SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Deng Qiaolin)
 

Sökning: WFRF:(Deng Qiaolin) > Ovarian ERβ cistrom...

Ovarian ERβ cistrome and transcriptome reveal chromatin interaction with LRH-1

Birgersson, Madeleine (författare)
KTH,Proteinvetenskap
Indukuri, Rajitha (författare)
KTH,Cellulär och klinisk proteomik
Lindquist, Linnea (författare)
visa fler...
Stepanauskaite, Lina (författare)
KTH,Cellulär och klinisk proteomik
Luo, Qing (författare)
Deng, Qiaolin (författare)
Archer, Amena (författare)
KTH,Cellulär och klinisk proteomik
Williams, Cecilia, Professor, 1969- (författare)
KTH,Cellulär och klinisk proteomik
visa färre...
 (creator_code:org_t)
Engelska.
  • Annan publikation (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Background:  Estrogen receptor beta (ERβ, Esr2) plays a pivotal role in folliculogenesis and ovulation, yet its exact mechanism of action is mainly uncharacterized.Results: We here performed ChIP-sequencing of mouse ovaries followed by complementary RNA-sequencing of wild-type and ERβ knockout ovaries. By integrating the cistrome and transcriptome, we identify its direct target genes and enriched biological functions in the ovary. This demonstrates a strong impact on genes regulating organism development, cell migration, lipid metabolism, response to hypoxia, and response to estrogen. Cell-type deconvolution analysis of the bulk RNA-seq data revealed a decrease in luteal cells and an increased proportion of theca cells and a specific type of cumulus cells upon ERβ loss. Moreover, we identify a significant overlap with the gene regulatory network of liver receptor homolog 1 (LRH-1). ERβ and LRH-1 extensively bind to the same chromatin locations in granulosa cells and we corroborate simultaneous co-binding using ChIP re-ChIP, at the ERβ-repressed gene Greb1. At other shared sites (by ERβ-upregulated genes Cyp11a1 and Fkbp5), they do not bind simultaneously. Transactivation assay experimentation further show that ERβ and LRH-1 can inhibit their respective transcriptional activity at classical response elements.Conclusions: We characterize genome-wide ERβ chromatin binding and gene regulations which reveal extensive crosstalk between ERβ and LRH-1. We experimentally corroborate co-binding to target genes and impact on transactivation. Our data offer genome-wide mechanistic underpinnings of ovarian physiology and fertility.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinsk bioteknologi -- Medicinsk bioteknologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Medical Biotechnology -- Medical Biotechnology (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

vet (ämneskategori)
ovr (ämneskategori)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy