Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-48858" >
Semi-supervised lea...
-
Käll, LukasDepartment of Genome Sciences, University of Washington
(författare)
Semi-supervised learning for peptide identification from shotgun proteomics datasets
- Artikel/kapitelEngelska2007
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2007-10-21
-
Springer Science and Business Media LLC,2007
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:kth-48858
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-48858URI
-
https://doi.org/10.1038/nmeth1113DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
QC 20111124
-
Shotgun proteomics uses liquid chromatography-tandem mass spectrometry to identify proteins in complex biological samples. We describe an algorithm, called Percolator, for improving the rate of confident peptide identifications from a collection of tandem mass spectra. Percolator uses semi-supervised machine learning to discriminate between correct and decoy spectrum identifications, correctly assigning peptides to 17% more spectra from a tryptic Saccharomyces cerevisiae dataset, and up to 77% more spectra from non-tryptic digests, relative to a fully supervised approach.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Canterbury, Jesse D.
(författare)
-
Weston, Jason
(författare)
-
Noble, William Stafford
(författare)
-
MacCoss, Michael J.
(författare)
-
Department of Genome Sciences, University of Washington
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Nature Methods: Springer Science and Business Media LLC4:11, s. 923-9251548-70911548-7105
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas