The Norway spruce genome sequence and conifer genome evolution

doi:10.1038/nature12211

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: WFRF:(Vezzi Francesco) > The Norway spruce g...

1 av 7
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Nystedt, Bjorn (författare)

The Norway spruce genome sequence and conifer genome evolution

E-artikel/E-kapitelEngelska2013

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2013

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:22098942
http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-203287uri
urn:nbn:se:uu:diva-203287urn
10.1038/nature12211doi

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska

Ingår i deldatabas

deldatabas:Eplk_tEPLK

Anmärkningar

Published
gratis
Conifers have dominated forests for more than 200 million years and are of huge ecological and economic importance. Here we present the draft assembly of the 20-gigabase genome of Norway spruce (Picea abies), the first available for any gymnosperm. The number of well-supported genes (28,354) is similar to the >100 times smaller genome of Arabidopsis thaliana, and there is no evidence of a recent whole-genome duplication in the gymnosperm lineage. Instead, the large genome size seems to result from the slow and steady accumulation of a diverse set of long-terminal repeat transposable elements, possibly owing to the lack of an efficient elimination mechanism. Comparative sequencing of Pinus sylvestris, Abies sibirica, Juniperus communis, Taxus baccata and Gnetum gnemon reveals that the transposable element diversity is shared among extant conifers. Expression of 24-nucleotide small RNAs, previously implicated in transposable element silencing, is tissue-specific and much lower than in other plants. We further identify numerous long (>10,000 base pairs) introns, gene-like fragments, uncharacterized long non-coding RNAs and short RNAs. This opens up new genomic avenues for conifer forestry and breeding.

Ämnesord och genrebeteckningar

Natural Sciences hsv
Naturvetenskap hsv

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Street, Nathaniel R. (författare)
Wetterbom, Anna (författare)
Zuccolo, Andrea (författare)
Lin, Yao-Cheng (författare)
Scofield, Douglas G. (författare)
Vezzi, Francesco (författare)
Delhomme, Nicolas (författare)
Giacomello, Stefania (författare)
Alexeyenko, Andrey (författare)
Vicedomini, Riccardo (författare)
Sahlin, Kristoffer (författare)
Sherwood, Ellen (författare)
Elfstrand, Malin (författare)
Gramzow, Lydia (författare)
Holmberg, Kristina (författare)
Hallman, Jimmie (författare)
Keech, Olivier (författare)
Klasson, Lisa (författare)
Koriabine, Maxim (författare)
Kucukoglu, Melis (författare)
Kaller, Max (författare)
Luthman, Johannes (författare)
Lysholm, Fredrik (författare)
Niittyla, Totte (författare)
Olson, Ake (författare)
Rilakovic, Nemanja (författare)
Ritland, Carol (författare)
Rossello, Josep A. (författare)
Sena, Juliana (författare)
Svensson, Thomas (författare)
Talavera-Lopez, Carlos (författare)
Theissen, Guenter (författare)
Tuominen, Hannele (författare)
Vanneste, Kevin (författare)
Wu, Zhi-Qiang (författare)
Zhang, Bo (författare)
Zerbe, Philipp (författare)
Arvestad, Lars (författare)
Bhalerao, Rishikesh (författare)
Bohlmann, Joerg (författare)
Bousquet, Jean (författare)
Gil, Rosario Garcia (författare)
Hvidsten, Torgeir R. (författare)
de Jong, Pieter (författare)
MacKay, John282204 (författare)
Morgante, Michele (författare)
Ritland, Kermit (författare)
Sundberg, Bjorn (författare)
Thompson, Stacey Lee (författare)
Van de Peer, Yves (författare)
Andersson, Bjorn (författare)
Nilsson, Ove (författare)
Ingvarsson, Par K. (författare)
Lundeberg, Joakim (författare)
Jansson, Stefan (författare)
Uppsala universitetTeknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet (utgivare)

Sammanhörande titlar

Del av/supplement till:channel record
Ingår i:VärdpublikationNature497:7451, 579-5840028-0836

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Nature (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 7
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Nystedt, Bjorn; Street, Nathanie ...; Wetterbom, Anna; Zuccolo, Andrea; Lin, Yao-Cheng; Scofield, Dougla ...; visa fler...; Vezzi, Francesco; Delhomme, Nicola ...; Giacomello, Stef ...; Alexeyenko, Andr ...; Vicedomini, Ricc ...; Sahlin, Kristoff ...; Sherwood, Ellen; Elfstrand, Malin; Gramzow, Lydia; Holmberg, Kristi ...; Hallman, Jimmie; Keech, Olivier; Klasson, Lisa; Koriabine, Maxim; Kucukoglu, Melis; Kaller, Max; Luthman, Johanne ...; Lysholm, Fredrik; Niittyla, Totte; Olson, Ake; Rilakovic, Neman ...; Ritland, Carol; Rossello, Josep ...; Sena, Juliana; Svensson, Thomas; Talavera-Lopez, ...; Theissen, Guente ...; Tuominen, Hannel ...; Vanneste, Kevin; Wu, Zhi-Qiang; Zhang, Bo; Zerbe, Philipp; Arvestad, Lars; Bhalerao, Rishik ...; Bohlmann, Joerg; Bousquet, Jean; Gil, Rosario Gar ...; Hvidsten, Torgei ...; de Jong, Pieter; MacKay, John; Morgante, Michel ...; Ritland, Kermit; Sundberg, Bjorn; Thompson, Stacey ...; Van de Peer, Yve ...; Andersson, Bjorn; Nilsson, Ove; Ingvarsson, Par ...; Lundeberg, Joaki ...; Jansson, Stefan; visa färre...

Av lärosätet: Swepub_uni:_t

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se