tiden. Undantag är sot och partikelbundet ammonium, som underperioden legat relativt konstant eller i fallet sot möjligen ökat på senare tid. Ozonförekomsten inomlänet är bland de lägsta i landet. Trots detta har det målvärde som enligt MKN inte bör överskridastill 2010, överskridits under två av de totalt tre år som mätningar med ozoninstrument pågått inomlänet. De målvärden som anges i generations-perspektivet inom miljökvalitetsmåletFrisk Luftöverskrids varje år inom länet, i likhet med alla övriga mätplatser inom landet. Halterna avtungmetaller har inom länet mätts i luft under endast ett år. Dock är lufthalterna av tungmetaller iluften över Jämtland sannolikt långt under de nedre tröskelvärden som anges inom MKN.Nedfallet av svavel till skogsekosystemen uppmätt under trädens kronor (krondropp) eller överöppet fält, är i länet avsevärt lägre jämfört med södra Sverige. Svavelnedfallet över Jämtlandminskar över tiden, i synnerhet vid platser i skogslandet och vid trädgränsen vid fjällnära platser.Nedfallet av kväve som krondropp och över öppet fält i länet är i storleksordning 5-10 gånger lägrejämfört med södra Sverige. Nedfallet av nitratkväve över Jämtland minskar över tiden i skogslandetoch medelhöga fjällnära platser, medan nedfallet av ammoniumkväve ökar. Det årliga sammanlagdanedfallet av oorganiskt kväve i nederbörden på hög höjd uppgår till över 2 kg N per hektar, vilketskulle kunna ha en viktig växtekologisk betydelse i kombination med klimatförändringarna. Det kaninte uteslutas att kvävenedfallet på nuvarande nivå kan påverka känsliga växtsamhällen på hög höjd.Ovanligt höga lufthalter av sot och ammoniumkväve och ovanligt hög deposition avammoniumkväve uppmättes vid olika platser runt om i Jämtlands län under senvåren ochsommaren 2006. En analys visar att detta till mycket stor del orsakades av omfattande bränder iRyssland och kringliggande länder under april och maj 2006. Långväga transporteradeluftföroreningar kan således på ett betydande sätt påverka luftkvaliteten i Jämtlands län.Den nuvarande luftövervakningen i bakgrundsluften i Jämtlands län får i stort anses vara relativt välutformad i relation till luftföroreningsproblematiken inom länet. Det regionala delmålet förJämtlands län anger att minst 99 % av antalet sjöar och 95 % av sträckan i vattendragen skall varaopåverkade av försurning. Tillsammans med det faktum att det sura nedfallet överskrider kritiskbelastning vid en viss andel av skogsmarken i Jämtland, motiverar detta en fortsatt övervakning avnedfallet av försurande ämnen i nederbörd och krondropp på nuvarande nivå. Även om nedfalletav kväve till växtekosystemen för närvarande ligger på låga nivåer, motiverar kvävets potentielltstora betydelse för växtsamhällenas sammansättning en fortsatt övervakning av kvävenedfallet.Förekomsten av partiklar, PM10, i bakgrundsluften i länet är dock dåligt känd. Från och med 1januari, 2009 kommer Naturvårdsverket att starta upp mätningar av såväl PM2,5 och PM10 vidBredkälen, vilket kommer att förbättra kännedomen om partiklarna i länets bakgrundsluft avsevärt.De längsta mätserierna avseende tätortsluft i länet är från mätningarna i Östersunds urbanabakgrund. Haltutvecklingen har, liksom i övriga landet, varit nedåtgående för såväl NO2, SO2 sombensen. Under 2007/08 var halten av NO2 10 μg/m3. För bensen var halten ca 1 μg/m3.Vinterhalvårsmedelvärdena för SO2 ligger under 1 μg/m3. Uppmätta halter av SO2 och NO2 itätorter indikerar att det inte föreligger någon risk för överskridande av vare sig MKN eller övreutvärderingströskel (ÖUT) för årsmedelvärdet för dessa ämnen. Halter av PM10 i urban bakgrundunder vinterhalvår har mätts i tre av länets kommuner under 2000-talet. Mätningarna indikerar attman på dessa platser ligger långt ifrån antalet tillåtna dygn som överskrider MKN, maximalt 10jämfört med tillåtna 35. ÖUT överskrids dock i Östersund redan under en sexmånaders period iurban bakgrund. Sannolikheten att Ragunda och Strömsund också överskrider ÖUT i urbanbakgrund är stor.Den nuvarande luftövervakningen i tätorter i Jämtlands län är begränsad till mätningar undervinterhalvår i Östersunds urbana bakgrund. Mätningar i gaturum samt under helt kalenderår, vilketföreskrivs enligt MKN, saknas helt. Enligt MIKSA-förslaget krävs i ett län med Jämtlandsinvånarantal endast en kontinuerlig mätstation. Om man endast har en mätstation ska denna varaplacerad i gaturum enligt Naturvårdsverkets föreskrifter om kontroll av miljökvalitetsnormer förutomhusluft. För att få en så heltäckande bild som möjligt över luftkvaliteten i tätorter i Jämtlandslän föreslås utökade mätningar i de i länet förekommande typorterna ”större stad” och”landsbygdstätort” såväl i gaturum som i urban bakgrund av främstNO2, PM10 och bensen.Vi redovisar två olika förslag till luftövervakningsprogram för bakgrundsluft samt två förslag tillluftövervakningsprogram för tätorter. Programmen är i huvudsak avsedda att pågå under perioden2009-2014, men vissa delar kan behöva utvärderas under perioden. I rapporten redovisas två olikaförslag på omfattningen av en regional luftövervakning i Jämtlands län vad gäller bakgrundsmiljö,en med ökad och en med minskad ambition jämfört med de mätningar som för närvarande bedrivsinom länet. Båda förslagen förutsätter att Naturvårdsverket under perioden fortsätter med sinluftövervakning i länet i sin nuvarande omfattning, inklusive utökade mätningar vid Bredkälen vadgäller partiklar och metaller. I förslaget med en ökad ambition för mätningar i bakgrundsmiljöföreslår vi att de kontinuerliga mätningarna av ozon med instrument utökas med ytterligare en platssom kan ge representativa mätningar för hög höjd i fjällvärlden. Vidare föreslår vi en utökning meddepositionsmätningar över öppet fält i skogslandet inom Krondroppsnätet. För att förståmekanismerna för kvävedeposition bl.a. med avseende på våt- och torrdeposition är det av stortvärde att ha parallella mätningar av krondropp och mätningar över öppet fält vid samma plats. Iförslaget med minskad ambition föreslår vi att mätningarna av krondropp och över öppet fält vidfjällnära platser inom Krondroppsnätet dras ner. För närvarande mäts krondropp på medelhög höjdvid tre platser medan mätningar över öppet fält bedrivs på två höjder vid vardera två platser. Viföreslår att detta dras ner till mätningar av krondropp vid två platser på medelhög höjd samt enmätning över öppet fält på hög höjd. Att behålla en mätning av depositionen på hög höjd motiverarvi med att växtekosystemen på dessa höjder kan vara mycket känsliga för förändringar ikvävetillgången.
  •  
39.
  •  
40.
