A Complex Structural Variation on Chromosome 27 Leads to the Ectopic Expression of HOXB8 and the Muffs and Beard Phenotype in Chickens

doi:10.1371/journal.pgen.1006071

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: WFRF:(Shu Dingming) > (2016) > A Complex Structura...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Guo, Ying (författare)

A Complex Structural Variation on Chromosome 27 Leads to the Ectopic Expression of HOXB8 and the Muffs and Beard Phenotype in Chickens

E-artikel/E-kapitelEngelska2016

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2016

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:20186971
http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-298145uri
urn:nbn:se:uu:diva-298145urn
10.1371/journal.pgen.1006071doi

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska

Ingår i deldatabas

deldatabas:Eplk_tEPLK

Anmärkningar

Published
gratis
Muffs and beard (Mb) is a phenotype in chickens where groups of elongated feathers gather from both sides of the face (muffs) and below the beak (beard). It is an autosomal, incomplete dominant phenotype encoded by the Muffs and beard (Mb) locus. Here we use genome-wide association (GWA) analysis, linkage analysis, Identity-by-Descent (IBD) mapping, array-CGH, genome re-sequencing and expression analysis to show that the Mb allele causing the Mb phenotype is a derived allele where a complex structural variation (SV) on GGA27 leads to an altered expression of the gene HOXB8. This Mb allele was shown to be completely associated with the Mb phenotype in nine other independent Mb chicken breeds. The Mb allele differs from the wild-type mb allele by three duplications, one in tandem and two that are translocated to that of the tandem repeat around 1.70 Mb on GGA27. The duplications contain total seven annotated genes and their expression was tested during distinct stages of Mb morphogenesis. A continuous high ectopic expression of HOXB8 was found in the facial skin of Mb chickens, strongly suggesting that HOXB8 directs this regional feather-development. In conclusion, our results provide an interesting example of how genomic structural rearrangements alter the regulation of genes leading to novel phenotypes. Further, it again illustrates the value of utilizing derived phenotypes in domestic animals to dissect the genetic basis of developmental traits, herein providing novel insights into the likely role of HOXB8 in feather development and differentiation.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Gu, Xiaorong (författare)
Sheng, Zheya (författare)
Wang, Yanqiang (författare)
Luo, Chenglong (författare)
Liu, Ranran (författare)
Qu, Hao (författare)
Shu, Dingming (författare)
Wen, Jie (författare)
Crooijmans, Richard P M A (författare)
Carlborg, Örjan (författare)
Zhao, Yiqiang (författare)
Hu, Xiaoxiang (författare)
Li, Ning (författare)
Uppsala universitetMedicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet (utgivare)
Carlborg (medarbetare)

Sammanhörande titlar

Del av/supplement till:channel record
Ingår i:VärdpublikationPLoS Genetics12:61553-7390

Internetlänk

Hitta via bibliotek

PLoS Genetics (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Guo, Ying; Gu, Xiaorong; Sheng, Zheya; Wang, Yanqiang; Luo, Chenglong; Liu, Ranran; visa fler...; Qu, Hao; Shu, Dingming; Wen, Jie; Crooijmans, Rich ...; Carlborg, Örjan; Zhao, Yiqiang; Hu, Xiaoxiang; Li, Ning; visa färre...

Av lärosätet: Swepub_uni:_t

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se