Sökning: WFRF:(Mikus Maria) >
Analysis of the Cer...
Analysis of the Cerebrospinal Fluid Proteome in Alzheimer's Disease
-
- Emami Khoonsari, Payam (författare)
- Uppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin
-
- Häggmark, Anna (författare)
- KTH,Proteomik och nanobioteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Affinity Proteomics,KTH Royal Inst Technol, Sch Biotechnol, Affin Prote, Sci Life Lab, Stockholm, Sweden.
-
- Lönnberg, Maria (författare)
- Uppsala universitet,Analytisk kemi
-
visa fler...
-
- Mikus, Maria (författare)
- KTH,Proteomik och nanobioteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Affinity Proteomics,KTH Royal Inst Technol, Sch Biotechnol, Affin Prote, Sci Life Lab, Stockholm, Sweden.
-
- Kilander, Lena (författare)
- Uppsala universitet,Geriatrik
-
- Lannfelt, Lars (författare)
- Uppsala universitet,Geriatrik
-
- Bergquist, Jonas (författare)
- Uppsala universitet,Analytisk kemi
-
- Ingelsson, Martin (författare)
- Uppsala universitet,Geriatrik
-
- Nilsson, Peter (författare)
- KTH,Proteomik och nanobioteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Affinity Proteomics,KTH Royal Inst Technol, Sch Biotechnol, Affin Prote, Sci Life Lab, Stockholm, Sweden.
-
- Kultima, Kim (författare)
- Uppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin
-
- Shevchenko, Ganna (författare)
- Uppsala universitet,Analytisk kemi,Uppsala Univ, Dept Chem BMC, Analyt Chem, Uppsala, Sweden.
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2016-03-07
- 2016
- Engelska.
-
Ingår i: PLOS ONE. - : Public Library of Science (PLoS). - 1932-6203. ; 11:3
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://journals.plo...
-
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Alzheimer's disease is a neurodegenerative disorder accounting for more than 50% of cases of dementia. Diagnosis of Alzheimer's disease relies on cognitive tests and analysis of amyloid beta, protein tau, and hyperphosphorylated tau in cerebrospinal fluid. Although these markers provide relatively high sensitivity and specificity for early disease detection, they are not suitable for monitor of disease progression. In the present study, we used label-free shotgun mass spectrometry to analyse the cerebrospinal fluid proteome of Alzheimer's disease patients and non-demented controls to identify potential biomarkers for Alzheimer's disease. We processed the data using five programs (DecyderMS, Maxquant, OpenMS, PEAKS, and Sieve) and compared their results by means of reproducibility and peptide identification, including three different normalization methods. After depletion of high abundant proteins we found that Alzheimer's disease patients had lower fraction of low-abundance proteins in cerebrospinal fluid compared to healthy controls (p<0.05). Consequently, global normalization was found to be less accurate compared to using spiked-in chicken ovalbumin for normalization. In addition, we determined that Sieve and OpenMS resulted in the highest reproducibility and PEAKS was the programs with the highest identification performance. Finally, we successfully verified significantly lower levels (p<0.05) of eight proteins (A2GL, APOM, C1QB, C1QC, C1S, FBLN3, PTPRZ, and SEZ6) in Alzheimer's disease compared to controls using an antibody-based detection method. These proteins are involved in different biological roles spanning from cell adhesion and migration, to regulation of the synapse and the immune system.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Neurovetenskaper (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Neurosciences (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Neurologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Neurology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Geriatrik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Geriatrics (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
-
PLOS ONE
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Emami Khoonsari, ...
-
Häggmark, Anna
-
Lönnberg, Maria
-
Mikus, Maria
-
Kilander, Lena
-
Lannfelt, Lars
-
visa fler...
-
Bergquist, Jonas
-
Ingelsson, Marti ...
-
Nilsson, Peter
-
Kultima, Kim
-
Shevchenko, Gann ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Neurovetenskaper
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Neurologi
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Geriatrik
- Artiklar i publikationen
-
PLOS ONE
- Av lärosätet
-
Kungliga Tekniska Högskolan
-
Uppsala universitet