SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Van den Bossche Tim)
 

Sökning: WFRF:(Van den Bossche Tim) > Proteomics Standard...

  • LeDuc, Richard D.Northwestern Univ, Natl Resource Translat & Dev Prote, Evanston, IL 60611 USA. (författare)

Proteomics Standards Initiative's ProForma 2.0 : Unifying the Encoding of Proteoforms and Peptidoforms br

  • Artikel/kapitelEngelska2022

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2022-03-15
  • American Chemical Society (ACS),2022
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:kth-312239
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-312239URI
  • https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.1c00771DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • QC 20220516
  • It is important for the proteomics community to have a standardizedmanner to represent all possible variations of a protein or peptide primary sequence,including natural, chemically induced, and artifactual modifications. The HumanProteome Organization Proteomics Standards Initiative in collaboration with severalmembers of the Consortium for Top-Down Proteomics (CTDP) has developed astandard notation called ProForma 2.0, which is a substantial extension of the originalProForma notation developed by the CTDP. ProForma 2.0 aims to unify therepresentation of proteoforms and peptidoforms. ProForma 2.0 supports use casesneeded for bottom-up and middle-/top-down proteomics approaches and allows theencoding of highly modified proteins and peptides using a human- and machine-readable string. ProForma 2.0 can be used to represent protein modifications in a specified or ambiguous location, designated bymass shifts, chemical formulas, or controlled vocabulary terms, including cross-links (natural and chemical) and atomic isotopes.Notational conventions are based on public controlled vocabularies and ontologies. The most up-to-date full specification documentand information about software implementations are available athttp://psidev.info/proforma.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Deutsch, Eric W.Inst Syst Biol, Seattle, WA 98109 USA. (författare)
  • Binz, Pierre-AlainLausanne Univ Hosp, Clin Chem Serv, CH-1011 Lausanne, Switzerland. (författare)
  • Fellers, Ryan T.Northwestern Univ, Natl Resource Translat & Dev Prote, Evanston, IL 60611 USA. (författare)
  • Cesnik, Anthony J.KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Cellulär och klinisk proteomik,Stanford Univ, Dept Genet, Stanford, CA 94305 USA.;Chan Zuckerberg Biohub, San Francisco, CA 94158 USA.(Swepub:kth)u1wqgmcl (författare)
  • Klein, Joshua A.Boston Univ, Program Bioinformat, Boston, MA 02215 USA. (författare)
  • Van den Bossche, TimVIB UGent Ctr Med Biotechnol, B-9052 Ghent, Belgium.;Univ Ghent, Fac Med & Hlth Sci, Dept Biomol Med, B-9000 Ghent, Belgium. (författare)
  • Gabriels, RalfVIB UGent Ctr Med Biotechnol, B-9052 Ghent, Belgium.;Univ Ghent, Fac Med & Hlth Sci, Dept Biomol Med, B-9000 Ghent, Belgium. (författare)
  • Yalavarthi, ArshikaNorthwestern Univ, Natl Resource Translat & Dev Prote, Evanston, IL 60611 USA. (författare)
  • Perez-Riverol, YassetEMBL European Bioinformat Inst EMBL EBI, European Mol Biol Lab, Cambridge CB10 1SD, England. (författare)
  • Carver, JeremyUCSD, Ctr Computat Mass Spectrometry, Dept Comp Sci & Engn, La Jolla, CA 92093 USA.;UCSD, Skaggs Sch Pharm & Pharmaceut Sci, La Jolla, CA 92093 USA. (författare)
  • Bittremieux, WoutUCSD, Skaggs Sch Pharm & Pharmaceut Sci, La Jolla, CA 92093 USA.;UCSD, Ctr Computat Mass Spectrometry, La Jolla, CA 92093 USA. (författare)
  • Kawano, ShinToyama Univ Int Studies, Toyama, Toyama 9301292, Japan.;Res Org Informat & Syst, Joint Support Ctr Data Sci Res, Database Ctr Life Sci, Kashiwa, Chiba 2770871, Japan. (författare)
  • Pullman, BenjaminUCSD, Ctr Computat Mass Spectrometry, La Jolla, CA 92093 USA.;UCSD, Dept Comp Sci & Engn, La Jolla, CA 92093 USA. (författare)
  • Bandeira, NunoUCSD, Ctr Computat Mass Spectrometry, Dept Comp Sci & Engn, La Jolla, CA 92093 USA.;UCSD, Skaggs Sch Pharm & Pharmaceut Sci, La Jolla, CA 92093 USA. (författare)
  • Kelleher, Neil L.Northwestern Univ, Natl Resource Translat & Dev Prote, Evanston, IL 60611 USA. (författare)
  • Thomas, Paul M.Northwestern Univ, Natl Resource Translat & Dev Prote, Evanston, IL 60611 USA.;AbbVie Inc, 1401 Sheridan Rd, N Chicago, IL 60064 USA. (författare)
  • Vizcaino, Juan AntonioEMBL European Bioinformat Inst EMBL EBI, European Mol Biol Lab, Cambridge CB10 1SD, England. (författare)
  • Northwestern Univ, Natl Resource Translat & Dev Prote, Evanston, IL 60611 USA.Inst Syst Biol, Seattle, WA 98109 USA. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Journal of Proteome Research: American Chemical Society (ACS)21:4, s. 1189-11951535-38931535-3907

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy