Sökning: (L773:1932 6203) srt2:(2015-2019) pers:(Nilsson Peter) >
Defining the Human ...
Defining the Human Brain Proteome Using Transcriptomics and Antibody-Based Profiling with a Focus on the Cerebral Cortex
-
- Sjöstedt, Evelina (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Institutionen för immunologi, genetik och patologi
-
- Fagerberg, Linn (författare)
- KTH,Proteomik och nanobioteknologi
-
- Hallström, Björn M. (författare)
- KTH,Proteomik och nanobioteknologi
-
visa fler...
-
- Häggmark, Anna (författare)
- KTH,Proteomik och nanobioteknologi
-
- Mitsios, Nicholas (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Nilsson, Peter (författare)
- KTH,Proteomik och nanobioteknologi
-
- Pontén, Fredrik (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Institutionen för immunologi, genetik och patologi
-
- Hökfelt, Tomas (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Uhlén, Mathias (författare)
- KTH,Proteomik och nanobioteknologi
-
- Mulder, Jan (författare)
- Karolinska Institutet
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2015-06-15
- 2015
- Engelska.
-
Ingår i: PLOS ONE. - : Public Library of Science (PLoS). - 1932-6203. ; 10:6
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://journals.plo...
-
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- The mammalian brain is a complex organ composed of many specialized cells, harboring sets of both common, widely distributed, as well as specialized and discretely localized proteins. Here we focus on the human brain, utilizing transcriptomics and public available Human Protein Atlas (HPA) data to analyze brain-enriched (frontal cortex) polyadenylated messenger RNA and long non-coding RNA and generate a genome-wide draft of global and cellular expression patterns of the brain. Based on transcriptomics analysis of altogether 27 tissues, we have estimated that approximately 3% (n=571) of all protein coding genes and 13% (n=87) of the long non-coding genes expressed in the human brain are enriched, having at least five times higher expression levels in brain as compared to any of the other analyzed peripheral tissues. Based on gene ontology analysis and detailed annotation using antibody-based tissue micro array analysis of the corresponding proteins, we found the majority of brain-enriched protein coding genes to be expressed in astrocytes, oligodendrocytes or in neurons with molecular properties linked to synaptic transmission and brain development. Detailed analysis of the transcripts and the genetic landscape of brainenriched coding and non-coding genes revealed brain-enriched splice variants. Several clusters of neighboring brain-enriched genes were also identified, suggesting regulation of gene expression on the chromatin level. This multi-angle approach uncovered the brainenriched transcriptome and linked genes to cell types and functions, providing novel insights into the molecular foundation of this highly specialized organ.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinsk bioteknologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Medical Biotechnology (hsv//eng)
- TEKNIK OCH TEKNOLOGIER -- Industriell bioteknik -- Medicinsk bioteknik (hsv//swe)
- ENGINEERING AND TECHNOLOGY -- Industrial Biotechnology -- Medical Biotechnology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
-
PLOS ONE
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Sjöstedt, Evelin ...
-
Fagerberg, Linn
-
Hallström, Björn ...
-
Häggmark, Anna
-
Mitsios, Nichola ...
-
Nilsson, Peter
-
visa fler...
-
Pontén, Fredrik
-
Hökfelt, Tomas
-
Uhlén, Mathias
-
Mulder, Jan
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinsk biotek ...
-
- TEKNIK OCH TEKNOLOGIER
-
TEKNIK OCH TEKNO ...
-
och Industriell biot ...
-
och Medicinsk biotek ...
- Artiklar i publikationen
-
PLOS ONE
- Av lärosätet
-
Kungliga Tekniska Högskolan
-
Uppsala universitet
-
Karolinska Institutet