Sökning: WFRF:(Carver Jeremy) >
Proteomics Standard...
-
LeDuc, Richard D.Northwestern Univ, Natl Resource Translat & Dev Prote, Evanston, IL 60611 USA.
(författare)
Proteomics Standards Initiative's ProForma 2.0 : Unifying the Encoding of Proteoforms and Peptidoforms br
- Artikel/kapitelEngelska2022
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2022-03-15
-
American Chemical Society (ACS),2022
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:kth-312239
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-312239URI
-
https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.1c00771DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
QC 20220516
-
It is important for the proteomics community to have a standardizedmanner to represent all possible variations of a protein or peptide primary sequence,including natural, chemically induced, and artifactual modifications. The HumanProteome Organization Proteomics Standards Initiative in collaboration with severalmembers of the Consortium for Top-Down Proteomics (CTDP) has developed astandard notation called ProForma 2.0, which is a substantial extension of the originalProForma notation developed by the CTDP. ProForma 2.0 aims to unify therepresentation of proteoforms and peptidoforms. ProForma 2.0 supports use casesneeded for bottom-up and middle-/top-down proteomics approaches and allows theencoding of highly modified proteins and peptides using a human- and machine-readable string. ProForma 2.0 can be used to represent protein modifications in a specified or ambiguous location, designated bymass shifts, chemical formulas, or controlled vocabulary terms, including cross-links (natural and chemical) and atomic isotopes.Notational conventions are based on public controlled vocabularies and ontologies. The most up-to-date full specification documentand information about software implementations are available athttp://psidev.info/proforma.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Deutsch, Eric W.Inst Syst Biol, Seattle, WA 98109 USA.
(författare)
-
Binz, Pierre-AlainLausanne Univ Hosp, Clin Chem Serv, CH-1011 Lausanne, Switzerland.
(författare)
-
Fellers, Ryan T.Northwestern Univ, Natl Resource Translat & Dev Prote, Evanston, IL 60611 USA.
(författare)
-
Cesnik, Anthony J.KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Cellulär och klinisk proteomik,Stanford Univ, Dept Genet, Stanford, CA 94305 USA.;Chan Zuckerberg Biohub, San Francisco, CA 94158 USA.(Swepub:kth)u1wqgmcl
(författare)
-
Klein, Joshua A.Boston Univ, Program Bioinformat, Boston, MA 02215 USA.
(författare)
-
Van den Bossche, TimVIB UGent Ctr Med Biotechnol, B-9052 Ghent, Belgium.;Univ Ghent, Fac Med & Hlth Sci, Dept Biomol Med, B-9000 Ghent, Belgium.
(författare)
-
Gabriels, RalfVIB UGent Ctr Med Biotechnol, B-9052 Ghent, Belgium.;Univ Ghent, Fac Med & Hlth Sci, Dept Biomol Med, B-9000 Ghent, Belgium.
(författare)
-
Yalavarthi, ArshikaNorthwestern Univ, Natl Resource Translat & Dev Prote, Evanston, IL 60611 USA.
(författare)
-
Perez-Riverol, YassetEMBL European Bioinformat Inst EMBL EBI, European Mol Biol Lab, Cambridge CB10 1SD, England.
(författare)
-
Carver, JeremyUCSD, Ctr Computat Mass Spectrometry, Dept Comp Sci & Engn, La Jolla, CA 92093 USA.;UCSD, Skaggs Sch Pharm & Pharmaceut Sci, La Jolla, CA 92093 USA.
(författare)
-
Bittremieux, WoutUCSD, Skaggs Sch Pharm & Pharmaceut Sci, La Jolla, CA 92093 USA.;UCSD, Ctr Computat Mass Spectrometry, La Jolla, CA 92093 USA.
(författare)
-
Kawano, ShinToyama Univ Int Studies, Toyama, Toyama 9301292, Japan.;Res Org Informat & Syst, Joint Support Ctr Data Sci Res, Database Ctr Life Sci, Kashiwa, Chiba 2770871, Japan.
(författare)
-
Pullman, BenjaminUCSD, Ctr Computat Mass Spectrometry, La Jolla, CA 92093 USA.;UCSD, Dept Comp Sci & Engn, La Jolla, CA 92093 USA.
(författare)
-
Bandeira, NunoUCSD, Ctr Computat Mass Spectrometry, Dept Comp Sci & Engn, La Jolla, CA 92093 USA.;UCSD, Skaggs Sch Pharm & Pharmaceut Sci, La Jolla, CA 92093 USA.
(författare)
-
Kelleher, Neil L.Northwestern Univ, Natl Resource Translat & Dev Prote, Evanston, IL 60611 USA.
(författare)
-
Thomas, Paul M.Northwestern Univ, Natl Resource Translat & Dev Prote, Evanston, IL 60611 USA.;AbbVie Inc, 1401 Sheridan Rd, N Chicago, IL 60064 USA.
(författare)
-
Vizcaino, Juan AntonioEMBL European Bioinformat Inst EMBL EBI, European Mol Biol Lab, Cambridge CB10 1SD, England.
(författare)
-
Northwestern Univ, Natl Resource Translat & Dev Prote, Evanston, IL 60611 USA.Inst Syst Biol, Seattle, WA 98109 USA.
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Journal of Proteome Research: American Chemical Society (ACS)21:4, s. 1189-11951535-38931535-3907
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
LeDuc, Richard D ...
-
Deutsch, Eric W.
-
Binz, Pierre-Ala ...
-
Fellers, Ryan T.
-
Cesnik, Anthony ...
-
Klein, Joshua A.
-
visa fler...
-
Van den Bossche, ...
-
Gabriels, Ralf
-
Yalavarthi, Arsh ...
-
Perez-Riverol, Y ...
-
Carver, Jeremy
-
Bittremieux, Wou ...
-
Kawano, Shin
-
Pullman, Benjami ...
-
Bandeira, Nuno
-
Kelleher, Neil L ...
-
Thomas, Paul M.
-
Vizcaino, Juan A ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
- Artiklar i publikationen
-
Journal of Prote ...
- Av lärosätet
-
Kungliga Tekniska Högskolan