Sökning: (WFRF:(Jangard Mattias)) >
Spatial transcripto...
Spatial transcriptomics of B cell and T cell receptors reveals lymphocyte clonal dynamics
-
- Engblom, Camilla (författare)
- Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden.
-
- Thrane, Kim (författare)
- KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Lin, Qirong (författare)
- Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden.
-
visa fler...
-
- Andersson, Alma (författare)
- KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Toosi, Hosein (författare)
- KTH,Beräkningsvetenskap och beräkningsteknik (CST),Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Chen, Xinsong (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Steiner, Embla (författare)
- Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden.
-
- Lu, Chang (författare)
- Heidelberg University, Faculty of Medicine and Heidelberg University Hospital, Institute for Computational Biomedicine, Heidelberg, Germany.
-
- Mantovani, Giulia (författare)
- Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden.
-
- Hagemann-Jensen, Michael (författare)
- Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden.
-
- Saarenpää, Sami (författare)
- KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Jangard, Mattias (författare)
- ENT Unit, Sophiahemmet University Research Laboratory and Sophiahemmet Hospital, Stockholm, Sweden.
-
- Saez-Rodriguez, Julio (författare)
- Heidelberg University, Faculty of Medicine and Heidelberg University Hospital, Institute for Computational Biomedicine, Heidelberg, Germany.
-
- Michaëlsson, Jakob (författare)
- Center for Infectious Medicine, Department of Medicine Huddinge, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden.
-
- Hartman, Johan (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Lagergren, Jens (författare)
- KTH,Beräkningsvetenskap och beräkningsteknik (CST),Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Mold, Jeff E. (författare)
- Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden.
-
- Lundeberg, Joakim (författare)
- KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi
-
- Frisén, Jonas (författare)
- Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden.
-
visa färre...
-
Department of Cell and Molecular Biology, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden Genteknologi (creator_code:org_t)
- American Association for the Advancement of Science (AAAS), 2023
- 2023
- Engelska.
-
Ingår i: Science. - : American Association for the Advancement of Science (AAAS). - 0036-8075 .- 1095-9203. ; 382:6675, s. 8486-
- Relaterad länk:
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- The spatial distribution of lymphocyte clones within tissues is critical to their development, selection, and expansion. We have developed spatial transcriptomics of variable, diversity, and joining (VDJ) sequences (Spatial VDJ), a method that maps B cell and T cell receptor sequences in human tissue sections. Spatial VDJ captures lymphocyte clones that match canonical B and T cell distributions and amplifies clonal sequences confirmed by orthogonal methods. We found spatial congruency between paired receptor chains, developed a computational framework to predict receptor pairs, and linked the expansion of distinct B cell clones to different tumor-associated gene expression programs. Spatial VDJ delineates B cell clonal diversity and lineage trajectories within their anatomical niche. Thus, Spatial VDJ captures lymphocyte spatial clonal architecture across tissues, providing a platform to harness clonal sequences for therapy.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Utvecklingsbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Developmental Biology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
-
Science
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Engblom, Camilla
-
Thrane, Kim
-
Lin, Qirong
-
Andersson, Alma
-
Toosi, Hosein
-
Chen, Xinsong
-
visa fler...
-
Steiner, Embla
-
Lu, Chang
-
Mantovani, Giuli ...
-
Hagemann-Jensen, ...
-
Saarenpää, Sam ...
-
Jangard, Mattias
-
Saez-Rodriguez, ...
-
Michaëlsson, Jak ...
-
Hartman, Johan
-
Lagergren, Jens
-
Mold, Jeff E.
-
Lundeberg, Joaki ...
-
Frisén, Jonas
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Utvecklingsbiolo ...
- Artiklar i publikationen
-
Science
- Av lärosätet
-
Kungliga Tekniska Högskolan
-
Karolinska Institutet