Single particle refinement in electron crystallography: A pilot study

Koeck, Philip J. B.Karolinska Institutet,KTH,Södertörns högskola,Institutionen för livsvetenskaper,KTH / Karoliska institutet,Strukturell bioteknik (författare)

Single particle refinement in electron crystallography : A pilot study

QC 20100929
Electron crystallography can be used to determine the structures of membrane proteins at near-atomic resolution in some cases. However, most electron crystallography projects remain at a resolution around 10 Å. This might be partly due to lack of flatness of many two-dimensional crystals. We have investigated this problem and suggest single particle processing of locally averaged unit cells to improve the quality and possibly the resolution of three-dimensional maps. Applying this method to the secondary transporter melibiose permease we have calculated a three-dimensional map that is clearer and easier to interpret than the map derived using purely electron-crystallographic methods.

NATURVETENSKAP Biologi Biokemi och molekylärbiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Biochemistry and Molecular Biology hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences hsv//eng
Crystal distortion
Electron crystallography
Membrane proteins
Single particle reconstruction
melibiose
membrane protein
permease
article
calculation
crystal structure
crystallography
elementary particle
measurement
pilot study
priority journal
protein structure
structure analysis
three dimensional imaging
Computer Simulation
Crystallization
Escherichia coli Proteins
Fourier Analysis
Imaging
Three-Dimensional
Microscopy
Electron
Transmission
Models
Molecular
Pilot Projects
Protein Conformation
Symporters
Biology

Purhonen, P.Karolinska Institutet (författare)
Alvang, RonnyKTH,Skolan för teknik och hälsa (STH)(Swepub:kth)PI000000 (författare)
Grundberg, BjörnKTH,Strukturell bioteknik(Swepub:kth)u1opp05l (författare)
Hebert, HansKarolinska Institutet,KTH,Strukturell bioteknik(Swepub:kth)u1h8ygcn (författare)
Södertörns högskolaInstitutionen för livsvetenskaper (creator_code:org_t)

Ingår i:Journal of Structural Biology: Elsevier BV160:3, s. 344-3521047-84771095-8657

Av författaren/redakt...: Koeck, Philip J. ...; Purhonen, P.; Alvang, Ronny; Grundberg, Björn; Hebert, Hans

Om ämnet

Av lärosätet: Södertörns högskola; Kungliga Tekniska Högskolan; Karolinska Institutet

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.