Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/321931" >
Novel human-derived...
Novel human-derived EML4-ALK fusion cell lines identify ribonucleotide reductase RRM2 as a target of activated ALK in NSCLC
-
- Bokhari, Abdulmalik (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology
-
- Lai, Wei-Yun, 1986 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology
-
Le, A. T. (författare)
-
visa fler...
-
- Gabre, Jonatan L., 1988 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology
-
- Chuang, Tzu-Po (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology
-
- Fransson, Susanne, 1975 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Department of Laboratory Medicine
-
Bergman, B. (författare)
-
- Djos, Anna, 1983 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Department of Laboratory Medicine
-
Chen, N. (författare)
-
- Martinsson, Tommy, 1956 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Department of Laboratory Medicine
-
Van den Eynden, J. (författare)
-
Doebele, R. C. (författare)
-
- Palmer, Ruth H., 1970 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology
-
- Hallberg, Bengt, 1956 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology
-
- Umapathy, Ganesh (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Elsevier BV, 2022
- 2022
- Engelska.
-
Ingår i: Lung Cancer. - : Elsevier BV. - 0169-5002. ; 171, s. 103-114
- Relaterad länk:
-
https://gup.ub.gu.se...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Introduction: Echinoderm microtubule-associated protein-like 4 (EML4)-Anaplastic Lymphoma Kinase (ALK) rearrangements occur in 3% to 7% of lung adenocarcinomas and are targets for treatment with tyrosine kinase inhibitors (TKIs). Here we have developed three novel EML4-ALK-positive patient–derived Non-Small-Cell-Lung-Cancer (NSCLC) cancer cell lines, CUTO8 (variant 1), CUTO9 (variant 1) and CUTO29 (variant 3) and included a fourth ALK-positive cell line YU1077 (variant 3) to study ALK-positive signaling and responses. Variants 1 and 3 are the most common EML4-ALK variants expressed in ALK-positive NSCLC, and currently cell lines representing these EML4-ALK variants are limited. Materials and methods: Resazurin assay was performed to evaluate cell viability. Protein levels were determined using western blotting. RNA sequencing was performed in all four cell lines to identify differentially expressed genes. Whole-genome sequencing was performed to determine the presence of EML4-ALK fusion and ALK tyrosine kinase inhibitor resistance mutations. Results: In this study, we have confirmed expression of the corresponding ALK fusion protein and assessed their sensitivity to a range of ALK tyrosine kinase inhibitors. These patient derived cell lines exhibit differential sensitivity to lorlatinib, brigatinib and alectinib, with EML4-ALK variant 3 containing cell lines exhibiting increased sensitivity to lorlatinib and brigatinib as compared to alectinib. These cell lines were further characterized by whole genome sequencing and RNA-seq analysis that identified the ribonucleotide reductase regulatory subunit 2 (RRM2) as a downstream and potential therapeutic target in ALK-positive NSCLC. Conclusion: We provide a characterization of four novel EML4-ALK-positive NSCLC cell lines, highlighting genomic heterogeneity and differential responses to ALK TKI treatment. The RNA-Seq characterization of ALK-positive NSCLC CUTO8, CUTO9, CUTO29 and YU1077 cell lines reported here, has been compiled in an interactive ShinyApp resource for public data exploration (https://ccgg.ugent.be/shiny/nsclc_rrm2_2022/).
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
Nyckelord
- Alectinib
- Anaplastic lymphoma kinase
- Brigatinib
- Echinoderm microtubule associated protein like 4
- EML4-ALK
- Lorlatinib
- Lung adenocarcinoma
- NSCLC
- RRM2
- Tyrosine kinase inhibitors
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Bokhari, Abdulma ...
-
Lai, Wei-Yun, 19 ...
-
Le, A. T.
-
Gabre, Jonatan L ...
-
Chuang, Tzu-Po
-
Fransson, Susann ...
-
visa fler...
-
Bergman, B.
-
Djos, Anna, 1983
-
Chen, N.
-
Martinsson, Tomm ...
-
Van den Eynden, ...
-
Doebele, R. C.
-
Palmer, Ruth H., ...
-
Hallberg, Bengt, ...
-
Umapathy, Ganesh
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
- Artiklar i publikationen
-
Lung Cancer
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet