Multimodal brain tumor segmentation with normal appearance autoencoder

Astaraki, Mehdi,PhD Student,1984-KTH,Medicinsk avbildning,Karolinska Institutet, Department of Oncology-Pathology Karolinska Universitetssjukhuset Solna Sweden (författare)

QC 20210622
We propose a hybrid segmentation pipeline based on the autoencoders’ capability of anomaly detection. To this end, we, first, introduce a new augmentation technique to generate synthetic paired images. Gaining advantage from the paired images, we propose a Normal Appearance Autoencoder (NAA) that is able to remove tumors and thus reconstruct realistic-looking, tumor-free images. After estimating the regions where the abnormalities potentially exist, a segmentation network is guided toward the candidate region. We tested the proposed pipeline on the BraTS 2019 database. The preliminary results indicate that the proposed model improved the segmentation accuracy of brain tumor subregions compared to the U-Net model.

TEKNIK OCH TEKNOLOGIER Medicinteknik Medicinsk bildbehandling hsv//swe
ENGINEERING AND TECHNOLOGY Medical Engineering Medical Image Processing hsv//eng
Brain tumor segmentation
Variational Autoencoder
Paired-image generation
Medicinsk teknologi
Medical Technology

Wang, Chunliang,1980-KTH,Medicinsk avbildning(Swepub:kth)u1tbkeej (författare)
Carrizo, GarrizoKTH,Medicinsk avbildning(Swepub:kth)u16pzorm (författare)
Toma-Dasu, IulianaKarolinska Institutet, Department of Oncology-Pathology Karolinska Universitetssjukhuset Solna Sweden (författare)
Smedby, Örjan,Professor,1956-KTH,Medicinsk avbildning(Swepub:kth)u1vc2uzb (författare)
KTHMedicinsk avbildning (creator_code:org_t)

Ingår i:International MICCAI Brainlesion WorkshopCham : Springer Nature, s. 316-323

Av författaren/redakt...: Astaraki, Mehdi, ...; Wang, Chunliang, ...; Carrizo, Garrizo; Toma-Dasu, Iulia ...; Smedby, Örjan, P ...

Om ämnet

TEKNIK OCH TEKNOLOGIER: TEKNIK OCH TEKNO ...; och Medicinteknik; och Medicinsk bildbe ...

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.