SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:hkr-12006"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:hkr-12006" > A Role for the 2' O...

A Role for the 2' OH of peptidyl-tRNA substrate in peptide release on the ribosome revealed through RF-mediated rescue

Shaw, Jeffrey J. (författare)
Johns Hopkins University School of Medicine, Baltimore
Trobro, Stefan, 1972- (författare)
Uppsala universitet,Institutionen för cell- och molekylärbiologi
He, Shan L. (författare)
Johns Hopkins University School of Medicine, Baltimore
visa fler...
Åqvist, Johan (författare)
Uppsala universitet,Beräknings- och systembiologi
Green, Rachel (författare)
Johns Hopkins University School of Medicine, Baltimore
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2012
2012
Engelska.
Ingår i: Chemistry and Biology. - 1074-5521 .- 1879-1301. ; 19:8, s. 983-993
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • The 2' OH of the peptidyl-tRNA substrate is thought to be important for catalysis of both peptide bond formation and peptide release in the ribosomal active site. The release reaction also specifically depends on a release factor protein (RF) to hydrolyze the ester linkage of the peptidyl-tRNA upon recognition of stop codons in the A site. Here, we demonstrate that certain amino acid substitutions (in particular those containing hydroxyl or thiol groups) in the conserved GGQ glutamine of release factor RF1 can rescue defects in the release reaction associated with peptidyl-tRNA substrates lacking a 2' OH. We explored this rescue effect through biochemical and computational approaches that support a model where the 2' OH of the P-site substrate is critical for orienting the nucleophile in a hydrogen-bonding network productive for catalysis.

Ämnesord

NATURAL SCIENCES  -- Chemical Sciences -- Theoretical Chemistry (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Kemi -- Teoretisk kemi (hsv//swe)
NATURVETENSKAP  -- Kemi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Chemical Sciences (hsv//eng)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologiska vetenskaper (hsv//swe)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy