Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-342543" >
Discovery of target...
-
Morris, John A.New York Genome Center, New York, NY 10013, USA; Department of Biology, New York University, New York, NY 10003, USA
(författare)
Discovery of target genes and pathways at GWAS loci by pooled single-cell CRISPR screens
- Artikel/kapitelEngelska2023
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
American Association for the Advancement of Science (AAAS),2023
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:kth-342543
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-342543URI
-
https://doi.org/10.1126/science.adh7699DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
QC 20240124
-
Most variants associated with complex traits and diseases identified by genome-wide association studies (GWAS) map to noncoding regions of the genome with unknown effects. Using ancestrally diverse, biobank-scale GWAS data, massively parallel CRISPR screens, and single-cell transcriptomic and proteomic sequencing, we discovered 124 cis-target genes of 91 noncoding blood trait GWAS loci. Using precise variant insertion through base editing, we connected specific variants with gene expression changes. We also identified trans-effect networks of noncoding loci when cis target genes encoded transcription factors or microRNAs. Networks were themselves enriched for GWAS variants and demonstrated polygenic contributions to complex traits. This platform enables massively parallel characterization of the target genes and mechanisms of human noncoding variants in both cis and trans.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Caragine, ChristinaNew York Genome Center, New York, NY 10013, USA; Department of Biology, New York University, New York, NY 10003, USA
(författare)
-
Daniloski, ZharkoNew York Genome Center, New York, NY 10013, USA; Department of Biology, New York University, New York, NY 10003, USA
(författare)
-
Domingo, JúliaNew York Genome Center, New York, NY 10013, USA
(författare)
-
Barry, TimothyDepartment of Statistics and Data Science, Carnegie Mellon University, Pittsburgh, PA 15213, USA
(författare)
-
Lu, LuNew York Genome Center, New York, NY 10013, USA; Department of Biology, New York University, New York, NY 10003, USA
(författare)
-
Davis, KyrieNew York Genome Center, New York, NY 10013, USA; Department of Biology, New York University, New York, NY 10003, USA
(författare)
-
Ziosi, MarcelloNew York Genome Center, New York, NY 10013, USA
(författare)
-
Glinos, Dafni A.New York Genome Center, New York, NY 10013, USA
(författare)
-
Hao, StephanieTechnology Innovation Lab, New York Genome Center, New York, NY 10013, USA
(författare)
-
Mimitou, Eleni P.Technology Innovation Lab, New York Genome Center, New York, NY 10013, USA
(författare)
-
Smibert, PeterTechnology Innovation Lab, New York Genome Center, New York, NY 10013, USA
(författare)
-
Roeder, KathrynDepartment of Statistics and Data Science, Carnegie Mellon University, Pittsburgh, PA 15213, USA; Computational Biology Department, Carnegie Mellon University, Pittsburgh, PA 15213, USA
(författare)
-
Katsevich, EugeneDepartment of Statistics and Data Science, The Wharton School, University of Pennsylvania, Philadelphia, PA 19104, USA
(författare)
-
Lappalainen, TuuliKTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,New York Genome Center, New York, NY 10013, USA(Swepub:kth)u1o81n30
(författare)
-
Sanjana, Neville E.New York Genome Center, New York, NY 10013, USA; Department of Biology, New York University, New York, NY 10003, USA
(författare)
-
New York Genome Center, New York, NY 10013, USA; Department of Biology, New York University, New York, NY 10003, USANew York Genome Center, New York, NY 10013, USA
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Science: American Association for the Advancement of Science (AAAS)380:66460036-80751095-9203
Internetlänk
Hitta via bibliotek
-
Science
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Morris, John A.
-
Caragine, Christ ...
-
Daniloski, Zhark ...
-
Domingo, Júlia
-
Barry, Timothy
-
Lu, Lu
-
visa fler...
-
Davis, Kyrie
-
Ziosi, Marcello
-
Glinos, Dafni A.
-
Hao, Stephanie
-
Mimitou, Eleni P ...
-
Smibert, Peter
-
Roeder, Kathryn
-
Katsevich, Eugen ...
-
Lappalainen, Tuu ...
-
Sanjana, Neville ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Genetik
- Artiklar i publikationen
-
Science
- Av lärosätet
-
Kungliga Tekniska Högskolan