An integrative genomics screen uncovers ncRNA T-UCR functions in neuroblastoma tumours

Different classes of non-coding RNAs, including microRNAs, have recently been implicated in the process of tumourigenesis. In this study, we examined the expression and putative functions of a novel class of non-coding RNAs known as transcribed ultraconserved regions (T-UCRs) in neuroblastoma. Genome-wide expression pro. ling revealed correlations between specific T-UCR expression levels and important clinicogenetic parameters such as MYCN amplification status. A functional genomics approach based on the integration of multi-level transcriptome data was adapted to gain insights into T-UCR functions. Assignments of T-UCRs to cellular processes such as TP53 response, differentiation and proliferation were verified using various cellular model systems. For the first time, our results de. ne a T-UCR expression landscape in neuroblastoma and suggest widespread T-UCR involvement in diverse cellular processes that are deregulated in the process of tumourigenesis. Oncogene (2010) 29, 3583-3592; doi:10.1038/onc.2010.106; published online 12 April 2010

Fredlund, ErikLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)molm-efr (författare)
Pattyn, F. (författare)
Rihani, A. (författare)
Van Maerken, T. (författare)
Vermeulen, J. (författare)
Kumps, C. (författare)
Menten, B. (författare)
De Preter, K. (författare)
Schramm, A. (författare)
Schulte, J. (författare)
Noguera, R. (författare)
Schleiermacher, G. (författare)
Janoueix-Lerosey, I. (författare)
Laureys, G. (författare)
Powel, R. (författare)
Nittner, D. (författare)
Marine, J-C (författare)
Ringnér, MarkusLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)thep-mri (författare)
Speleman, F. (författare)
Vandesompele, J. (författare)
Bröstcancer-genetikSektion I (creator_code:org_t)

Ingår i:Oncogene: Springer Science and Business Media LLC29:24, s. 3583-35921476-55940950-9232

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Cancer och onkol ...

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.