Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:liu-168487" >
TissueWand, a rapid...
-
Lindvall, MartinLinköpings universitet,Medie- och Informationsteknik,Tekniska fakulteten,Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV,Sectra AB
(författare)
TissueWand, a rapid histopathology annotation tool
- Artikel/kapitelEngelska2020
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
Medknow Publications,2020
-
electronicrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:liu-168487
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-168487URI
-
https://doi.org/10.4103/jpi.jpi_5_20DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Background: Recent advancements in machine learning (ML) bring great possibilities for the development of tools to assist with diagnostic tasks within histopathology. However, these approaches typically require a large amount of ground truth training data in the form of image annotations made by human experts. As such annotation work is a very time-consuming task, there is a great need for tools that can assist in this process, saving time while not sacrificing annotation quality. Methods: In an iterative design process, we developed TissueWand – an interactive tool designed for efficient annotation of gigapixel-sized histopathological images, not being constrained to a predefined annotation task. Results: Several findings regarding appropriate interaction concepts were made, where a key design component was semi-automation based on rapid interaction feedback in a local region. In a user study, the resulting tool was shown to cause substantial speed-up compared to manual work while maintaining quality. Conclusions: The TissueWand tool shows promise to replace manual methods for early stages of dataset curation where no task-specific ML model yet exists to aid the effort.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Sanner, AlexanderSectra AB, Research Department, Linköping, Sweden
(författare)
-
Petré, FredrikSectra AB, Research Department, Linköping, Sweden
(författare)
-
Lindman, Karin,1980-Linköpings universitet,Avdelningen för neurobiologi,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Klinisk patologi(Swepub:liu)karsk31
(författare)
-
Treanor, Darren,1974-Linköpings universitet,Avdelningen för inflammation och infektion,Medicinska fakulteten,Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV,Region Östergötland, Klinisk patologi,University of Leeds, Leeds, UK(Swepub:liu)dartr72
(författare)
-
Lundström, Claes,1973-Linköpings universitet,Medie- och Informationsteknik,Tekniska fakulteten,Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV,Sectra AB(Swepub:liu)clalu03
(författare)
-
Löwgren, Jonas,1964-Linköpings universitet,Medie- och Informationsteknik,Tekniska fakulteten(Swepub:liu)jonlo66
(författare)
-
Linköpings universitetMedie- och Informationsteknik
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Journal of Pathology Informatics: Medknow Publications11:272229-50892153-3539
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Lindvall, Martin
-
Sanner, Alexande ...
-
Petré, Fredrik
-
Lindman, Karin, ...
-
Treanor, Darren, ...
-
Lundström, Claes ...
-
visa fler...
-
Löwgren, Jonas, ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- HUMANIORA
-
HUMANIORA
-
och Konst
-
och Design
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Data och informa ...
-
och Människa datorin ...
- Artiklar i publikationen
-
Journal of Patho ...
- Av lärosätet
-
Linköpings universitet