| 1. |
- Beecham, Ashley H, et al.
(författare)
-
Analysis of immune-related loci identifies 48 new susceptibility variants for multiple sclerosis.
- 2013
-
Ingår i: Nature genetics. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1546-1718 .- 1061-4036. ; 45:11, s. 1353-60
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Using the ImmunoChip custom genotyping array, we analyzed 14,498 subjects with multiple sclerosis and 24,091 healthy controls for 161,311 autosomal variants and identified 135 potentially associated regions (P < 1.0 × 10(-4)). In a replication phase, we combined these data with previous genome-wide association study (GWAS) data from an independent 14,802 subjects with multiple sclerosis and 26,703 healthy controls. In these 80,094 individuals of European ancestry, we identified 48 new susceptibility variants (P < 5.0 × 10(-8)), 3 of which we found after conditioning on previously identified variants. Thus, there are now 110 established multiple sclerosis risk variants at 103 discrete loci outside of the major histocompatibility complex. With high-resolution Bayesian fine mapping, we identified five regions where one variant accounted for more than 50% of the posterior probability of association. This study enhances the catalog of multiple sclerosis risk variants and illustrates the value of fine mapping in the resolution of GWAS signals.
|
|
| 2. |
- Björnsson, Bergthor, et al.
(författare)
-
Conventional, but not remote ischemic preconditioning, reduces iNOS transcription in liver ischemia/reperfusion
- 2014
-
Ingår i: World Journal of Gastroenterology. - : Baishideng Publishing Group Co. Limited. - 1007-9327 .- 2219-2840. ; 20:28, s. 9506-9512
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- AIM: To study the effects of preconditioning on inducible nitric oxide synthase (iNOS) and interleukin 1 (IL-1) receptor transcription in rat liver ischemia/reperfusion injury (IRI). METHODS: Seventy-two male rats were randomized into 3 groups: the one-hour segmental ischemia (IRI, n = 24) group, the ischemic preconditioning (IPC, n = 24) group or the remote ischemic preconditioning (R-IPC, n = 24) group. The IPC and R-IPC were performed as 10 min of ischemia and 10 min of reperfusion. The iNOS and the IL-1 receptor mRNA in the liver tissue was analyzed with real time PCR. The total Nitrite and Nitrate (NOx) in continuously sampled microdialysate (MD) from the liver was analyzed. In addition, the NOx levels in the serum were analyzed. RESULTS: After 4 h of reperfusion, the iNOS mRNA was significantly higher in the R-IPC (Delta Ct: 3.44 +/- 0.57) group than in the IPC (Delta Ct: 5.86 +/- 0.82) group (P = 0.025). The IL-1 receptor transcription activity was reduced in the IPC group (Delta Ct: 1.88 +/- 0.53 to 4.81 +/- 0.21), but not in the R-IPC group, during reperfusion (P = 0.027). In the MD, a significant drop in the NOx levels was noted in the R-IPC group (12.3 +/- 2.2 to 4.7 +/- 1.2 mu mol/L) at the end of ischemia compared with the levels in early ischemia (P = 0.008). A similar trend was observed in the IPC group (11.8 +/- 2.1 to 6.4 +/- 1.5 mu mol/L), although this difference was not statistically significant. The levels of NOx rose quickly during reperfusion in both groups. CONCLUSION: IPC, but not R-IPC, reduces iNOS and IL-1 receptor transcription during early reperfusion, indicating a lower inflammatory reaction. NOx is consumed in the ischemic liver lobe.
|
|
| 3. |
- Björnsson, Bergthor, et al.
