Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-23815" >
Versatile gene-spec...
Versatile gene-specific sequence tags for Arabidopsis functional genomics : Trancript profiling and reverse genetics applications
- Artikel/kapitelEngelska2004
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2004-10-15
-
Cold Spring Harbor Laboratory,2004
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:kth-23815
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-23815URI
-
https://doi.org/10.1101/gr.2544504DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
QC 20100525 QC 20110922
-
Microarray transcript profiling and RNA interference are two new technologies crucial for large-scale gene function studies in multicellular eukaryotes. Both rely on sequence-specific hybridization between complementary nucleic acid strands, inciting us to create a collection of gene-specific sequence tags (GSTs) representing at least 21,500 Arabidopsis genes and which are compatible with both approaches. The GSTs were carefully selected to ensure that each of them shared no significant similarity with any other region in the Arabidopsis genome. They were synthesized by PCR amplification from genomic DNA. Spotted microarrays fabricated from the GSTs show good dynamic range, specificity, and sensitivity in transcript profiling experiments. The GSTs have also been transferred to bacterial plasmid vectors via recombinational cloning protocols. These cloned GSTs constitute the ideal starting point for a variety of functional approaches, including reverse genetics. We have subcloned GSTs on a large scale into vectors designed for gene silencing in plant cells. We show that in planta expression of GST hairpin RNA results in the expected phenotypes in silenced Arabidopsis lines. These versatile GST resources provide novel and powerful tools for functional genomics.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Allemeersch, J.
(författare)
-
Altmann, T.
(författare)
-
Aubourg, S.
(författare)
-
Avon, A.
(författare)
-
Beynon, J.
(författare)
-
Bhalerao, R. P.
(författare)
-
Bitton, F.
(författare)
-
Caboche, M.
(författare)
-
Cannoot, B.
(författare)
-
Chardakov, V.
(författare)
-
Cognet-Holliger, C.
(författare)
-
Colot, V.
(författare)
-
Crowe, M.
(författare)
-
Darimont, C.
(författare)
-
Durinck, S.
(författare)
-
Eickhoff, H.
(författare)
-
de Longevialle, A. F.
(författare)
-
Farmer, E. E.
(författare)
-
Grant, M.
(författare)
-
Kuiper, M. T. R.
(författare)
-
Lehrach, H.
(författare)
-
Leon, C.
(författare)
-
Leyva, A.
(författare)
-
Lundeberg, JoakimKTH,Bioteknologi(Swepub:kth)u1qkn9kw
(författare)
-
Lurin, C.
(författare)
-
Moreau, Y.
(författare)
-
Nietfeld, W.
(författare)
-
Paz-Ares, J.
(författare)
-
Reymond, P.
(författare)
-
Rouze, P.
(författare)
-
Sandberg, G.
(författare)
-
Segura, M. D.
(författare)
-
Serizet, C.
(författare)
-
Tabrett, A.
(författare)
-
Taconnat, L.
(författare)
-
Thareau, V.
(författare)
-
Van Hummelen, P.
(författare)
-
Vercruysse, S.
(författare)
-
Vuylsteke, M.
(författare)
-
Weingartner, M.
(författare)
-
Weisbeek, P. J.
(författare)
-
Wirta, ValtteriKTH,Bioteknologi(Swepub:kth)u1u59vht
(författare)
-
Wittink, F. R. A.
(författare)
-
Zabeau, M.
(författare)
-
Small, I.
(författare)
-
KTHBioteknologi
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Genome Research: Cold Spring Harbor Laboratory14:10B, s. 2176-21891088-90511549-5469
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Hilson, P.
-
Allemeersch, J.
-
Altmann, T.
-
Aubourg, S.
-
Avon, A.
-
Beynon, J.
-
visa fler...
-
Bhalerao, R. P.
-
Bitton, F.
-
Caboche, M.
-
Cannoot, B.
-
Chardakov, V.
-
Cognet-Holliger, ...
-
Colot, V.
-
Crowe, M.
-
Darimont, C.
-
Durinck, S.
-
Eickhoff, H.
-
de Longevialle, ...
-
Farmer, E. E.
-
Grant, M.
-
Kuiper, M. T. R.
-
Lehrach, H.
-
Leon, C.
-
Leyva, A.
-
Lundeberg, Joaki ...
-
Lurin, C.
-
Moreau, Y.
-
Nietfeld, W.
-
Paz-Ares, J.
-
Reymond, P.
-
Rouze, P.
-
Sandberg, G.
-
Segura, M. D.
-
Serizet, C.
-
Tabrett, A.
-
Taconnat, L.
-
Thareau, V.
-
Van Hummelen, P.
-
Vercruysse, S.
-
Vuylsteke, M.
-
Weingartner, M.
-
Weisbeek, P. J.
-
Wirta, Valtteri
-
Wittink, F. R. A ...
-
Zabeau, M.
-
Small, I.
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
- Artiklar i publikationen
-
Genome Research
- Av lärosätet
-
Kungliga Tekniska Högskolan