  • Karlsson, Per Erik, et al. (författare)
  • Totaldeposition av baskatjoner till skog
  • 2013
  • Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
    • Det atmosfäriska nedfallet av baskatjoner mäts dels i nederbörden på öppet fält och dels som krondropp inne i skogen. Krondroppet skall i teorin ge en uppskattning av det samlade nedfallet till skogen, eftersom krondroppet i princip inkluderar både våt- och torrdeposition. För ämnen som t. ex. kväve och de flesta baskatjoner (kalium, magnesium och calcium) kompliceras uppskattningen av en interncirkulation inom trädkronorna, vilket involverar både upptag och läckage. Torrdepositionen av olika ämnen kan uppskattas genom användandet av surrogatytor, t ex strängprovtagare av teflon, placerade under tak. Natrium används som en biologiskt inert markör för depositionen till skogen. Torrdepositionen av ett specifikt ämne beräknas som koncentrationen av ämnet i provet från strängprovtagaren dividerat med koncentrationen av natrium i strängprovet och multiplicerat med nettokrondroppet för natrium till skogen vid provplatsen. Nettokrondroppet beräknas som nedfallet i krondropp subtraherat med nedfallet på öppet fält, korrigerat för en viss torrdeposition till provtagningstrattarna. Med hjälp av strängprovtagare samt nedfallsmätningar på öppet fält och i krondropp beräknades den partikelbundna torrdepositionen av baskatjoner för 12 platser i landet under en period av 8 år. Parallellt beräknades våtdepositionen av dessa ämnen med hjälp av öppet fält mätningar. Det samlade nedfallet av baskatjoner (exkl. natrium) beräknades till 400-900 ekv/ha/år för sydvästra delarna av Götaland, 200-300 ekv/ha/år för mellersta och östra Götaland samt för Svealand och 80-130 ekv/ha/år för Norrland. Andelen torrdeposition av totala depositionen av baskatjoner varierade mellan 30-70 % för sydvästra Götaland, 15-50 % för övriga Götaland och Svealand samt 5-25 % för Norrland.
  •  
41.
  •  
42.
  • Karlsson, Tobias, et al. (författare)
  • Liposuction of Breast Cancer: Related Arm Lymphedema Reduces Fat and Muscle Hypertrophy
  • 2022
  • Ingår i: Lymphatic Research and Biology. - : Mary Ann Liebert Inc. - 1539-6851 .- 1557-8585. ; 20:1, s. 53-63
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • Introduction: Adipose tissue deposition is a known consequence of lymphedema. A previous study showed that the affected arm in patients with nonpitting breast cancer-related lymphedema (BCRL) had a mean excess volume of 73% fat and 47% muscle. This condition impairs combined physiotherapy as well as more advanced microsurgical methods. Liposuction is, therefore, a way of improving the effects of treatment. Objective: This study aims to evaluate the tissue changes in lymphedematous arms after liposuction and controlled compression therapy (CCT) in patients with nonpitting BCRL. Methods and Results: Eighteen women with an age of 61 years and a duration of arm lymphedema (BCRL) of 9 years were treated with liposuction and CCT. Tissue composition of fat, lean (muscle), and bone mineral was analyzed through dual energy X-ray absorptiometry (DXA) before, and at 3 and 12 months after surgery. Excess volumes were also measured with plethysmography. The median DXA preoperative excess volume was 1425 mL (704 mL fat volume, 651 mL lean volume). The DXA excess volume at 3 months after surgery was 193 mL (-196 mL fat volume, 362 mL lean volume). At 12 months after surgery, the median excess DXA volume was 2 mL (-269 mL fat volume, 338 mL lean volume). From before surgery to 3 months after surgery, the median DXA excess volume reduced by 85% (p < 0.001) (fat volume reduction 128% (p < 0.001), lean volume reduction 37% (p = 0.016)). From before surgery to 12 months after surgery, it reduced by 100% (p < 0.001) (fat volume reduction 139% [p < 0.001], lean volume reduction 54% [p = 0.0013]). Conclusions: Liposuction and CCT effectively remove the excess fat in patients with nonpitting BCRL, and a total reduction of excess arm volume is achievable. A postoperative decrease in excess muscle volume is also seen, probably due to the reduced weight of the arm postoperatively.
  •  
43.
  • Kindbom, Karin, et al. (författare)
  • Trends in air concentration and deposition at background monitoring sites in Sweden : Major inorganic compounds, heavy metals and ozone
  • 2001
  • Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
    • This report describes concentrations in air of sulphur compounds, soot, nitrogen compounds andozone in Sweden between 1985-1998. Time trends of concentration in precipitation and depositionof sulphate, nitrate, ammonium, acidity, base cations and chloride in six different regions coveringSweden are evaluated during the period 1983-1998. Trends of heavy metals in precipitation havebeen analysed for the period 1983-1998 and the change in heavy metal concentration, 1975-1995, inmosses is described.Data used in the trend analyses originates from measurements performed at six Swedish EMEPstations and from approximately 25 stations within the national Precipitation Chemistry Network.Two different statistical methods, linear regression and the non-parametric Mann Kendall test, havebeen used to evaluate changes in annual mean values.
  •  
44.
  • KTH Utbildningar 2027/2028
  • 2017
  • Konstnärligt arbeteabstract
    • I projektet Framtidens KTH-utbildningar har vi tagit fram förslag på hur vår verksamhet skulle kunna se ut för studenter, lärare, alumner och arbetsgivare – eller vad de kommer att vara. Visioner blir ofta luddiga så vi har istället skapat konkreta bilder som vi hoppas öppnar för samtal och ett vidare arbete med utbildningar för läsåret 2027/2028 då KTH firar tvåhundraårsjubileum.Denna katalog är endast till för idévärlden och innebär inget åtagande för KTH att erbjuda de utbildningar eller koncept som beskrivs. Men det är tillåtet att önska sig dem.
  •  
45.
  • Lindquist, Kajsa Ericson, et al. (författare)
  • Clinical framework for next generation sequencing based analysis of treatment predictive mutations and multiplexed gene fusion detection in non-small cell lung cancer
  • 2017
  • Ingår i: Oncotarget. - : Impact Journals, LLC. - 1949-2553. ; 8:21, s. 34796-34810
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • Precision medicine requires accurate multi-gene clinical diagnostics. We describe the implementation of an Illumina TruSight Tumor (TST) clinical NGS diagnostic framework and parallel validation of a NanoString RNA-based ALK, RET, and ROS1 gene fusion assay for combined analysis of treatment predictive alterations in non-small cell lung cancer (NSCLC) in a regional healthcare region of Sweden (Scandinavia). The TST panel was clinically validated in 81 tumors (99% hotspot mutation concordance), after which 533 consecutive NSCLCs were collected during one-year of routine clinical analysis in the healthcare region (~90% advanced stage patients). The NanoString assay was evaluated in 169 of 533 cases. In the 533-sample cohort 79% had 1-2 variants, 12% >2 variants and 9% no detected variants. Ten gene fusions (five ALK, three RET, two ROS1) were detected in 135 successfully analyzed cases (80% analysis success rate). No ALK or ROS1 FISH fusion positive case was missed by the NanoString assay. Stratification of the 533-sample cohort based on actionable alterations in 11 oncogenes revealed that 66% of adenocarcinomas, 13% of squamous carcinoma (SqCC) and 56% of NSCLC not otherwise specified harbored ≥1 alteration. In adenocarcinoma, 10.6% of patients (50.3% if including KRAS) could potentially be eligible for emerging therapeutics, in addition to the 15.3% of patients eligible for standard EGFR or ALK inhibitors. For squamous carcinoma corresponding proportions were 4.4% (11.1% with KRAS) vs 2.2%. In conclusion, multiplexed NGS and gene fusion analyses are feasible in NSCLC for clinical diagnostics, identifying notable proportions of patients potentially eligible for emerging molecular therapeutics.
  •  
46.
  • Liu, Meng, 1976, et al. (författare)
  • Targeting the protein prenyltransferases efficiently reduces tumor development in mice with K-RAS-induced lung cancer
  • 2010
  • Ingår i: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - : Proceedings of the National Academy of Sciences. - 0027-8424. ; 107:14, s. 6471-6476
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • RAS and RHO proteins, which contribute to tumorigenesis and metastasis, undergo posttranslational modification with an isoprenyl lipid by protein farnesyltransferase (FTase) or protein geranylgeranyltransferase-I (GGTase-I). Inhibitors of FTase and GGTase-I were developed to block RAS-induced malignancies, but their utility has been difficult to evaluate because of off-target effects, drug resistance, and toxicity. Moreover, the impact of FTase deficiency and combined FTase/GGTase-I deficiency has not been evaluated with genetic approaches. We found that inactivation of FTase eliminated farnesylation of HDJ2 and H-RAS, prevented H-RAS targeting to the plasma membrane, and blocked proliferation of primary and K-RAS(G12D)-expressing fibroblasts. FTase inactivation in mice with K-RAS-induced lung cancer reduced tumor growth and improved survival, similar to results obtained previously with inactivation of GGTase-I. Simultaneous inactivation of FTase and GGTase-I markedly reduced lung tumors and improved survival without apparent pulmonary toxicity. These data shed light on the biochemical and therapeutic importance of FTase and suggest that simultaneous inhibition of FTase and GGTase-I could be useful in cancer therapeutics.
