SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Jalkanen Jutta)
 

Sökning: WFRF:(Jalkanen Jutta) > An integrated singl...

  • Massier, LucasKarolinska Univ Hosp Huddinge, Karolinska Inst, Dept Med Huddinge H7, SE-14183 Huddinge, Sweden. (författare)

An integrated single cell and spatial transcriptomic map of human white adipose tissue

  • Artikel/kapitelEngelska2023

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2023-03-15
  • Springer Nature,2023
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:kth-330649
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-330649URI
  • https://doi.org/10.1038/s41467-023-36983-2DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:152901939URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • QC 20230630
  • Single-cell studies of human white adipose tissue (WAT) provide insights into the specialized cell types in the tissue. Here the authors combine publicly available and newly generated high-resolution and bulk transcriptomic results from multiple human datasets to provide a comprehensive cellular map of white adipose tissue. To date, single-cell studies of human white adipose tissue (WAT) have been based on small cohort sizes and no cellular consensus nomenclature exists. Herein, we performed a comprehensive meta-analysis of publicly available and newly generated single-cell, single-nucleus, and spatial transcriptomic results from human subcutaneous, omental, and perivascular WAT. Our high-resolution map is built on data from ten studies and allowed us to robustly identify >60 subpopulations of adipocytes, fibroblast and adipogenic progenitors, vascular, and immune cells. Using these results, we deconvolved spatial and bulk transcriptomic data from nine additional cohorts to provide spatial and clinical dimensions to the map. This identified cell-cell interactions as well as relationships between specific cell subtypes and insulin resistance, dyslipidemia, adipocyte volume, and lipolysis upon long-term weight changes. Altogether, our meta-map provides a rich resource defining the cellular and microarchitectural landscape of human WAT and describes the associations between specific cell types and metabolic states.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Jalkanen, JuttaKarolinska Institutet (författare)
  • Elmastas, MerveKarolinska Univ Hosp Huddinge, Karolinska Inst, Dept Med Huddinge H7, SE-14183 Huddinge, Sweden. (författare)
  • Zhong, JiaweiKarolinska Univ Hosp Huddinge, Karolinska Inst, Dept Med Huddinge H7, SE-14183 Huddinge, Sweden. (författare)
  • Wang, TongtongSwiss Fed Inst Technol, Dept Hlth Sci & Technol, Inst Food Nutr & Hlth, Lab Translat Nutr Biol, Schwerzenbach, Switzerland. (författare)
  • Nankam, Pamela A. Nono A.Univ Leipzig, Helmholtz Inst Metab Obes & Vasc Res HI MAG, Helmholtz Zentrum Munchen, Leipzig, Germany.;Univ Hosp Leipzig, Leipzig, Germany. (författare)
  • Frendo-Cumbo, ScottKarolinska Univ Hosp Huddinge, Karolinska Inst, Dept Med Huddinge H7, SE-14183 Huddinge, Sweden. (författare)
  • Backdahl, JesperKarolinska Univ Hosp Huddinge, Karolinska Inst, Dept Med Huddinge H7, SE-14183 Huddinge, Sweden. (författare)
  • Subramanian, NarmadhaKarolinska Univ Hosp Huddinge, Karolinska Inst, Dept Med Huddinge H7, SE-14183 Huddinge, Sweden. (författare)
  • Sekine, TakuyaKarolinska Univ Hosp Huddinge, Karolinska Inst, Ctr Infect Med, Dept Med Huddinge H7, SE-14152 Huddinge, Sweden. (författare)
  • Kerr, Alastair G. G.Karolinska Univ Hosp Huddinge, Karolinska Inst, Dept Med Huddinge H7, SE-14183 Huddinge, Sweden. (författare)
  • Tseng, Ben T. P.Karolinska Univ Hosp Huddinge, Karolinska Inst, Dept Med Huddinge H7, SE-14183 Huddinge, Sweden. (författare)
  • Laurencikiene, JurgaKarolinska Univ Hosp Huddinge, Karolinska Inst, Dept Med Huddinge H7, SE-14183 Huddinge, Sweden. (författare)
  • Buggert, MarcusKarolinska Institutet (författare)
  • Lourda, MagdaKarolinska Institutet (författare)
  • Kublickiene, KarolinaKarolinska Institutet (författare)
  • Bhalla, NayanikaKTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:kth)u1yvce5d (författare)
  • Andersson, AlmaKTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:kth)u15avt37 (författare)
  • Valsesia, ArmandNestle Res, Nestle Inst Hlth Sci, Dept Metab Hlth, Lausanne, Switzerland. (författare)
  • Astrup, ArneNovo Nord Fdn, Dept Obes & Nutr Sci, Hellerup, Denmark. (författare)
  • Blaak, Ellen E. E.Maastricht Univ Med Ctr, NUTRIM Sch Nutr & Translat Res Metab, Dept Human Biol, Maastricht, Netherlands. Univ Toulouse III Paul Sabatier UPS, Univ Toulouse, Inst Metab & Cardiovasc Dis I2MC, Inserm,UMR1297, Toulouse, France. Charles Univ Prague, Fac Med 3, Franco Czech Lab Clin Res Obes, Prague, Czech Republic. (författare)
  • Ståhl, Patrik,Dr.KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi(Swepub:kth)u1rstx38 (författare)
  • Viguerie, NathalieUniv Toulouse III Paul Sabatier UPS, Toulouse, France. Ctr Hosp Univ Toulouse, Lab Biochim, Toulouse, France. Inst Univ France IUF, Paris, France. Univ Leipzig, Med Dept 3 Endocrinol Nephrol Rheumatol, Med Ctr, Leipzig, Germany. (författare)
  • Langin, DominiqueUniv Toulouse III Paul Sabatier UPS, Toulouse, France. Ctr Hosp Univ Toulouse, Lab Biochim, Toulouse, France. Inst Univ France IUF, Paris, France. Univ Leipzig, Med Dept 3 Endocrinol Nephrol Rheumatol, Med Ctr, Leipzig, Germany. (författare)
  • Wolfrum, ChristianSwiss Fed Inst Technol, Dept Hlth Sci & Technol, Inst Food Nutr & Hlth, Lab Translat Nutr Biol, Schwerzenbach, Switzerland. (författare)
  • Blueher, MatthiasUniv Leipzig, Helmholtz Inst Metab Obes & Vasc Res HI MAG, Helmholtz Zentrum Munchen, Leipzig, Germany.;Univ Hosp Leipzig, Leipzig, Germany. (författare)
  • Ryden, MikaelKarolinska Institutet (författare)
  • Mejhert, NiklasKarolinska Institutet (författare)
  • Karolinska InstitutetKarolinska Univ Hosp Huddinge, Karolinska Inst, Dept Med Huddinge H7, SE-14183 Huddinge, Sweden. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Nature Communications: Springer Nature14:12041-1723

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy