Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:301e11f0-736a-4781-a5b4-929c72a80017" >
Ring chromosomes, b...
-
Macchia, Gemma
(författare)
Ring chromosomes, breakpoint clusters, and neocentromeres in sarcomas.
- Artikel/kapitelEngelska2015
Förlag, utgivningsår, omfång ...
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:301e11f0-736a-4781-a5b4-929c72a80017
-
https://lup.lub.lu.se/record/4816188URI
-
https://doi.org/10.1002/gcc.22228DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Anmärkningar
-
Gene amplification is relatively common in tumors. In certain subtypes of sarcoma, it often occurs in the form of ring and/or giant rod-shaped marker (RGM) chromosomes whose mitotic stability is frequently rescued by ectopic novel centromeres (neocentromeres). Little is known about the origin and structure of these RGM chromosomes, including how they arise, their internal organization, and which sequences underlie the neocentromeres. To address these questions, 42 sarcomas with RGM chromosomes were investigated to detect regions prone to double strand breaks and possible functional or structural constraints driving the amplification process. We found nine breakpoint cluster regions potentially involved in the genesis of RGM chromosomes, which turned out to be significantly enriched in poly-pyrimidine traits. Some of the clusters were located close to genes already known to be relevant for sarcomas, thus indicating a potential functional constraint, while others mapped to transcriptionally inactive chromatin domains enriched in heterochromatic sites. Of note, five neocentromeres were identified after analyzing 13 of the cases by fluorescent in situ hybridization. ChIP-on-chip analysis with antibodies against the centromeric protein CENP-A showed that they were a patchwork of small genomic segments derived from different chromosomes, likely joint to form a contiguous sequence during the amplification process. © 2014 Wiley Periodicals, Inc.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Hansén Nord, KarolinLund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine(Swepub:lu)klin-kha
(författare)
-
Zoli, Monica
(författare)
-
Purgato, Stefania
(författare)
-
D'Addabbo, Pietro
(författare)
-
Whelan, Christopher W
(författare)
-
Carbone, Lucia
(författare)
-
Perini, Giovanni
(författare)
-
Mertens, FredrikLund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine(Swepub:lu)kgen-fme
(författare)
-
Rocchi, Mariano
(författare)
-
Storlazzi, Clelia Tiziana
(författare)
-
Avdelningen för klinisk genetikInstitutionen för laboratoriemedicin
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Genes, Chromosomes and Cancer: Wiley54:3, s. 156-1671045-2257
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Macchia, Gemma
-
Hansén Nord, Kar ...
-
Zoli, Monica
-
Purgato, Stefani ...
-
D'Addabbo, Pietr ...
-
Whelan, Christop ...
-
visa fler...
-
Carbone, Lucia
-
Perini, Giovanni
-
Mertens, Fredrik
-
Rocchi, Mariano
-
Storlazzi, Cleli ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
- Artiklar i publikationen
-
Genes, Chromosom ...
- Av lärosätet
-
Lunds universitet