  •  
47.
  • Ljungstrom, L., et al. (författare)
  • Clinical evaluation of commercial nucleic acid amplification tests in patients with suspected sepsis
  • 2015
  • Ingår i: Bmc Infectious Diseases. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1471-2334. ; 15
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • Background: Sepsis is a serious medical condition requiring timely administered, appropriate antibiotic therapy. Blood culture is regarded as the gold standard for aetiological diagnosis of sepsis, but it suffers from low sensitivity and long turnaround time. Thus, nucleic acid amplification tests (NAATs) have emerged to shorten the time to identification of causative microbes. The aim of the present study was to evaluate the clinical utility in everyday practice in the emergency department of two commercial NAATs in patients suspected with sepsis. Methods: During a six-week period, blood samples were collected consecutively from all adult patients admitted to the general emergency department for suspicion of a community-onset sepsis and treated with intravenous antibiotics. Along with conventional blood cultures, multiplex PCR (Magicplex (TM)) was performed on whole blood specimens whereas portions from blood culture bottles were used for analysis by microarray-based assay (Prove-it (TM)). The aetiological significance of identified organisms was determined by two infectious disease physicians based on clinical presentation and expected pathogenicity. Results: Among 382 episodes of suspected sepsis, clinically relevant microbes were detected by blood culture in 42 episodes (11%), by multiplex PCR in 37 episodes (9.7%), and by microarray in 32 episodes (8.4%). Although moderate agreement with blood culture (kappa 0.50), the multiplex PCR added diagnostic value by timely detection of 15 clinically relevant findings in blood culture-negative specimens. Results of the microarray corresponded very well to those of blood culture (kappa 0.90), but were available just marginally prior to blood culture results. Conclusions: The use of NAATs on whole blood specimens in adjunct to current culture-based methods provides a clinical add-on value by allowing for detection of organisms missed by blood culture. However, the aetiological significance of findings detected by NAATs should be interpreted with caution as the high analytical sensitivity may add findings that do not necessarily corroborate with the clinical diagnosis.
  •  
48.
  • Loikas, Desirée, et al. (författare)
  • Does patient's sex influence treatment in primary care? Experiences and expressed knowledge among physicians : a qualitative study
  • 2015
  • Ingår i: BMC Family Practice. - London, UK : BioMed Central. - 1471-2296. ; 16
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • BACKGROUND: Biological and sociocultural differences between men and women may play an important role in medical treatment. Little is known about the awareness of these differences among general practitioners (GPs) and if they consider such differences in their medical practice. The aim of this study was to explore GPs' perception of sex and gender aspects in medical treatment.METHODS: We conducted five focus group discussions (FGDs) with 29 physicians (mainly GPs) in Sweden. A discussion guide with semi-structured questions was used. All FGDs were audio-recorded and transcribed word-by-word. Data were analysed through inductive thematic analysis with no predetermined categories.RESULTS: Three main categories emerged from the data. The first category emphasised GPs' experiences of sex and gender differences in diagnosing and assessment of clinical findings. Medical treatment in men and women was central in the second category. The third category emphasised GPs' knowledge of sex differences in drug therapy.CONCLUSIONS: The GPs stated they had little knowledge of sex and gender differences in drug treatment, but gave multiple examples of how the patient's sex affects the choice of treatment. Sex and gender aspects were considered in diagnosing and in the treatment decision. However, once the decision to treat was made the choice of drug followed recommendations by local Drug and Therapeutics Committee, which were perceived to be evidence-based. In the analysis we found a gap between perceived and expressed knowledge of sex and gender differences in drug treatment indicating a need of education about this to be included in the curriculum in medical school and in basic and specialist training for physicians. Education could also be a tool to avoid stereotypical thinking about male and female patients.
  •  
49.
  • Lundgren, Sebastian, et al. (författare)
  • The clinical importance of tumour-infiltrating macrophages and dendritic cells in periampullary adenocarcinoma differs by morphological subtype
  • 2017
  • Ingår i: Journal of Translational Medicine. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1479-5876. ; 15:1
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • Background: Dendritic cells (DC) and tumour-associated macrophages (TAM) are essential in linking the innate and adaptive immune response against tumour cells and tumour progression. These cells are also potential target for immunotherapy as well as providing a handle to investigate immune status in the tumour microenvironment. The aim of the present study was to examine their impact on prognosis and chemotherapy response in periampullary adenocarcinoma, including pancreatic cancer, with particular reference to morphological subtype. Methods: The density of tolerogenic immature CD1a+ dendritic cells (DC), and MARCO+, CD68+ and CD163+ tissue-associated macrophages (TAM) was analysed by immunohistochemistry in tissue micro arrays with tumours from 175 consecutive cases of periampullary adenocarcinoma who had undergone pancreaticoduodenectomy, 110 with pancreatobiliary type (PB-type) and 65 with intestinal type (I-type) morphology. Kaplan-Meier and Cox regression analyses were applied to determine the impact of immune cell infiltration on 5-year overall survival (OS). Results: High density of CD1a+ DCs was an independent prognostic factor for a reduced OS in PB-type but not in I-type tumours (adjusted HR = 2.35; 95% CI 1.13-4.87). High density of CD68+ and CD163+ TAM was significantly associated with poor OS in the whole cohort, however only in unadjusted analysis (HR = 1.67; 95% CI 1.06-2.63, and HR = 1.84; 95% CI 1.09-3.09, respectively) and not in strata according to morphological subtype. High density of MARCO+ macrophages was significantly associated with poor prognosis in I-type but not in PB-type tumours (HR = 2.14 95% CI 1.03-4.44), and this association was only evident in patients treated with adjuvant chemotherapy. The prognostic value of the other investigated immune cells did not differ significantly in strata according to adjuvant chemotherapy. Conclusions: The results from this study demonstrate that high infiltration of tolerogenic immature DCs independently predicts a shorter survival in patients with PB-type periampullary adenocarcinoma, and that high density of the MARCO+ subtype of TAMs predicts a shorter survival in patients with I-type tumours. These results emphasise the importance of taking morphological subtype into account in biomarker studies related to periampullary cancer, and indicate that therapies targeting dendritic cells may be of value in the treatment of PB-type tumours, which are associated with the worst prognosis.
  •  
50.
  • Marchetto, Aldo, et al. (författare)
  • Good Agreement Between Modeled and Measured Sulfur and Nitrogen Deposition in Europe, in Spite of Marked Differences in Some Sites
  • 2021
  • Ingår i: Frontiers in Environmental Science. - : Frontiers Media SA. - 2296-665X. ; 9
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • Atmospheric nitrogen and sulfur deposition is an important effect of atmospheric pollution and may affect forest ecosystems positively, for example enhancing tree growth, or negatively, for example causing acidification, eutrophication, cation depletion in soil or nutritional imbalances in trees. To assess and design measures to reduce the negative impacts of deposition, a good estimate of the deposition amount is needed, either by direct measurement or by modeling. In order to evaluate the precision of both approaches and to identify possible improvements, we compared the deposition estimates obtained using an Eulerian model with the measurements performed by two large independent networks covering most of Europe. The results are in good agreement (bias <25%) for sulfate and nitrate open field deposition, while larger differences are more evident for ammonium deposition, likely due to the greater influence of local ammonia sources. Modeled sulfur total deposition compares well with throughfall deposition measured in forest plots, while the estimate of nitrogen deposition is affected by the tree canopy. The geographical distribution of pollutant deposition and of outlier sites where model and measurements show larger differences are discussed.
  •  
Skapa referenser, mejla, bekava och länka
  • Resultat 1-50 av 954
Typ av publikation
tidskriftsartikel (557)
konferensbidrag (153)
rapport (85)
doktorsavhandling (51)
annan publikation (34)
bokkapitel (29)
visa fler...
bok (18)
forskningsöversikt (10)
licentiatavhandling (10)
proceedings (redaktörskap) (3)
samlingsverk (redaktörskap) (2)
konstnärligt arbete (2)
patent (1)
visa färre...
