Sökning: WFRF:(Ortqvist Eva) >
Building and valida...
Building and validating a prediction model for paediatric type 1 diabetes risk using next generation targeted sequencing of class II HLA genes
-
- Ping Zhao, Lue (författare)
- Fred Hutchinson Cancer Research Centre, WA 98109 USA; University of Washington, WA 98195 USA
-
- Carlsson, Annelie (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Pediatrik, Lund,Sektion V,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Pediatrisk autoimmunitet,Forskargrupper vid Lunds universitet,Paediatrics (Lund),Section V,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Pediatric Autoimmunity,Lund University Research Groups,Pediatrisk endokrinologi,Paediatric Endocrinology,Skåne University Hospital
-
- Larsson, Helena Elding (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Pediatrisk endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Paediatric Endocrinology,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital
-
visa fler...
-
- Forsander, Gun, 1951 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för pediatrik,Institute of Clinical Sciences, Department of Pediatrics
-
- Ivarsson, Sten A. (författare)
- Lund University, Sweden
-
- Kockum, Ingrid (författare)
- Karolinska Institute,Karolinska Institutet
-
- Ludvigsson, Johnny (författare)
- Linköping University,Linköpings universitet,Avdelningen för barns och kvinnors hälsa,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Barn- och ungdomskliniken i Linköping
-
- Marcus, Claude (författare)
- Karolinska Institute,Karolinska Institutet
-
- Persson, Martina (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska University Hospital
-
- Samuelsson, Ulf (författare)
- Linköping University,Linköpings universitet,Avdelningen för barns och kvinnors hälsa,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Barn- och ungdomskliniken i Linköping
-
- Ortqvist, Eva (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska University Hospital
-
- Pyo, Chul-Woo (författare)
- Fred Hutchinson Cancer Research Centre, WA 98104 USA
-
- Bolouri, Hamid (författare)
- University of Washington, WA 98195 USA
-
- Zhao, Michael (författare)
- University of Washington, WA 98195 USA
-
- Nelson, Wyatt C. (författare)
- Fred Hutchinson Cancer Research Centre, WA 98104 USA
-
- Geraghty, Daniel E. (författare)
- Fred Hutchinson Cancer Research Centre, WA 98104 USA
-
- Lernmark, Åke (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Celiaki och diabetes,Forskargrupper vid Lunds universitet,Celiac Disease and Diabetes Unit,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
-
- 2017-09-15
- 2017
- Engelska.
-
Ingår i: Diabetes/Metabolism Research Reviews. - : WILEY. - 1520-7552 .- 1520-7560. ; 33:8
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10...
-
visa fler...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- AimIt is of interest to predict possible lifetime risk of type 1 diabetes (T1D) in young children for recruiting high-risk subjects into longitudinal studies of effective prevention strategies. MethodsUtilizing a case-control study in Sweden, we applied a recently developed next generation targeted sequencing technology to genotype class II genes and applied an object-oriented regression to build and validate a prediction model for T1D. ResultsIn the training set, estimated risk scores were significantly different between patients and controls (P=8.12x10(-92)), and the area under the curve (AUC) from the receiver operating characteristic (ROC) analysis was 0.917. Using the validation data set, we validated the result with AUC of 0.886. Combining both training and validation data resulted in a predictive model with AUC of 0.903. Further, we performed a biological validation by correlating risk scores with 6 islet autoantibodies, and found that the risk score was significantly correlated with IA-2A (Z-score=3.628, Pamp;lt;0.001). When applying this prediction model to the Swedish population, where the lifetime T1D risk ranges from 0.5% to 2%, we anticipate identifying approximately 20 000 high-risk subjects after testing all newborns, and this calculation would identify approximately 80% of all patients expected to develop T1D in their lifetime. ConclusionThrough both empirical and biological validation, we have established a prediction model for estimating lifetime T1D risk, using class II HLA. This prediction model should prove useful for future investigations to identify high-risk subjects for prevention research in high-risk populations.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Endokrinologi och diabetes (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Endocrinology and Diabetes (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Pediatrik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Pediatrics (hsv//eng)
Nyckelord
- autoimmune disease; genetics; genome-wide association study; islet autoantibodies; object-oriented regression; type 1 diabetes
- Journal Article
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Ping Zhao, Lue
-
Carlsson, Anneli ...
-
Larsson, Helena ...
-
Forsander, Gun, ...
-
Ivarsson, Sten A ...
-
Kockum, Ingrid
-
visa fler...
-
Ludvigsson, John ...
-
Marcus, Claude
-
Persson, Martina
-
Samuelsson, Ulf
-
Ortqvist, Eva
-
Pyo, Chul-Woo
-
Bolouri, Hamid
-
Zhao, Michael
-
Nelson, Wyatt C.
-
Geraghty, Daniel ...
-
Lernmark, Åke
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Endokrinologi oc ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Pediatrik
- Artiklar i publikationen
-
Diabetes/Metabol ...
- Av lärosätet
-
Linköpings universitet
-
Karolinska Institutet
-
Lunds universitet
-
Göteborgs universitet