Differential coexpression analysis of obesity-associated networks in human subcutaneous adipose tissue.

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/152492" > Differential coexpr...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Walley, A J (författare)

Differential coexpression analysis of obesity-associated networks in human subcutaneous adipose tissue.

Artikel/kapitelEngelska2012

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2011-03-22
Springer Science and Business Media LLC,2012

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/152492
https://gup.ub.gu.se/publication/152492URI
https://doi.org/10.1038/ijo.2011.22DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Objective:To use a unique obesity-discordant sib-pair study design to combine differential expression analysis, expression quantitative trait loci (eQTLs) mapping and a coexpression regulatory network approach in subcutaneous human adipose tissue to identify genes relevant to the obese state.Study design:Genome-wide transcript expression in subcutaneous human adipose tissue was measured using Affymetrix U133 Plus 2.0 microarrays (Affymetrix, Santa Clara, CA, USA), and genome-wide genotyping data was obtained using an Applied Biosystems (Applied Biosystems; Life Technologies, Carlsbad, CA, USA) SNPlex linkage panel.Subjects:A total of 154 Swedish families ascertained through an obese proband (body mass index (BMI) >30kgm(-2)) with a discordant sibling (BMI>10kgm(-2) less than proband).Results:Approximately one-third of the transcripts were differentially expressed between lean and obese siblings. The cellular adhesion molecules (CAMs) KEGG grouping contained the largest number of differentially expressed genes under cis-acting genetic control. By using a novel approach to contrast CAMs coexpression networks between lean and obese siblings, a subset of differentially regulated genes was identified, with the previously GWAS obesity-associated neuronal growth regulator 1 (NEGR1) as a central hub. Independent analysis using mouse data demonstrated that this finding of NEGR1 is conserved across species.Conclusion:Our data suggest that in addition to its reported role in the brain, NEGR1 is also expressed in subcutaneous adipose tissue and acts as a central 'hub' in an obesity-related transcript network.

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Biologi Genetik hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Genetics hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Biokemi och molekylärbiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Biochemistry and Molecular Biology hsv//eng
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper Medicinsk genetik hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Basic Medicine Medical Genetics hsv//eng
Gene expression
Obesity-associated networks
Differential coexpression analysis

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Jacobson, Peter,1962Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine(Swepub:gu)xjacop (författare)
Falchi, M (författare)
Bottolo, L (författare)
Andersson, Johanna,1974Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine(Swepub:gu)xanjoh (författare)
Petretto, E (författare)
Bonnefond, A (författare)
Vaillant, E (författare)
Lecoeur, C (författare)
Vatin, V (författare)
Jernås, Margareta,1961Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine(Swepub:gu)xjernm (författare)
Balding, D (författare)
Petteni, M (författare)
Park, Y S (författare)
Aitman, T (författare)
Richardson, S (författare)
Sjöström, LarsGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine(Swepub:gu)xsjosl (författare)
Carlsson, Lena M S,1957Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine(Swepub:gu)xcarle (författare)
Froguel, P (författare)
Göteborgs universitetInstitutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:International Journal of Obesity: Springer Science and Business Media LLC36:1, s. 137-1471476-54970307-0565

Internetlänk

Hitta via bibliotek

International Journal of Obesity (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Walley, A J; Jacobson, Peter, ...; Falchi, M; Bottolo, L; Andersson, Johan ...; Petretto, E; visa fler...; Bonnefond, A; Vaillant, E; Lecoeur, C; Vatin, V; Jernås, Margaret ...; Balding, D; Petteni, M; Park, Y S; Aitman, T; Richardson, S; Sjöström, Lars; Carlsson, Lena M ...; Froguel, P; visa färre...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Genetik

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Biokemi och mole ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Medicinsk geneti ...

Artiklar i publikationen: International Jo ...

Av lärosätet: Göteborgs universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se