Typ av innehåll
refereegranskat (641)
övrigt vetenskapligt/konstnärligt (272)
populärvet., debatt m.m. (40)
Författare/redaktör
Karlsson, Karin (51)
Hedström, Karin, 196 ... (42)
Karlsson, Jón, 1953 (40)
Karlsson, Fredrik, 1 ... (34)
Grävare Silbernagel, ... (27)
Karlsson, Anna, 1967 (27)
visa fler...
Karlsson, Stefan (25)
Pihl-Karlsson, Gunil ... (24)
Bylund, Johan, 1975 (22)
Edberg, Anna-Karin (22)
Christenson, Karin (20)
Nilsson-Helander, Ka ... (19)
Sjöberg, Karin (18)
Karlsson, Magnus (17)
Karlsson, Anna (17)
Karlsson, Per Erik (17)
Olsson, Karin (17)
Westergren, Albert (16)
Karlsson, Per, 1963 (16)
Karlsson, Staffan, 1 ... (16)
Rosenquist, Richard (15)
Wendin, Karin (15)
Karlsson, Sofia (15)
Eriksson, Bengt I., ... (15)
Borg-Karlsson, Anna- ... (15)
Jirström, Karin (14)
Hallböök, Helene (14)
Lindroos, Anna-Karin ... (13)
Kolkowska, Ella, 197 ... (13)
Karlsson, Katarina (13)
Tobin, Gerard (12)
Roos, Göran (12)
Brorsson, Annelie, 1 ... (12)
Roeleveld, Karin (12)
Juliusson, Gunnar (11)
Klinga-Levan, Karin (11)
Karlsson, Staffan (11)
Thomeé, Roland, 1954 (11)
Dahlgren, Claes, 194 ... (11)
Thellenberg-Karlsson ... (11)
Arvidsson Segerkvist ... (11)
Hansen, Karin (11)
Karlsson, Anders (10)
Sundström, Christer (10)
Grönlund, Christer (10)
Thunberg, Ulf (10)
Karlsson, Maria (10)
Wallin, Karin (10)
Björkman, Lena, 1965 (10)
Sundfeldt, Karin, 19 ... (10)
visa färre...
Lärosäte
Göteborgs universitet (221)
Uppsala universitet (170)
Lunds universitet (157)
Linköpings universitet (137)
Karolinska Institutet (112)
Umeå universitet (97)
visa fler...
Örebro universitet (86)
Stockholms universitet (43)
Högskolan Kristianstad (38)
Högskolan i Skövde (38)
Kungliga Tekniska Högskolan (33)
Sveriges Lantbruksuniversitet (30)
Chalmers tekniska högskola (28)
Högskolan i Halmstad (26)
Jönköping University (25)
Naturvårdsverket (21)
RISE (20)
IVL Svenska Miljöinstitutet (20)
Högskolan i Borås (19)
Karlstads universitet (19)
Mittuniversitetet (17)
Luleå tekniska universitet (16)
Malmö universitet (13)
Linnéuniversitetet (12)
Gymnastik- och idrottshögskolan (9)
Mälardalens universitet (6)
Södertörns högskola (5)
Högskolan Dalarna (4)
Högskolan i Gävle (3)
Högskolan Väst (3)
Handelshögskolan i Stockholm (2)
Naturhistoriska riksmuseet (2)
VTI - Statens väg- och transportforskningsinstitut (2)
Marie Cederschiöld högskola (1)
Sophiahemmet Högskola (1)
Havs- och vattenmyndigheten (1)
visa färre...
Språk
Engelska (784)
Svenska (163)
Odefinierat språk (7)
Forskningsämne (UKÄ/SCB)
Medicin och hälsovetenskap (462)
Naturvetenskap (165)
Samhällsvetenskap (142)
Teknik (50)
Lantbruksvetenskap (39)
Humaniora (18)

År

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy