SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Marklund Emelie)
 

Sökning: WFRF:(Marklund Emelie) > The spatial landsca...

  • Erickson, AndrewNuffield Department of Surgical Sciences, University of Oxford, UK. (författare)

The spatial landscape of clonal somatic mutations in benign and malignant tissue

  • BokEngelska

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:kth-304598
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-304598URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:vet swepub-contenttype
  • Ämneskategori:ovr swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • QC 20211116
  • Defining the transition from benign to malignant tissue is fundamental to improve early diagnosis of cancer. Here, we provide an unsupervised approach to study spatial genome integrity in situ to gain molecular insight into clonal relationships. We employed spatially resolved transcriptomics to infer spatial copy number variations in >120 000 regions across multiple organs, in benign and malignant tissues. We demonstrate that genome-wide copy number variation reveals distinct clonal patterns within tumours and in nearby benign tissue. Our results suggest a model for how genomic instability arises in histologically benign tissue that may represent early events in cancer evolution. We highlight the power of an unsupervised approach to capture the molecular and spatial continuums in a tissue context and challenge the rationale for treatment paradigms, including focal therapy.

Ämnesord och genrebeteckningar

  • Biotechnology
  • Bioteknologi

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Berglund, EmelieKTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:kth)u19v38i6 (författare)
  • He, MengxiaoKTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:kth)u17jh27g (författare)
  • Marklund, MajaKTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:kth)u19prj16 (författare)
  • Mirzazadeh, RezaKTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi(Swepub:kth)u1z0z7ka (författare)
  • Schultz, NiklasScience for Life Laboratory, Department of Oncology-Pathology, Karolinska Institutet, Solna, Sweden. (författare)
  • Bergenstrahle, LudvigKTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi(Swepub:kth)u1f4ltny (författare)
  • Kvastad, LindaKTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi(Swepub:kth)u1fok912 (författare)
  • Andersson, AlmaKTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi(Swepub:kth)u15avt37 (författare)
  • Bergenstråhle, JosephKTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi(Swepub:kth)u1ck6nue (författare)
  • Larsson, LudvigKTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi(Swepub:kth)u13lw4hm (författare)
  • Shamikh, AliaDepartment of Oncology-Pathology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden. Department of Clinical Pathology and Cytology, Karolinska University Hospital, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Basmaci, ElisaDepartment of Oncology-Pathology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden. Department of Clinical Pathology and Cytology, Karolinska University Hospital, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Diaz De Ståhl, TeresitaDepartment of Oncology-Pathology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden. Department of Clinical Pathology and Cytology, Karolinska University Hospital, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Rajakumar, TimothyNuffield Department of Surgical Sciences, University of Oxford, UK. (författare)
  • Thrane, KimKTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi(Swepub:kth)u1uojhlo (författare)
  • Ji, Andrew LProgram in Epithelial Biology, Stanford University School of Medicine, Stanford, CA, USA. (författare)
  • Khavari, Paul AProgram in Epithelial Biology, Stanford University School of Medicine, Stanford, CA, USA. (författare)
  • Tarish, FirazScience for Life Laboratory, Department of Oncology-Pathology, Karolinska Institutet, Solna, Sweden. (författare)
  • Tanoglidi, AnnaDepartment of Clinical Pathology, University Uppsala Hospital, Uppsala, Sweden. (författare)
  • Maaskola, JonasKTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi(Swepub:kth)u1a8gise (författare)
  • Colling, RichardNuffield Department of Surgical Sciences, University of Oxford, UK. Department of Cellular Pathology, Oxford University Hospitals NHS Foundation Trust, UK. (författare)
  • Mirtti, TuomasDepartment of Pathology, University of Helsinki & Helsinki University Hospital, Finland. Research Program in Systems Oncology, Faculty of Medicine, University of Helsinki, Finland. iCAN-Digital Precision Cancer Medicine Flagship, Helsinki, Finland. (författare)
  • Hamdy, Freddie CNuffield Department of Surgical Sciences, University of Oxford, UK. Department of Urology, Oxford University Hospitals NHS Foundation Trust, UK. (författare)
  • Woodcock, Dan JNuffield Department of Surgical Sciences, University of Oxford, UK. Big Data Institute, Old Road Campus, University of Oxford, UK. (författare)
  • Helleday, ThomasScience for Life Laboratory, Department of Oncology-Pathology, Karolinska Institutet, Solna, Sweden. Weston Park Cancer Centre, Department of Oncology and Metabolism, University of Sheffield, UK. (författare)
  • Mills, Ian GNuffield Department of Surgical Sciences, University of Oxford, UK. (författare)
  • Lamb, Alastair DNuffield Department of Surgical Sciences, University of Oxford, UK. Department of Urology, Oxford University Hospitals NHS Foundation Trust, UK. (författare)
  • Lundeberg, JoakimKTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi(Swepub:kth)u1qkn9kw (författare)
  • Nuffield Department of Surgical Sciences, University of Oxford, UK.Genteknologi (creator_code:org_t)

Internetlänk

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy