Sökning: WFRF:(Carén Helena 1979) >
Human Pluripotent S...
Human Pluripotent Stem Cell-Derived Hepatocytes Show Higher Transcriptional Correlation with Adult Liver Tissue than with Fetal Liver Tissue
-
- Ghosheh, Nidal, 1975- (författare)
- Högskolan i Skövde,Institutionen för biovetenskap,Forskningsmiljön Systembiologi,Translationell bioinformatik, Translational Bioinformatics
-
- Küppers-Munther, Barbara (författare)
- Takara Bio Europe AB, Gothenburg, Sweden
-
- Asplund, Annika (författare)
- Takara Bio Europe AB, Gothenburg, Sweden
-
visa fler...
-
- Andersson, Christian X. (författare)
- Takara Bio Europe AB, Gothenburg, Sweden
-
- Björquist, Petter (författare)
- VeriGraft AB, Gothenburg, Sweden
-
- Andersson, Tommy B. (författare)
- Cardiovascular Renal and Metabolism, Innovative Medicines and Early Development Biotech Unit, AstraZeneca, Mölndal, Sweden / Department of Physiology and Pharmacology, Section of Pharmacogenetics, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden
-
- Carén, Helena, 1979 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Sahlgrenska Cancer Center,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Department of Laboratory Medicine
-
- Simonsson, Stina, 1969 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för laboratoriemedicin,Department of Laboratory Medicine
-
- Sartipy, Peter (författare)
- Högskolan i Skövde,Institutionen för biovetenskap,Forskningsmiljön Systembiologi,Late Stage Cardiovascular, Renal, and Metabolism, R&D BioPharmaceuticals, AstraZeneca, Mölndal, Sweden,Translationell bioinformatik, Translational Bioinformatics
-
- Synnergren, Jane (författare)
- Högskolan i Skövde,Institutionen för biovetenskap,Forskningsmiljön Systembiologi,Translationell bioinformatik, Translational Bioinformatics
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2020-03-02
- 2020
- Engelska.
-
Ingår i: ACS Omega. - : American Chemical Society (ACS). - 2470-1343. ; 5:10, s. 4816-4827
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://his.diva-por... (primary) (Raw object)
-
https://pubs.acs.org...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Human pluripotent stem cell-derived hepatocytes (hPSC-HEP) display many properties of mature hepatocytes, including expression of important genes of the drug metabolizing machinery, glycogen storage, and production of multiple serum proteins. To this date, hPSC-HEP do not, however, fully recapitulate the complete functionality of in vivo mature hepatocytes. In this study, we applied versatile bioinformatic algorithms, including functional annotation and pathway enrichment analyses, transcription factor binding-site enrichment, and similarity and correlation analyses, to datasets collected from different stages during hPSC-HEP differentiation and compared these to developmental stages and tissues from fetal and adult human liver. Our results demonstrate a high level of similarity between the in vitro differentiation of hPSC-HEP and in vivo hepatogenesis. Importantly, the transcriptional correlation of hPSC-HEP with adult liver (AL) tissues was higher than with fetal liver (FL) tissues (0.83 and 0.70, respectively). Functional data revealed mature features of hPSC-HEP including cytochrome P450 enzymes activities and albumin secretion. Moreover, hPSC-HEP showed expression of many genes involved in drug absorption, distribution, metabolism, and excretion. Despite the high similarities observed, we identified differences of specific pathways and regulatory players by analyzing the gene expression between hPSC-HEP and AL. These findings will aid future intervention and improvement of in vitro hepatocyte differentiation protocol in order to generate hepatocytes displaying the complete functionality of mature hepatocytes. Finally, on the transcriptional level, our results show stronger correlation and higher similarity of hPSC-HEP to AL than to FL. In addition, potential targets for further functional improvement of hPSC-HEP were also identified.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Gastroenterologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Gastroenterology and Hepatology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
Nyckelord
- Bioinformatik
- Bioinformatics
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Ghosheh, Nidal, ...
-
Küppers-Munther, ...
-
Asplund, Annika
-
Andersson, Chris ...
-
Björquist, Pette ...
-
Andersson, Tommy ...
-
visa fler...
-
Carén, Helena, 1 ...
-
Simonsson, Stina ...
-
Sartipy, Peter
-
Synnergren, Jane
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Gastroenterologi
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Bioinformatik oc ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
- Artiklar i publikationen
-
ACS Omega
- Av lärosätet
-
Högskolan i Skövde
-
Karolinska Institutet
-
Göteborgs universitet