onr:"swepub:oai:research.chalmers.se:4e478c65-a59f-4c91-af27-760b98711a2f"
Sökning: onr:"swepub:oai:research.chalmers.se:4e478c65-a59f-4c91-af27-760b98711a2f" > A CRISPR activation...
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
A CRISPR activation and interference toolkit for industrial Saccharomyces cerevisiae strain KE6-12
-
- Cámara, Elena, 1985 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Lenitz Etxaburu, Ibai, 1994 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Nygård, Yvonne, 1986 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
- (creator_code:org_t)
- 2020-09-03
- 2020
- Engelska.
- Ingår i: Scientific Reports. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2045-2322 .- 2045-2322. ; 10:1
- Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Recent advances in CRISPR/Cas9 based genome editing have considerably advanced genetic engineering of industrial yeast strains. In this study, we report the construction and characterization of a toolkit for CRISPR activation and interference (CRISPRa/i) for a polyploid industrial yeast strain. In the CRISPRa/i plasmids that are available in high and low copy variants, dCas9 is expressed alone, or as a fusion with an activation or repression domain; VP64, VPR or Mxi1. The sgRNA is introduced to the CRISPRa/i plasmids from a double stranded oligonucleotide by in vivo homology-directed repair, allowing rapid transcriptional modulation of new target genes without cloning. The CRISPRa/i toolkit was characterized by alteration of expression of fluorescent protein-encoding genes under two different promoters allowing expression alterations up to similar to 2.5-fold. Furthermore, we demonstrated the usability of the CRISPRa/i toolkit by improving the tolerance towards wheat straw hydrolysate of our industrial production strain. We anticipate that our CRISPRa/i toolkit can be widely used to assess novel targets for strain improvement and thus accelerate the design-build-test cycle for developing various industrial production strains.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Mikrobiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Microbiology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Cámara, Elena, 1 ...
- Lenitz Etxaburu, ...
- Nygård, Yvonne, ...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Biokemi och mole ...
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Mikrobiologi
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Bioinformatik oc ...
- Artiklar i publikationen
- Scientific Repor ...
- Av lärosätet
- Chalmers tekniska högskola
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
