Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-215904" >
Towards a structura...
Towards a structurally resolved human protein interaction network
-
Burke, David F. (författare)
-
- Bryant, Patrick (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)
-
Barrio-Hernandez, Inigo (författare)
-
visa fler...
-
Memon, Danish (författare)
-
- Pozzati, Gabriele (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)
-
- Shenoy, Aditi (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)
-
- Zhu, Wensi (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)
-
Dunham, Alistair S. (författare)
-
Albanese, Pascal (författare)
-
Keller, Andrew (författare)
-
Scheltema, Richard A. (författare)
-
Bruce, James E. (författare)
-
Leitner, Alexander (författare)
-
- Kundrotas, Petras (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),The University of Kansas, Lawrence, USA
-
Beltrao, Pedro (författare)
-
- Elofsson, Arne, 1966- (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2023-01-23
- 2023
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Structural & Molecular Biology. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1545-9993 .- 1545-9985. ; 30:2, s. 216-225
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Cellular functions are governed by molecular machines that assemble through protein-protein interactions. Their atomic details are critical to studying their molecular mechanisms. However, fewer than 5% of hundreds of thousands of human protein interactions have been structurally characterized. Here we test the potential and limitations of recent progress in deep-learning methods using AlphaFold2 to predict structures for 65,484 human protein interactions. We show that experiments can orthogonally confirm higher-confidence models. We identify 3,137 high-confidence models, of which 1,371 have no homology to a known structure. We identify interface residues harboring disease mutations, suggesting potential mechanisms for pathogenic variants. Groups of interface phosphorylation sites show patterns of co-regulation across conditions, suggestive of coordinated tuning of multiple protein interactions as signaling responses. Finally, we provide examples of how the predicted binary complexes can be used to build larger assemblies helping to expand our understanding of human cell biology.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Burke, David F.
-
Bryant, Patrick
-
Barrio-Hernandez ...
-
Memon, Danish
-
Pozzati, Gabriel ...
-
Shenoy, Aditi
-
visa fler...
-
Zhu, Wensi
-
Dunham, Alistair ...
-
Albanese, Pascal
-
Keller, Andrew
-
Scheltema, Richa ...
-
Bruce, James E.
-
Leitner, Alexand ...
-
Kundrotas, Petra ...
-
Beltrao, Pedro
-
Elofsson, Arne, ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Bioinformatik oc ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Structura ...
- Av lärosätet
-
Stockholms universitet