(författare)
-
Remote or Conventional Ischemic Preconditioning -Local Liver Metabolism in Rats Studied with Microdialysis
- 2012
-
Ingår i: Journal of Surgical Research. - : Elsevier. - 0022-4804 .- 1095-8673. ; 176:1, s. 55-62
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Background. Ischemic preconditioning (IPC) of the liver decreases liver injury secondary to ischemia and reperfusion. An attractive alternative to IPC is remote ischemic preconditioning (R-IPC), but these two methods have not previously been compared. Material and Methods. Eighty-seven rats were randomized into four groups: sham operated (n = 15), 1 h segmental ischemia (IRI, n = 24), preceeded by IPC (n = 24), or R-IPC (n = 24) (to the left hindleg). IPC and R-IPC were performed with 10 min ischemia and 10 min of reperfusion. Analyses of liver microdialysate (MD), serum transaminase levels, and liver histology were made. Results. Rats treated with IPC and R-IPC had significantly lower AST, 71.5 (19.6) IU/L respective 96.6 (12.4) at 4 h reperfusion than those subjected to IRI alone, 155 (20.9), P = 0.0004 and P = 0.04 respectively. IPC also had lower ALT levels, 41.6 (11.3) IU/L than had IRI 107.4 (15.5), P = 0.003. The MD glycerol was significantly higher during ischemia in the R-IPC = 759 (84) mu M] and the IRI = 732 (67)] groups than in the IPC 514 (70) group, P = 0.022 and P = 0.046 respectively. The MD glucose after ischemia was lower in the IPC group 7.1 (1.2) than in the IRI group 12.7 (1.6), P = 0.005. Preconditioning to the liver caused an direct increase in lactate, glucose and glycerol in the ischemic segment compared with the control segment an effect not seen in the R-IPC and IRI groups. Conclusions. IPC affects glucose metabolism in the rat liver, observed with MD. IPC reduces liver cell injury during ischemic and reperfusion in rats. R-IPC performed over the same length of time as IPC does not have the same effect as the latter on ALT levels and MD glycerol; this may suggest that R-IPC does not offer the same protection as IPC in this setting of rat liver IRI.
|
|
| 4. |
- Sawcer, Stephen, et al.
(författare)
-
Genetic risk and a primary role for cell-mediated immune mechanisms in multiple sclerosis
- 2011
-
Ingår i: Nature. - : Springer Science and Business Media LLC. - 0028-0836 .- 1476-4687. ; 476:7359, s. 214-219
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Multiple sclerosis is a common disease of the central nervous system in which the interplay between inflammatory and neurodegenerative processes typically results in intermittent neurological disturbance followed by progressive accumulation of disability. Epidemiological studies have shown that genetic factors are primarily responsible for the substantially increased frequency of the disease seen in the relatives of affected individuals, and systematic attempts to identify linkage in multiplex families have confirmed that variation within the major histocompatibility complex (MHC) exerts the greatest individual effect on risk. Modestly powered genome-wide association studies (GWAS) have enabled more than 20 additional risk loci to be identified and have shown that multiple variants exerting modest individual effects have a key role in disease susceptibility. Most of the genetic architecture underlying susceptibility to the disease remains to be defined and is anticipated to require the analysis of sample sizes that are beyond the numbers currently available to individual research groups. In a collaborative GWAS involving 9,772 cases of European descent collected by 23 research groups working in 15 different countries, we have replicated almost all of the previously suggested associations and identified at least a further 29 novel susceptibility loci. Within the MHC we have refined the identity of the HLA-DRB1 risk alleles and confirmed that variation in the HLA-A gene underlies the independent protective effect attributable to the class I region. Immunologically relevant genes are significantly overrepresented among those mapping close to the identified loci and particularly implicate T-helper-cell differentiation in the pathogenesis of multiple sclerosis.
|
|
| 5. |
- Winbladh, Anders, et al.
(författare)
-
N-acetyl cysteine improves glycogenesis after segmental liver ischemia and reperfusion injury in pigs
- 2012
-
Ingår i: Scandinavian Journal of Gastroenterology. - : Informa Healthcare. - 0036-5521 .- 1502-7708. ; 47:2, s. 225-236
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Abstract Objective. N-acetylcysteine (NAC) is an antioxidative molecule known to protect liver tissue from oxygen radical species generated during ischemia and reperfusion (IR). Nutritional and toxicology studies have shown that NAC also improves glucose metabolism and glycogen stores. We hypothesized that NAC improves glycogenesis and that impaired glycogenesis is a key element in IR injury. Material and Methods. In an experimental model, 80 min of segmental liver ischemia was induced in 16 pigs and the reperfusion was followed for 360 min. Eight animals received NAC 150 mg/kg as a bolus injection followed by an infusion of NAC 50 mg/kg/h intravenously. Results. AST and leukocyte density were lower in the NAC-treated animals, unrelated to the glutathione levels or apoptosis. Glycogen stores returned to a higher degree in the NAC-treated animals and microdialysis revealed lower levels of lactate during the reperfusion phase. Nitrite/Nitrate levels in the NAC group were lower in both serum and microdialysates, indicating that NAC scavenges radical nitrosative species. Conclusions. NAC treatment improves glycogenesis after liver IR injury and reduces the level of intraparenchymal lactate during reperfusion, possibly due to the scavenging of radical nitrosative species.
|
|
| 6. |
- Assefa, Anteneh Taye, et al.
(författare)
-
Temporal Trends of PCDD/Fs in Baltic Sea Sediment Cores Covering the 20th Century
- 2014
-
Ingår i: Environmental Science and Technology. - : American Chemical Society (ACS). - 0013-936X .- 1520-5851. ; 48:2, s. 947-953
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- The pollution trend of polychlorinated dibenzo-p-dioxins and dibenzofurans (PCDD/Fs) in the Baltic Sea region was studied based on depth profiles of PCDD/Fs in sediment cores collected from six-offshore areas, eight coastal sites impacted by industrial/urban emissions, and one coastal reference site. A general trend was observed for the offshore and coastal reference sites with substantial increase in PCDD/F concentrations in the mid-late 1970s and peak levels during 1985-2002. The overall peak year for PCDD/Fs in Baltic Sea offshore areas was estimated (using spline-fit modeling) to 1994 +/- 5 years, and a half-life in sediments was estimated at 29 +/- 11 years. For the industrial/urban impacted coastal sites, the temporal trend was more variable with peak years occurring 1-2 decades earlier compared to offshore areas. The substantial reductions from peak levels (38 +/- 11% and 81 +/- 12% in offshore and coastal areas, respectively) reflect domestic and international actions taken for reduction of the release of PCDD/Fs to the environment. The modeled overall half-life and reductions of PCDD/Fs in offshore Baltic Sea sediment correspond well to both PCDD/F trends in European lakes without any known direct. PCDD/F sources (half-lives 30 and 32 years), and previously modeled reduction in atmospheric deposition of,PCDD/Fs to the Baltic Sea since 1990. These observations support previous findings of a common diffuse source, such as long-range air transport of atmospheric emissions, as the prime source of PCDD/Fs to the Baltic Sea region. The half-life of PCDD/Fs in Baltic Sea offshore sediments was estimated to be approximately 2 and 4-6 times longer than in semirural and urban European air, respectively. This study highlights the need for further international actions to reduce the levels of PCDD/Fs in Baltic Sea air specifically and in European air in general.
|
|
| 7. |
- Bladh, Johan, et al.
(författare)
-
Torsional stability of hydropower units under influence of subsynchronous oscillations
- 2013
-
Ingår i: IEEE Transactions on Power Systems. - 0885-8950 .- 1558-0679. ; 28:4, s. 3826-3833
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- Hydropower units are known to be comparatively insensitive to subsynchronous power oscillations. During a startup test of an electrical island in the Nordic power system, a series capacitor tripped due to a subsynchronous oscillation within the normal frequency range of hydropower unit torsional modes. Since no thermal units were connected, it is motivated to question the traditional view. In this paper, the small-signal and transient torsional mode stability of hydropower units is assessed through time-domain simulations. The model is based on the first IEEE benchmark model for subsynchronous resonance which has been tuned to fit one of the blackstart test system units for which detailed measurements are available. The stability conditions are investigated for several load conditions and machine configurations. It is found that the damping in the startup test system is sufficient to prevent growing oscillations. A fault however could expose the machines to high transient torques.
|
|
| 8. |
- Brown, Kelly, 1973, et al.
