Sökning: L773:1548 7091 OR L773:1548 7105 >
Binning metagenomic...
Binning metagenomic contigs by coverage and composition
-
- Alneberg, Johannes (författare)
- KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Bjarnason, Brynjar Smári (författare)
- KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- de Bruijn, Ino (författare)
- KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Bioinformatics Infrastructure for Life Sciences (BILS), Sweden
-
visa fler...
-
Schirmer, Melanie (författare)
-
Quick, Joshua (författare)
-
Ijaz, Umer Z. (författare)
-
Lahti, Leo (författare)
-
Loman, Nicholas J. (författare)
-
- Andersson, Anders F. (författare)
- KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
Quince, Christopher (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2014
- 2014
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Methods. - 1548-7091 .- 1548-7105. ; 11:11, s. 1144-1146
- Relaterad länk:
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Shotgun sequencing enables the reconstruction of genomes from complex microbial communities, but because assembly does not reconstruct entire genomes, it is necessary to bin genome fragments. Here we present CONCOCT, a new algorithm that combines sequence composition and coverage across multiple samples, to automatically cluster contigs into genomes. We demonstrate high recall and precision on artificial as well as real human gut metagenome data sets.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
Nyckelord
- Sequences
- Genomes
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Alneberg, Johann ...
-
Bjarnason, Brynj ...
-
de Bruijn, Ino
-
Schirmer, Melani ...
-
Quick, Joshua
-
Ijaz, Umer Z.
-
visa fler...
-
Lahti, Leo
-
Loman, Nicholas ...
-
Andersson, Ander ...
-
Quince, Christop ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Methods
- Av lärosätet
-
Kungliga Tekniska Högskolan