Sökning: WFRF:(Gudjonsson Sigurdur) >
Combined Gene Expre...
Combined Gene Expression and Genomic Profiling Define Two Intrinsic Molecular Subtypes of Urothelial Carcinoma and Gene Signatures for Molecular Grading and Outcome
-
- Lindgren, David (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine
-
- Frigyesi, Attila (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Anestesiologi och intensivvård,Sektion II,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Anesthesiology and Intensive Care,Section II,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
-
- Gudjonsson, Sigurdur (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Urologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Urology,Lund University Research Groups
-
visa fler...
-
- Sjödahl, Gottfrid (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
-
- Halldén, Christer (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Klinisk kemi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Chemistry, Malmö,Lund University Research Groups
-
Chebil, Gunilla (författare)
-
- Veerla, Srinivas (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine
-
- Rydén, Tobias (författare)
- Lund University
-
- Månsson, Wiking (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Urologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Urology,Lund University Research Groups
-
- Liedberg, Fredrik (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Urologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Urology,Lund University Research Groups
-
- Höglund, Mattias (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2010
- 2010
- Engelska.
-
Ingår i: Cancer Research. - 0008-5472 .- 1538-7445. ; 70:9, s. 3463-3472
- Relaterad länk:
-
http://www.ncbi.nlm.... (free)
-
visa fler...
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- In the present investigation, we sought to refine the classification of urothelial carcinoma by combining information on gene expression, genomic, and gene mutation levels. For these purposes, we performed gene expression analysis of 144 carcinomas, and whole genome array-CGH analysis and mutation analyses of FGFR3, PIK3CA, KRAS, HRAS, NRAS, TP53, CDKN2A, and TSC1 in 103 of these cases. Hierarchical cluster analysis identified two intrinsic molecular subtypes, MS1 and MS2, which were validated and defined by the same set of genes in three independent bladder cancer data sets. The two subtypes differed with respect to gene expression and mutation profiles, as well as with the level of genomic instability. The data show that genomic instability was the most distinguishing genomic feature of MS2 tumors, and that this trait was not dependent on TP53/MDM2 alterations. By combining molecular and pathologic data, it was possible to distinguish two molecular subtypes of T(a) and T(1) tumors, respectively. In addition, we define gene signatures validated in two independent data sets that classify urothelial carcinoma into low-grade (G(1)/G(2)) and high-grade (G(3)) tumors as well as non-muscle and muscle-invasive tumors with high precisions and sensitivities, suggesting molecular grading as a relevant complement to standard pathologic grading. We also present a gene expression signature with independent prognostic effect on metastasis and disease-specific survival. We conclude that the combination of molecular and histopathologic classification systems might provide a strong improvement for bladder cancer classification and produce new insights into the development of this tumor type.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Lindgren, David
-
Frigyesi, Attila
-
Gudjonsson, Sigu ...
-
Sjödahl, Gottfri ...
-
Halldén, Christe ...
-
Chebil, Gunilla
-
visa fler...
-
Veerla, Srinivas
-
Rydén, Tobias
-
Månsson, Wiking
-
Liedberg, Fredri ...
-
Höglund, Mattias
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Cancer Research
- Av lärosätet
-
Kungliga Tekniska Högskolan
-
Lunds universitet