(författare)
-
Profile of blood cells and inflammatory mediators in periodic fever, aphthous stomatitis, pharyngitis and adenitis (PFAPA) syndrome.
- 2010
-
Ingår i: BMC pediatrics. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1471-2431. ; 10
-
Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
- ABSTRACT: BACKGROUND: This study aimed to profile levels of blood cells and serum cytokines during afebrile and febrile phases of periodic fever, aphthous stomatitis, pharyngitis and adenitis (PFAPA) syndrome to advance pathophysiological understanding of this pediatric disease. METHODS: A cohort of patients with a median age of 4.9 years experiencing 'typical PFAPA' episodes participated in this study. Blood cells and serum cytokines were analyzed by CBC analysis and multiplex ELISA. RESULTS: Oscillations in the concentration of blood cells during the afebrile and febrile phases of typical PFAPA syndrome were observed; novel findings include increased monocytes and decreased eosinophils during a febrile episode and increased thrombocytes in the afebrile interval. Relatively modest levels of pro-inflammatory cytokines were present in sera. IFNγ-induced cytokine IP10/CXCL10 was increased after the onset of fever while T cell-associated cytokines IL7 and IL17 were suppressed during afebrile and febrile periods. CONCLUSIONS: Identification of dysregulated blood cells and serum cytokines is an initial step towards the identification of biomarkers of PFAPA disease and/or players in disease pathogenesis. Future investigations are required to conclusively discern which mediators are associated specifically with PFAPA syndrome.
|
|
| 9. |
- Edborg, Per, et al.
(författare)
-
Förbättring av beräkningsunderlag för metangasberäkningar avseende avfallsdeponering
- 2010
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Sammanställning av ett nytt förbättrat beräk-ningsunderlag för metanutsläpp från avfalls-deponierBefintligt beräkningsunderlag för metanutsläpp från avfallsdeponier för rapporte-ring till UNFCCC bygger både på årligt och regelbundet producerad statistik. I de delar för vilka uppgifter inte tas fram årligen används istället uppgifter från en-skilda studier, framskrivningar och expertbedömningar. Dessa uppgifter har med tiden förlorat sin aktualitet, och lyckas inte på ett väl underbyggt och dokumenterat sätt beskriva de förändringar som deponeringsförbuden av utsorterat brännbart avfall och organiskt avfall medfört för avfallsdeponeringen i Sverige. Därför har ett nytt beräkningsunderlag tagits fram.Det nya beräkningsunderlaget bygger på att uppgifter om deponerade avfallsmäng-der hämtas från WStatR-rapporteringen och används i beräkningsunderlaget för åren fr.o.m. 2006 och framåt. WStatR-data avseende år 2006 och år 2008 för de utvalda avfallsslagen har använts till beräkningsunderlaget. Uppgifter avseende år 2007 är framtagna med linjär interpolering.Resultat av provberäkningarResultaten av provberäkningarna med nuvarande beräkningsunderlag och det nya förbättrade beräkningsunderlaget visar följande: Båda beräkningsunderlagen ger för åren 2006-2008 väldigt