Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:d45e1c41-be15-4fb6-bbac-195fe0d5b7d2" >
Human pancreatic is...
-
Miguel-Escalada, IreneImperial College London
(författare)
Human pancreatic islet three-dimensional chromatin architecture provides insights into the genetics of type 2 diabetes
- Artikel/kapitelEngelska2019
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2019-06-28
-
Springer Science and Business Media LLC,2019
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:d45e1c41-be15-4fb6-bbac-195fe0d5b7d2
-
https://lup.lub.lu.se/record/d45e1c41-be15-4fb6-bbac-195fe0d5b7d2URI
-
https://doi.org/10.1038/s41588-019-0457-0DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Anmärkningar
-
Genetic studies promise to provide insight into the molecular mechanisms underlying type 2 diabetes (T2D). Variants associated with T2D are often located in tissue-specific enhancer clusters or super-enhancers. So far, such domains have been defined through clustering of enhancers in linear genome maps rather than in three-dimensional (3D) space. Furthermore, their target genes are often unknown. We have created promoter capture Hi-C maps in human pancreatic islets. This linked diabetes-associated enhancers to their target genes, often located hundreds of kilobases away. It also revealed >1,300 groups of islet enhancers, super-enhancers and active promoters that form 3D hubs, some of which show coordinated glucose-dependent activity. We demonstrate that genetic variation in hubs impacts insulin secretion heritability, and show that hub annotations can be used for polygenic scores that predict T2D risk driven by islet regulatory variants. Human islet 3D chromatin architecture, therefore, provides a framework for interpretation of T2D genome-wide association study (GWAS) signals.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Bonàs-Guarch, SilviaImperial College London
(författare)
-
Cebola, InêsImperial College London
(författare)
-
Ponsa-Cobas, JoanImperial College London
(författare)
-
Mendieta-Esteban, JulenCenter for Genomic Regulation (CRG)
(författare)
-
Atla, GouthamCenter for Genomic Regulation (CRG),Imperial College London
(författare)
-
Javierre, Biola M.University of Cambridge
(författare)
-
Rolando, Delphine M.Y.Imperial College London
(författare)
-
Farabella, IreneCenter for Genomic Regulation (CRG)
(författare)
-
Morgan, Claire C.Imperial College London,Center for Genomic Regulation (CRG)
(författare)
-
García-Hurtado, JavierCenter for Genomic Regulation (CRG)
(författare)
-
Beucher, AnthonyImperial College London
(författare)
-
Morán, IgnasiImperial College London,Center for Genomic Regulation (CRG)
(författare)
-
Pasquali, LorenzoHospital Universitari Germans Trias i Pujol
(författare)
-
Ramos-Rodríguez, MireiaHospital Universitari Germans Trias i Pujol
(författare)
-
Appel, Emil V.R.University of Copenhagen
(författare)
-
Linneberg, AllanFrederiksberg Hospital,University of Copenhagen
(författare)
-
Gjesing, Anette P.University of Copenhagen
(författare)
-
Witte, Daniel R.Danish Diabetes Academy,Aarhus University
(författare)
-
Pedersen, OlufUniversity of Copenhagen
(författare)
-
Grarup, NielsUniversity of Copenhagen
(författare)
-
Ravassard, PhilippeParis-Sorbonne University
(författare)
-
Torrents, DavidCatalan Institution for Research and Advanced Studies,Center for Genomic Regulation (CRG)
(författare)
-
Mercader, Josep M.Center for Genomic Regulation (CRG),Massachusetts General Hospital,Broad Institute
(författare)
-
Piemonti, LorenzoVita-Salute San Raffaele University,San Raffaele Scientific Institute
(författare)
-
Berney, ThierryUniversity of Geneva
(författare)
-
de Koning, Eelco J.P.Leiden University Medical Centre,Hubrecht Institute
(författare)
-
Kerr-Conte, JulieEuropean Genome Institute for Diabetes (EGID) UMR 8199
(författare)
-
Pattou, FrançoisEuropean Genome Institute for Diabetes (EGID) UMR 8199
(författare)
-
Fedko, Iryna O.Vrije Universiteit Amsterdam
(författare)
-
Groop, LeifLund University,Lunds universitet,Translationell muskelforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUBIN Lab- Lunds laboratorium för neurokirurgisk hjärnskadeforskning,Translational Muscle Research,Lund University Research Groups,LUBIN Lab- Lund Brain Injury laboratory for Neurosurgical research(Swepub:lu)endo-lgr
(författare)
-
Prokopenko, IngaUniversity of Surrey,Imperial College London
(författare)
-
Hansen, TorbenUniversity of Copenhagen
(författare)
-
Marti-Renom, Marc A.Pompeu Fabra University,Center for Genomic Regulation (CRG),Catalan Institution for Research and Advanced Studies
(författare)
-
Fraser, PeterFlorida State University
(författare)
-
Ferrer, JorgeImperial College London,Center for Genomic Regulation (CRG)
(författare)
-
Imperial College LondonCenter for Genomic Regulation (CRG)
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Nature Genetics: Springer Science and Business Media LLC51:7, s. 1137-11481061-40361546-1718
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Miguel-Escalada, ...
-
Bonàs-Guarch, Si ...
-
Cebola, Inês
-
Ponsa-Cobas, Joa ...
-
Mendieta-Esteban ...
-
Atla, Goutham
-
visa fler...
-
Javierre, Biola ...
-
Rolando, Delphin ...
-
Farabella, Irene
-
Morgan, Claire C ...
-
García-Hurtado, ...
-
Beucher, Anthony
-
Morán, Ignasi
-
Pasquali, Lorenz ...
-
Ramos-Rodríguez, ...
-
Appel, Emil V.R.
-
Linneberg, Allan
-
Gjesing, Anette ...
-
Witte, Daniel R.
-
Pedersen, Oluf
-
Grarup, Niels
-
Ravassard, Phili ...
-
Torrents, David
-
Mercader, Josep ...
-
Piemonti, Lorenz ...
-
Berney, Thierry
-
de Koning, Eelco ...
-
Kerr-Conte, Juli ...
-
Pattou, François
-
Fedko, Iryna O.
-
Groop, Leif
-
Prokopenko, Inga
-
Hansen, Torben
-
Marti-Renom, Mar ...
-
Fraser, Peter
-
Ferrer, Jorge
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Genetik
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Endokrinologi oc ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Genetics
- Av lärosätet
-
Lunds universitet