Sökning: WFRF:(Betsholtz Christer) >
Integrative functio...
-
Miller, Clint L.
(författare)
Integrative functional genomics identifies regulatory mechanisms at coronary artery disease loci
- E-artikel/E-kapitelEngelska2016
Förlag, utgivningsår, omfång ...
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:20187850
-
http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-307963uri
-
urn:nbn:se:uu:diva-307963urn
-
10.1038/ncomms12092doi
Kompletterande språkuppgifter
Ingår i deldatabas
Anmärkningar
-
Published
-
Torsten Söderbergs stiftelse
-
Ragnar Söderbergs stiftelse
-
Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse
-
AstraZeneca
-
NIH (National Institute of Health) [R01HL125863 R01HL71207]
-
Vetenskapsrådet
-
Karolinska Institutets Forskningsstiftelse
-
gratis
-
Coronary artery disease (CAD) is the leading cause of mortality and morbidity, driven by both genetic and environmental risk factors. Meta-analyses of genome-wide association studies have identified 4150 loci associated with CAD and myocardial infarction susceptibility in humans. A majority of these variants reside in non-coding regions and are co-inherited with hundreds of candidate regulatory variants, presenting a challenge to elucidate their functions. Herein, we use integrative genomic, epigenomic and transcriptomic profiling of perturbed human coronary artery smooth muscle cells and tissues to begin to identify causal regulatory variation and mechanisms responsible for CAD associations. Using these genome-wide maps, we prioritize 64 candidate variants and perform allele-specific binding and expression analyses at seven top candidate loci: 9p21.3, SMAD3, PDGFD, IL6R, BMP1, CCDC97/TGFB1 and LMOD1. We validate our findings in expression quantitative trait loci cohorts, which together reveal new links between CAD associations and regulatory function in the appropriate disease context.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Pjanic, Milos
(författare)
-
Wang, Ting
(författare)
-
Nguyen, Trieu
(författare)
-
Cohain, Ariella
(författare)
-
Lee, Jonathan D.
(författare)
-
Perisic, Ljubica
(författare)
-
Hedin, Ulf
(författare)
-
Kundu, Ramendra K.
(författare)
-
Majmudar, Deshna
(författare)
-
Kim, Juyong B.
(författare)
-
Wang, Oliver
(författare)
-
Betsholtz, Christer
(författare)
-
Ruusalepp, Arno
(författare)
-
Franzen, Oscar
(författare)
-
Assimes, Themistocles L.
(författare)
-
Montgomery, Stephen B.
(författare)
-
Schadt, Eric E.
(författare)
-
Bjorkegren, Johan L. M.
(författare)
-
Quertermous, Thomas
(författare)
-
Uppsala universitetMedicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet
(utgivare)
Sammanhörande titlar
-
Del av/supplement till:channel record
-
Ingår i:VärdpublikationNature Communications72041-1723
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Miller, Clint L.
-
Pjanic, Milos
-
Wang, Ting
-
Nguyen, Trieu
-
Cohain, Ariella
-
Lee, Jonathan D.
-
visa fler...
-
Perisic, Ljubica
-
Hedin, Ulf
-
Kundu, Ramendra ...
-
Majmudar, Deshna
-
Kim, Juyong B.
-
Wang, Oliver
-
Betsholtz, Chris ...
-
Ruusalepp, Arno
-
Franzen, Oscar
-
Assimes, Themist ...
-
Montgomery, Step ...
-
Schadt, Eric E.
-
Bjorkegren, Joha ...
-
Quertermous, Tho ...
-
visa färre...
- Av lärosätet
-
Swepub_uni:_t