lika skattningar av metangasemissioner från avfallsde-ponier. Skillnaderna är mindre än vad som skulle kunna förväntas med avseende på de kända brister som finns i det nuvarande beräkningsunderlaget. Detta beror till viss del på den fördröjningseffekt som finns inbyggd i beräkningsmodellen – metan genereras av avfall som deponerats historiskt. Skillnaden i beräkningsunderlaget kommer dock att slå igenom tydligare om några år. Det nya beräkningsunderlaget minskar osäkerheterna jämfört med det gamla.RekommendationerProjektet rekommenderar att man från och med referensår 2006 för avfallsmängder helt övergår till WStatR-uppgifter som beräkningsunderlag till beräkningsmo-dellen. Fördelarna är bl.a. att det nya beräkningsunderlaget: är komplett med avseende på omfattning. produceras fortlöpande (vartannat år). använder avfallsslag med tydligare beskrivningar (definitioner) av vad som ingår, än vad det nuvarande beräkningsunderlaget gör. i mindre omfattning än nuvarande beräkningsunderlag bygger på fram-skrivningar och expertbedömningar, framför allt avseende avfallsmängder. är mer känsligt för de snabba förändringar som har skett och sker avseende avfallsdeponering, beroende på möjligheten att uppdatera såväl DOC-halter som avfallsmängder oftare än tidigare.Övriga uppgifter i det nya beräkningsunderla-getWStatR kan förse det nya beräkningsunderlaget med uppgifter om avfallsmängder och (indirekt via skattningar) DOC-halter. Övriga uppgifter, bl.a. uppgifter om återtagning av deponigas, måste fortfarande hämtas från samma datakällor som tidigare (i detta exempel från Avfall Sverige).Förslag till förändringar i befintliga datain-samlingarFör att ytterligare förbättra underlaget (och möjligheterna att skatta DOC-halter) bör uppgifter i WStatR, åtminstone de avseende deponering så långt det är möjligt hanteras genom ökat användande av LoW-nomenklaturen. F.n. har det varit god-tyckligt att använda LoW eller EWC-Stat, då uppgifterna slutligen ändå aggregeras ihop till EWC-Stat-kategorier.Det vore även en förbättring om övriga statistikinsamlingar använde sig av LoW-koder som standard. I enkäterna för dispensdeponering förekommer t.ex. egna beteckningar och inte minst sammanslagningar av vitt skilda avfallsslag. Detta försvårar analyser av DOC-halter.För WStatR:s avfallskategorier 03.2 "Avloppsslam från industrier" och 11A "Van-ligt slam (exkl. 11.3)" föreslås att man i beräkningsmodellen använder sig av torr-vikten på slammet. Detta eftersom man då kan anta att DOC-halten på slammet är densamma mellan åren oberoende av variationer av vattenhalter i slammet.De satta DOC-värdena bör inte ses som statiska. För flera av EWC-Stat-avfallsslagen har DOC beräknats genom att vikta ihop från de ingående LoW. Denna LoW-fördelning kan ändras med tiden, så att även DOC-värdet för EWC-Stat kommer att ändras. Om data om deponering samlas in på LoW-nivå kan man göra en uppdaterad DOC-beräkning för EWC-Stat vid varje rapporteringsomgång. Det bedöms vara relativt lite merarbete att samla in konsekvent på LoW-nivå, och beräkningarna kan genomföras ganska enkelt.
|
|
| 10. |
- Edborg, Per, et al.
(författare)
-
Förbättring av beräkningsunderlag för metangasberäkningar avseende avfallsdeponering : Inför submission 2011
- 2010
-
Rapport (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)abstract
- Sammanställning av ett nytt förbättrat beräk-ningsunderlag för metanutsläpp från avfalls-deponierBefintligt beräkningsunderlag för metanutsläpp från avfallsdeponier för rapporte-ring till UNFCCC bygger både på årligt och regelbundet producerad statistik. I de delar för vilka uppgifter inte tas fram årligen används istället uppgifter från en-skilda studier, framskrivningar och expertbedömningar. Dessa uppgifter har med tiden förlorat sin aktualitet, och lyckas inte på ett väl underbyggt och dokumenterat sätt beskriva de förändringar som deponeringsförbuden av utsorterat brännbart avfall och organiskt avfall medfört för avfallsdeponeringen i Sverige. Därför har ett nytt beräkningsunderlag tagits fram.Det nya beräkningsunderlaget bygger på att uppgifter om deponerade avfallsmäng-der hämtas från WStatR-rapporteringen och används i beräkningsunderlaget för åren fr.o.m. 2006 och framåt. WStatR-data avseende år 2006 och år 2008 för de utvalda avfallsslagen har använts till beräkningsunderlaget. Uppgifter avseende år 2007 är framtagna med linjär interpolering.Resultat av provberäkningarResultaten av provberäkningarna med nuvarande beräkningsunderlag och det nya förbättrade beräkningsunderlaget visar följande: Båda beräkningsunderlagen ger för åren 2006-2008 väldigt lika skattningar av metangasemissioner från avfallsde-ponier. Skillnaderna är mindre än vad som skulle kunna förväntas med avseende på de kända brister som finns i det nuvarande beräkningsunderlaget. Detta beror till viss del på den fördröjningseffekt som finns inbyggd i beräkningsmodellen – metan genereras av avfall som deponerats historiskt. Skillnaden i beräkningsunderlaget kommer dock att slå igenom tydligare om några år. Det nya beräkningsunderlaget minskar osäkerheterna jämfört med det gamla.RekommendationerProjektet rekommenderar att man från och med referensår 2006för avfallsmängder helt övergår till WStatR-uppgifter som beräkningsunderlag till beräkningsmo-dellen. Fördelarna är bl.a. att det nya beräkningsunderlaget:är komplett med avseende på omfattning.produceras fortlöpande (vartannat år).använder avfallsslag med tydligare beskrivningar (definitioner) av vad som ingår, än vad det nuvarande beräkningsunderlaget gör.i mindre omfattning än nuvarande beräkningsunderlag bygger på fram-skrivningar och expertbedömningar, framför allt avseende avfallsmängder.6 är mer känsligt för de snabba förändringar som har skett och sker avseende avfallsdeponering, beroende på möjligheten att uppdatera såväl DOC-halter som avfallsmängder oftare än tidigare.Övriga uppgifter i det nya beräkningsunderla-getWStatR kan förse det nya beräkningsunderlaget med uppgifter om avfallsmängder och (indirekt via skattningar) DOC-halter. Övriga uppgifter, bl.a. uppgifter om återtagning av deponigas, måste fortfarande hämtas från samma datakällor som tidigare (i detta exempel från Avfall Sverige).Förslag till förändringar i befintliga datain-samlingarFör att ytterligare förbättra underlaget (och möjligheterna att skatta DOC-halter) bör uppgifter i WStatR, åtminstone de avseende deponering så långt det är möjligt hanteras genom ökat användande av LoW-nomenklaturen. F.n. har det varit god-tyckligt att använda LoW eller EWC-Stat, då uppgifterna slutligen ändå aggregeras ihop till EWC-Stat-kategorier.Det vore även en förbättring om övriga statistikinsamlingar använde sig av LoW-koder som standard. I enkäterna för dispensdeponering förekommer t.ex. egna beteckningar och inte minst sammanslagningar av vitt skilda avfallsslag. Detta försvårar analyser av DOC-halter.För WStatR:s avfallskategorier 03.2 "Avloppsslam från industrier" och 11A "Van-ligt slam (exkl. 11.3)" föreslås att man i beräkningsmodellen använder sig av torr-vikten på slammet. Detta eftersom man då kan anta att DOC-halten på slammet är densamma mellan åren oberoende av variationer av vattenhalter i slammet.De satta DOC-värdena bör inte ses som statiska. För flera av EWC-Stat-avfallsslagen har DOC beräknats genom att vikta ihop från de ingående LoW. Denna LoW-fördelning kan ändras med tiden, så att även DOC-värdet för EWC-Stat kommer att ändras. Om data om deponering samlas in på LoW-nivå kan man göra en uppdaterad DOC-beräkning för EWC-Stat vid varje rapporteringsomgång. Det bedöms vara relativt lite merarbete att samla in konsekvent på LoW-nivå, och beräkningarna kan genomföras ganska enkelt.
|
|
