Spatial transcriptomics of human placentas reveal distinct RNA patterns associated with morphology and preeclampsia

Bhalla, NayanikaKTH Royal Institute of Technology,KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab (författare)

QC 20230911
Susanne Lager and Patrik L. Ståhl are shared senior authors.
Spatial transcriptomics (ST) maps RNA level patterns within a tissue. This technology has not been previously applied to human placental tissue. We demonstrate analysis of human placental samples with ST. Unsupervised clustering revealed that distinct RNA patterns were found corresponding to different morphological structures. Additionally, when focusing upon terminal villi and hemoglobin associated structures, RNA levels differed between placentas from full term healthy pregnancies and those complicated by preeclampsia. The results from this study can provide a benchmark for future ST studies in placenta.

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Klinisk medicin Reproduktionsmedicin och gynekologi hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Clinical Medicine Obstetrics, Gynaecology and Reproductive Medicine hsv//eng
Differential gene expression
Hemoglobin
Morphology
Oxidoreductase pathway
Placenta
Preeclampsia
Pregnancy complications
Spatial transcriptomics
Villi
Differential gene expression
Hemoglobin
Morphology
Oxidoreductase pathway
Placenta
Preeclampsia
Pregnancy complications
Spatial transcriptomics
Villi

Franzén, LovisaKTH Royal Institute of Technology,KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:kth)u1uxl018 (författare)
Scheynius, AnnikaKarolinska Institute (författare)
Papadogiannakis, NikosKarolinska Institute,Karolinska University Hospital (författare)
Hansson, Stefan R.Lund University,Lunds universitet,Obstetrik och gynekologi, Lund,Sektion V,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Enheten för translationell obstetrisk forskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Obstetrics and Gynaecology (Lund),Section V,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Unit for translational obstetric research,Lund University Research Groups(Swepub:lu)gyn-sha (författare)
Lager, SusanneUppsala universitet,Uppsala University,Obstetrisk och reproduktiv hälsoforskning(Swepub:uu)susla462 (författare)
Ståhl, Patrik,Dr.KTH Royal Institute of Technology,KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi(Swepub:kth)u1rstx38 (författare)
KTHGenteknologi (creator_code:org_t)

Av författaren/redakt...: Bhalla, Nayanika; Franzén, Lovisa; Scheynius, Annik ...; Papadogiannakis, ...; Hansson, Stefan ...; Lager, Susanne; visa fler...; Ståhl, Patrik, D ...; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Reproduktionsmed ...

Av lärosätet: Kungliga Tekniska Högskolan; Lunds universitet; Karolinska Institutet; Uppsala universitet

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.