Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:3438a8dc-a1ee-47ec-8bf9-dc7237bd812e" >
Genome-wide meta-an...
Genome-wide meta-analysis identifies novel determinants of circulating serum progranulin
-
- Tönjes, Anke (författare)
- Leipzig University
-
- Scholz, Markus (författare)
- Leipzig University
-
- Krüger, Jacqueline (författare)
- Leipzig University
-
visa fler...
-
- Krause, Kerstin (författare)
- Leipzig University
-
- Schleinitz, Dorit (författare)
- Leipzig University
-
- Kirsten, Holger (författare)
- Leipzig University
-
- Gebhardt, Claudia (författare)
- Leipzig University
-
- Marzi, Carola (författare)
- German Center for Diabetes Research,Helmholtz Zentrum München
-
- Grallert, Harald (författare)
- German Center for Diabetes Research,Helmholtz Zentrum München
-
- Ladenvall, Claes (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Translationell muskelforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Translational Muscle Research,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital
-
- Heyne, Henrike (författare)
- Leipzig University
-
- Laurila, Esa (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Translationell muskelforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Translational Muscle Research,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital
-
- Kriebel, Jennifer (författare)
- Helmholtz Zentrum München,German Center for Diabetes Research
-
- Meisinger, Christa (författare)
- German Center for Diabetes Research,Helmholtz Zentrum München
-
- Rathmann, Wolfgang (författare)
- Heinrich Heine University Düsseldorf
-
- Gieger, Christian (författare)
- Helmholtz Zentrum München
-
- Groop, Leif (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Translationell muskelforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Translational Muscle Research,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital
-
- Prokopenko, Inga (författare)
- University of Oxford,Wellcome Trust Centre for Human Genetics,Imperial College London
-
- Isomaa, Bo (författare)
- Folkhälsan Research Center
-
- Beutner, Frank (författare)
- University Hospital Leipzig
-
- Kratzsch, Jürgen (författare)
- University Hospital Leipzig
-
- Fischer-Rosinsky, Antje (författare)
- Charité - University Medicine Berlin
-
- Pfeiffer, Andreas (författare)
- Charité - University Medicine Berlin,German Institute of Human Nutrition
-
- Krohn, Knut (författare)
- Leipzig University
-
- Spranger, Joachim (författare)
- Charité - University Medicine Berlin
-
- Thiery, Joachim (författare)
- University Hospital Leipzig
-
- Blüher, Matthias (författare)
- Leipzig University
-
- Stumvoll, Michael (författare)
- Leipzig University
-
- Kovacs, Peter (författare)
- Leipzig University
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2017-11-27
- 2018
- Engelska.
-
Ingår i: Human Molecular Genetics. - : Oxford University Press (OUP). - 0964-6906 .- 1460-2083. ; 27:3, s. 546-558
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10...
-
visa fler...
-
https://academic.oup...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Progranulin is a secreted protein with important functions in processes including immune and inflammatory response, metabolism and embryonic development. The present study aimed at identification of genetic factors determining progranulin concentrations. We conducted a genome-wide association meta-analysis for serum progranulin in three independent cohorts from Europe: Sorbs (N=848) and KORA (N=1628) from Germany and PPP-Botnia (N=335) from Finland (total N=2811). Single nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with progranulin levels were replicated in two additional German cohorts: LIFE-Heart Study (Leipzig; N=967) and Metabolic Syndrome Berlin Potsdam (Berlin cohort; N=833). We measured mRNA expression of genes in peripheral blood mononuclear cells (PBMC) by micro-arrays and performed mRNA expression quantitative trait and expression-progranulin association studies to functionally substantiate identified loci. Finally, we conducted siRNA silencing experiments in vitro to validate potential candidate genes within the associated loci. Heritability of circulating progranulin levels was estimated at 31.8% and 26.1% in the Sorbs and LIFE-Heart cohort, respectively. SNPs at three loci reached study-wide significance (rs660240 in CELSR2-PSRC1-MYBPHL-SORT1, rs4747197 in CDH23- PSAP and rs5848 in GRN) explaining 19.4%/15.0% of the variance and 61%/57% of total heritability in the Sorbs/LIFE-Heart Study. The strongest evidence for association was at rs660240 (P=5.75x10-50), which was also associated with mRNA expression of PSRC1 in PBMC (P=1.51x10-21). Psrc1 knockdown in murine preadipocytes led to a consecutive 30% reduction in progranulin secretion. In conclusion, the present meta-GWAS combined with mRNA expression identified three loci associated with progranulin and supports the role of PSRC1 in the regulation of progranulin secretion.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Endokrinologi och diabetes (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Endocrinology and Diabetes (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Tönjes, Anke
-
Scholz, Markus
-
Krüger, Jacqueli ...
-
Krause, Kerstin
-
Schleinitz, Dori ...
-
Kirsten, Holger
-
visa fler...
-
Gebhardt, Claudi ...
-
Marzi, Carola
-
Grallert, Harald
-
Ladenvall, Claes
-
Heyne, Henrike
-
Laurila, Esa
-
Kriebel, Jennife ...
-
Meisinger, Chris ...
-
Rathmann, Wolfga ...
-
Gieger, Christia ...
-
Groop, Leif
-
Prokopenko, Inga
-
Isomaa, Bo
-
Beutner, Frank
-
Kratzsch, Jürgen
-
Fischer-Rosinsky ...
-
Pfeiffer, Andrea ...
-
Krohn, Knut
-
Spranger, Joachi ...
-
Thiery, Joachim
-
Blüher, Matthias
-
Stumvoll, Michae ...
-
Kovacs, Peter
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Endokrinologi oc ...
- Artiklar i publikationen
-
Human Molecular ...
- Av lärosätet
-
Lunds universitet