Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-309446" >
Three-dimensional s...
Three-dimensional spatial transcriptomics uncovers cell type localizations in the human rheumatoid arthritis synovium
-
- Vickovic, Sanja (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Broad Institute of MIT and Harvard, USA; Massachusetts Institute of Technology, USA; New York Genome Center, USA
-
- Schapiro, Denis (författare)
- Broad Inst MIT & Harvard, Klarman Cell Observ, Cambridge, MA 02142 USA.;Harvard Med Sch, Lab Syst Pharmacol, Boston, MA 02115 USA.;Heidelberg Univ Hosp, Sci Life Lab, Fac Med, Heidelberg, Germany.;Heidelberg Univ Hosp, Inst Pathol, Fac Med, Heidelberg, Germany.;Heidelberg Univ, Heidelberg, Germany.
-
- Carlberg, Konstantin (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi
-
visa fler...
-
- Lötstedt, Britta (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi,Broad Inst MIT & Harvard, Klarman Cell Observ, Cambridge, MA 02142 USA.
-
- Larsson, Ludvig (författare)
- KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Hildebrandt, Franziska (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut
-
- Korotkova, Marina (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Hensvold, Aase H. (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Catrina, Anca, I (författare)
- Karolinska Inst, Ctr Mol Med, Dept Med, Div Rheumatol, Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Unit Rheumatol, Stockholm, Sweden.
-
- Sorger, Peter K. (författare)
- Harvard Med Sch, Lab Syst Pharmacol, Boston, MA 02115 USA.
-
- Malmstrom, Vivianne (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Regev, Aviv (författare)
- Broad Inst MIT & Harvard, Klarman Cell Observ, Cambridge, MA 02142 USA.;MIT, Howard Hughes Med Inst, Cambridge, MA USA.;MIT, Dept Biol, Koch Inst Integrat Canc Res, Cambridge, MA USA.;Genentech Inc, 1 DNA Way, San Francisco, CA USA.
-
- Ståhl, Patrik, Dr. (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2022-02-11
- 2022
- Engelska.
-
Ingår i: Communications Biology. - : Springer Nature. - 2399-3642. ; 5:1
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://www.nature.c...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- The inflamed rheumatic joint is a highly heterogeneous and complex tissue with dynamic recruitment and expansion of multiple cell types that interact in multifaceted ways within a localized area. Rheumatoid arthritis synovium has primarily been studied either by immunostaining or by molecular profiling after tissue homogenization. Here, we use Spatial Transcriptomics, where tissue-resident RNA is spatially labeled in situ with barcodes in a transcriptome-wide fashion, to study local tissue interactions at the site of chronic synovial inflammation. We report comprehensive spatial RNA-Seq data coupled to cell type-specific localization patterns at and around organized structures of infiltrating leukocyte cells in the synovium. Combining morphological features and high-throughput spatially resolved transcriptomics may be able to provide higher statistical power and more insights into monitoring disease severity and treatment-specific responses in seropositive and seronegative rheumatoid arthritis. Sanja Vickovic et al. use spatial transcriptomics to probe the local synovial tissue interactions in rheumatoid arthritis (RA) patients. Their results provide a valuable resource to understand the spatial organisation of cell populations in the synovium in the context of RA-associated inflammation.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Reumatologi och inflammation (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Rheumatology and Autoimmunity (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Vickovic, Sanja
-
Schapiro, Denis
-
Carlberg, Konsta ...
-
Lötstedt, Britta
-
Larsson, Ludvig
-
Hildebrandt, Fra ...
-
visa fler...
-
Korotkova, Marin ...
-
Hensvold, Aase H ...
-
Catrina, Anca, I
-
Sorger, Peter K.
-
Malmstrom, Vivia ...
-
Regev, Aviv
-
Ståhl, Patrik, D ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Reumatologi och ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
- Artiklar i publikationen
-
Communications B ...
- Av lärosätet
-
Kungliga Tekniska Högskolan
-
Stockholms universitet
-
Karolinska Institutet