SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-112994"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-112994" > ORegAnno :

LIBRIS Formathandbok  (Information om MARC21)
FältnamnIndikatorerMetadata
00003666naa a2200649 4500
001oai:DiVA.org:uu-112994
003SwePub
008100125s2008 | |||||||||||000 ||eng|
0247 a https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-1129942 URI
0247 a https://doi.org/10.1093/nar/gkm9672 DOI
040 a (SwePub)uu
041 a engb eng
042 9 SwePub
072 7a ref2 swepub-contenttype
072 7a art2 swepub-publicationtype
1001 a Griffith, Obi L.4 aut
2451 0a ORegAnno :b an open-access community-driven resource for regulatory annotation
264 c 2007-12-23
264 1b Oxford University Press (OUP),c 2008
338 a print2 rdacarrier
520 a ORegAnno is an open-source, open-access database and literature curation system for community-based annotation of experimentally identified DNA regulatory regions, transcription factor binding sites and regulatory variants. The current release comprises 30 145 records curated from 922 publications and describing regulatory sequences for over 3853 genes and 465 transcription factors from 19 species. A new feature called the publication queue allows users to input relevant papers from scientific literature as targets for annotation. The queue contains 4438 gene regulation papers entered by experts and another 54 351 identified by text-mining methods. Users can enter or check out papers from the queue for manual curation using a series of user-friendly annotation pages. A typical record entry consists of species, sequence type, sequence, target gene, binding factor, experimental outcome and one or more lines of experimental evidence. An evidence ontology was developed to describe and categorize these experiments. Records are cross-referenced to Ensembl or Entrez gene identifiers, PubMed and dbSNP and can be visualized in the Ensembl or UCSC genome browsers. All data are freely available through search pages, XML data dumps or web services at: http://www.oreganno.org.
653 a MEDICINE
653 a MEDICIN
7001 a Montgomery, Stephen B.4 aut
7001 a Bernier, Bridget4 aut
7001 a Chu, Bryan4 aut
7001 a Kasaian, Katayoon4 aut
7001 a Aerts, Stein4 aut
7001 a Mahony, Shaun4 aut
7001 a Sleumer, Monica C.4 aut
7001 a Bilenky, Mikhail4 aut
7001 a Haeussler, Maximilian4 aut
7001 a Griffith, Malachi4 aut
7001 a Gallo, Steven M.4 aut
7001 a Giardine, Belinda4 aut
7001 a Hooghe, Bart4 aut
7001 a Van Loo, Peter4 aut
7001 a Blanco, Enrique4 aut
7001 a Ticoll, Amy4 aut
7001 a Lithwick, Stuart4 aut
7001 a Portales-Casamar, Elodie4 aut
7001 a Donaldson, Ian J.4 aut
7001 a Robertson, Gordon4 aut
7001 a Wadelius, Claesu Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi4 aut0 (Swepub:uu)claeswad
7001 a De Bleser, Pieter4 aut
7001 a Vlieghe, Dominique4 aut
7001 a Halfon, Marc S.4 aut
7001 a Wasserman, Wyeth4 aut
7001 a Hardison, Ross4 aut
7001 a Bergman, Casey M.4 aut
7001 a Jones, Steven J. M.4 aut
7102 a Uppsala universitetb Institutionen för genetik och patologi4 org
7730 t Nucleic Acids Researchd : Oxford University Press (OUP)g 36:Database issue, s. D107-D113q 36:Database issue<D107-D113x 0305-1048x 1362-4962
8564 u http://www.oreganno.org
8564 u https://academic.oup.com/nar/article-pdf/36/suppl_1/D107/7635948/gkm967.pdf
8564 8u https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-112994
8564 8u https://doi.org/10.1093/nar/gkm967

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy