Large-scale association analyses identify host factors influencing human gut microbiome composition

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Tyck till om SwePub Sök här!

Sökning: WFRF:(Jakob Robert) > (2020-2022) > Large-scale associa...

1 av 32
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Kurilshikov, AlexanderUniv Groningen, Netherlands (författare)

Large-scale association analyses identify host factors influencing human gut microbiome composition

Artikel/kapitelEngelska2021

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2021-01-18
Nature Publishing Group,2021
printrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:liu-174837
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-174837URI
https://doi.org/10.1038/s41588-020-00763-1DOI
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-193301URI
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:145699130URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Funding Agencies|Cancer Research UKCancer Research UK [C18281/A19169] Funding Source: Medline; CIHRCanadian Institutes of Health Research (CIHR) [CMF108031] Funding Source: Medline; Department of HealthEuropean Commission [BRC-1215-20011] Funding Source: Medline; Medical Research CouncilUK Research & Innovation (UKRI)Medical Research Council UK (MRC)European Commission [MR/N01183X/1, MC_UU_12013/3, MC_UU_00011/6] Funding Source: Medline; NCATS NIH HHSUnited States Department of Health & Human ServicesNational Institutes of Health (NIH) - USANIH National Center for Advancing Translational Sciences (NCATS) [UL1 TR002489] Funding Source: Medline; NHGRI NIH HHSUnited States Department of Health & Human ServicesNational Institutes of Health (NIH) - USANIH National Human Genome Research Institute (NHGRI) [U01 HG004729, U01 HG004446] Funding Source: Medline; NHLBI NIH HHSUnited States Department of Health & Human ServicesNational Institutes of Health (NIH) - USANIH National Heart Lung & Blood Institute (NHLBI) [R01 HL140976, N01HC65236, N01HC65234, N01HC65237, N01HC65226, N01HC65235, HHSN268201300005C, N01HC65233] Funding Source: Medline; NIDDK NIH HHSUnited States Department of Health & Human ServicesNational Institutes of Health (NIH) - USANIH National Institute of Diabetes & Digestive & Kidney Diseases (NIDDK) [R01 DK062370, P30 DK056350, R01 DK092127] Funding Source: Medline; NIMHD NIH HHSUnited States Department of Health & Human ServicesNational Institutes of Health (NIH) - USANIH National Institute on Minority Health & Health Disparities (NIMHD) [R01 MD011389] Funding Source: Medline; NIMH NIH HHSUnited States Department of Health & Human ServicesNational Institutes of Health (NIH) - USANIH National Institute of Mental Health (NIMH) [U24 MH068457, RC2 MH089951, RC2 MH089995] Funding Source: Medline; NINDS NIH HHSUnited States Department of Health & Human ServicesNational Institutes of Health (NIH) - USANIH National Institute of Neurological Disorders & Stroke (NINDS) [T32 NS095775] Funding Source: Medline; Wellcome TrustWellcome TrustEuropean Commission [202802/Z/16/Z, 204813/Z/16/Z] Funding Source: Medline
To study the effect of host genetics on gut microbiome composition, the MiBioGen consortium curated and analyzed genome-wide genotypes and 16S fecal microbiome data from 18,340 individuals (24 cohorts). Microbial composition showed high variability across cohorts: only 9 of 410 genera were detected in more than 95% of samples. A genome-wide association study of host genetic variation regarding microbial taxa identified 31 loci affecting the microbiome at a genome-wide significant (P < 5 x 10(-8)) threshold. One locus, the lactase (LCT) gene locus, reached study-wide significance (genome-wide association study signal: P = 1.28 x 10(-20)), and it showed an age-dependent association with Bifidobacterium abundance. Other associations were suggestive (1.95 x 10(-10) < P < 5 x 10(-8)) but enriched for taxa showing high heritability and for genes expressed in the intestine and brain. A phenome-wide association study and Mendelian randomization identified enrichment of microbiome trait loci in the metabolic, nutrition and environment domains and suggested the microbiome might have causal effects in ulcerative colitis and rheumatoid arthritis.

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Biologi Genetik hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Genetics hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences hsv//eng

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Medina-Gomez, CarolinaErasmus MC Univ Med Ctr, Netherlands; Erasmus MC Univ Med Ctr, Netherlands (författare)
Bacigalupe, RodrigoKatholieke Univ Leuven, Belgium; VIB, Belgium (författare)
Radjabzadeh, DjawadErasmus MC Univ Med Ctr, Netherlands (författare)
Wang, JunKatholieke Univ Leuven, Belgium; VIB, Belgium; Chinese Acad Sci, Peoples R China (författare)
Demirkan, AyseUniv Groningen, Netherlands; Univ Surrey, England (författare)
Le Roy, Caroline IKings Coll London, England (författare)
Garay, Juan Antonio RaygozaUniv Toronto, Canada; Mt Sinai Hosp, Canada (författare)
Finnicum, Casey T.Avera McKennan Hosp, SD USA; Univ Hlth Ctr, SD USA (författare)
Liu, XingrongKarolinska Institutet,Karolinska Inst, Sweden; Karolinska Inst, Sweden (författare)
Zhernakova, Daria VUniv Groningen, Netherlands; ITMO Univ, Russia (författare)
Bonder, Marc JanUniv Groningen, Netherlands (författare)
Hansen, Tue H.Univ Copenhagen, Denmark (författare)
Frost, FabianUniv Med Greifswald, Germany (författare)
Ruhlemann, Malte C.Christian Albrechts Univ Kiel, Germany (författare)
Turpin, WilliamsUniv Toronto, Canada; Mt Sinai Hosp, Canada (författare)
Moon, Jee-YoungAlbert Einstein Coll Med, NY 10467 USA (författare)
Kim, Han-NaSungkyunkwan Univ, South Korea; Sungkyunkwan Univ, South Korea (författare)
Lull, KreeteUniv Tartu, Estonia (författare)
Barkan, EladWeizmann Inst Sci, Israel (författare)
Andreasson, AnnaKarolinska Institutet,Stockholms universitet,Stressforskningsinstitutet,Copenhagen Univ Hosp, Denmark,Stockholm Univ, Sweden,Univ Bristol, England; Univ Bristol Sch Med, England,Kings Coll London, England; Univ Oxford, England,Maastricht Univ Med Ctr, Netherlands; Maastricht Univ, Netherlands,Erasmus MC Univ Med Ctr, Netherlands,Univ N Carolina, NC USA; Univ North Carolina Chapel Hill, NC USA(Swepub:su)anan6088 (författare)
Fornage, MyriamUniv Texas Hlth Sci Ctr Houston, TX 77030 USA (författare)
Szopinska-Tokov, JoannaUniv Texas Hlth Sci Ctr Houston, TX USA; Radboudumc, Netherlands (författare)
Wallen, Zachary D.Univ Alabama Birmingham, AL 35294 USA (författare)
Borisevich, DmitriiUniv Copenhagen, Denmark (författare)
Agreus, LarsKarolinska Institutet,Karolinska Inst, Sweden (författare)
Andreasson, AnnaStockholm Univ, Sweden (författare)
Bang, CorinnaChristian Albrechts Univ Kiel, Germany (författare)
Bedrani, LarbiUniv Toronto, Canada (författare)
Bell, Jordana T.Kings Coll London, England (författare)
Bisgaard, HansCopenhagen Univ Hosp, Denmark (författare)
Boehnke, MichaelUniv Michigan, MI 48109 USA (författare)
Boomsma, Dorret IVrije Univ, Netherlands (författare)
Burk, Robert D.Albert Einstein Coll Med, NY 10467 USA (författare)
Claringbould, AnniqueUniv Groningen, Netherlands (författare)
Croitoru, KennethUniv Toronto, Canada; Mt Sinai Hosp, Canada (författare)
Davies, Gareth E.Avera McKennan Hosp, SD USA; Univ Hlth Ctr, SD USA; Vrije Univ, Netherlands (författare)
van Duijn, Cornelia M.Erasmus MC Univ Med Ctr, Netherlands; Univ Oxford, England (författare)
Duijts, LiesbethErasmus MC Univ Med Ctr, Netherlands (författare)
Falony, GwenKatholieke Univ Leuven, Belgium; VIB, Belgium (författare)
Fu, JingyuanUniv Groningen, Netherlands (författare)
van der Graaf, AdriaanUniv Groningen, Netherlands (författare)
Hansen, TorbenUniv Copenhagen, Denmark (författare)
Homuth, GeorgUniv Med Greifswald, Germany (författare)
Hughes, David A.Univ Bristol, England; Univ Bristol Sch Med, England (författare)
Ijzerman, Richard G.Amsterdam Univ Med Ctr, Netherlands (författare)
Jackson, Matthew A.Kings Coll London, England; Univ Oxford, England (författare)
Jaddoe, Vincent W. V.Erasmus MC Univ Med Ctr, Netherlands; Erasmus MC Univ Med Ctr, Netherlands (författare)
Joossens, MarieKatholieke Univ Leuven, Belgium; VIB, Belgium (författare)
Jorgensen, TorbenUniv Copenhagen, Denmark; Univ Copenhagen, Denmark (författare)
Keszthelyi, DanielMaastricht Univ Med Ctr, Netherlands; Maastricht Univ, Netherlands (författare)
Knight, RobUniv Calif San Diego, CA 92093 USA; Univ Calif San Diego, CA 92093 USA; Univ Calif San Diego, CA 92093 USA (författare)
Laakso, MarkkuUniv Eastern Finland, Finland (författare)
Laudes, MatthiasUniv Hosp Schleswig Holstein, Germany (författare)
Launer, Lenore J.NIA, MD 20892 USA (författare)
Lieb, WolfgangUniv Kiel, Germany (författare)
Lusis, Aldons J.Univ Calif Los Angeles, CA 90024 USA; Univ Calif Los Angeles, CA USA; Univ Calif Los Angeles, CA 90024 USA (författare)
Masclee, Ad A. M.Maastricht Univ Med Ctr, Netherlands; Maastricht Univ, Netherlands (författare)
Moll, Henriette A.Erasmus MC Univ Med Ctr, Netherlands (författare)
Mujagic, ZlatanMaastricht Univ Med Ctr, Netherlands; Maastricht Univ, Netherlands (författare)
Qibin, QiAlbert Einstein Coll Med, NY 10467 USA (författare)
Rothschild, DaphnaWeizmann Inst Sci, Israel (författare)
Shin, HocheolSungkyunkwan Univ, South Korea; Sungkyunkwan Univ, South Korea (författare)
Sorensen, Soren J.Univ Copenhagen, Denmark (författare)
Steves, Claire J.Kings Coll London, England (författare)
Thorsen, JonathanCopenhagen Univ Hosp, Denmark (författare)
Timpson, Nicholas J.Univ Bristol, England; Univ Bristol Sch Med, England (författare)
Tito, Raul Y.Katholieke Univ Leuven, Belgium; VIB, Belgium (författare)
Vieira-Silva, SaraKatholieke Univ Leuven, Belgium; VIB, Belgium (författare)
Volker, UweUniv Med Greifswald, Germany (författare)
Volzke, HenryUniv Med Greifswald, Germany (författare)
Vosa, UrmoUniv Groningen, Netherlands (författare)
Wade, Kaitlin H.Univ Bristol, England; Univ Bristol Sch Med, England (författare)
Walter, SusannaLinköpings universitet,Avdelningen för inflammation och infektion,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Mag- tarmmedicinska kliniken(Swepub:liu)suswa35 (författare)
Watanabe, KyokoVrije Univ Amsterdam, Netherlands (författare)
Weiss, StefanUniv Med Greifswald, Germany (författare)
Weiss, Frank U.Univ Med Greifswald, Germany (författare)
Weissbrod, OmerHarvard Univ, MA 02115 USA (författare)
Westra, Harm-JanUniv Groningen, Netherlands (författare)
Willemsen, GonnekeVrije Univ, Netherlands (författare)
Payami, HaydehUniv Alabama Birmingham, AL 35294 USA (författare)
Jonkers, Daisy M. A. E.Karolinska Institutet,Karolinska Inst, Sweden; Karolinska Inst, Sweden; Monash Univ, Australia; Biodonostia Hlth Res Inst, Spain; Basque Sci Fdn, Spain (författare)
Vasquez, Alejandro AriasUniv Texas Hlth Sci Ctr Houston, TX USA; Radboudumc, Netherlands; Radboudumc, Netherlands (författare)
de Geus, Eco J. C.Vrije Univ, Netherlands; Amsterdam UMC, Netherlands (författare)
Meyer, Katie A.Univ N Carolina, NC USA; Univ North Carolina Chapel Hill, NC USA (författare)
Stokholm, JakobCopenhagen Univ Hosp, Denmark (författare)
Segal, EranWeizmann Inst Sci, Israel (författare)
Org, ElinUniv Tartu, Estonia (författare)
Wijmenga, CiscaUniv Groningen, Netherlands (författare)
Kim, Hyung-LaeEwha Womans Univ, South Korea (författare)
Kaplan, Robert C.Fred Hutchinson Canc Res Ctr, WA USA (författare)
Spector, Tim D.Kings Coll London, England (författare)
Uitterlinden, Andre G.Erasmus MC Univ Med Ctr, Netherlands; Erasmus MC Univ Med Ctr, Netherlands; Erasmus MC Univ Med Ctr, Netherlands (författare)
Rivadeneira, FernandoErasmus MC Univ Med Ctr, Netherlands; Erasmus MC Univ Med Ctr, Netherlands (författare)
Franke, AndreChristian Albrechts Univ Kiel, Germany (författare)
Lerch, Markus M.Univ Med Greifswald, Germany (författare)
Franke, LudeUniv Groningen, Netherlands (författare)
Sanna, SerenaUniv Groningen, Netherlands; CNR, Italy (författare)
DAmato, MauroKarolinska Inst, Sweden; Karolinska Inst, Sweden; Monash Univ, Australia; Biodonostia Hlth Res Inst, Spain; Basque Sci Fdn, Spain (författare)
Pedersen, OlufUniv Copenhagen, Denmark (författare)
Paterson, Andrew D.Hosp Sick Children Res Inst, Canada (författare)
Kraaij, RobertErasmus MC Univ Med Ctr, Netherlands (författare)
Raes, JeroenKatholieke Univ Leuven, Belgium; VIB, Belgium (författare)
Zhernakova, AlexandraUniv Groningen, Netherlands (författare)
Univ Groningen, NetherlandsErasmus MC Univ Med Ctr, Netherlands; Erasmus MC Univ Med Ctr, Netherlands (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Nature Genetics: Nature Publishing Group53:2, s. 156-1651061-40361546-1718

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Nature Genetics (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 32
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Kurilshikov, Ale ...; Medina-Gomez, Ca ...; Bacigalupe, Rodr ...; Radjabzadeh, Dja ...; Wang, Jun; Demirkan, Ayse; visa fler...; Le Roy, Caroline ...; Garay, Juan Anto ...; Finnicum, Casey ...; Liu, Xingrong; Zhernakova, Dari ...; Bonder, Marc Jan; Hansen, Tue H.; Frost, Fabian; Ruhlemann, Malte ...; Turpin, Williams; Moon, Jee-Young; Kim, Han-Na; Lull, Kreete; Barkan, Elad; Andreasson, Anna; Fornage, Myriam; Szopinska-Tokov, ...; Wallen, Zachary ...; Borisevich, Dmit ...; Agreus, Lars; Bang, Corinna; Bedrani, Larbi; Bell, Jordana T.; Bisgaard, Hans; Boehnke, Michael; Boomsma, Dorret ...; Burk, Robert D.; Claringbould, An ...; Croitoru, Kennet ...; Davies, Gareth E ...; van Duijn, Corne ...; Duijts, Liesbeth; Falony, Gwen; Fu, Jingyuan; van der Graaf, A ...; Hansen, Torben; Homuth, Georg; Hughes, David A.; Ijzerman, Richar ...; Jackson, Matthew ...; Jaddoe, Vincent ...; Joossens, Marie; Jorgensen, Torbe ...; Keszthelyi, Dani ...; Knight, Rob; Laakso, Markku; Laudes, Matthias; Launer, Lenore J ...; Lieb, Wolfgang; Lusis, Aldons J.; Masclee, Ad A. M ...; Moll, Henriette ...; Mujagic, Zlatan; Qibin, Qi; Rothschild, Daph ...; Shin, Hocheol; Sorensen, Soren ...; Steves, Claire J ...; Thorsen, Jonatha ...; Timpson, Nichola ...; Tito, Raul Y.; Vieira-Silva, Sa ...; Volker, Uwe; Volzke, Henry; Vosa, Urmo; Wade, Kaitlin H.; Walter, Susanna; Watanabe, Kyoko; Weiss, Stefan; Weiss, Frank U.; Weissbrod, Omer; Westra, Harm-Jan; Willemsen, Gonne ...; Payami, Haydeh; Jonkers, Daisy M ...; Vasquez, Alejand ...; de Geus, Eco J. ...; Meyer, Katie A.; Stokholm, Jakob; Segal, Eran; Org, Elin; Wijmenga, Cisca; Kim, Hyung-Lae; Kaplan, Robert C ...; Spector, Tim D.; Uitterlinden, An ...; Rivadeneira, Fer ...; Franke, Andre; Lerch, Markus M.; Franke, Lude; Sanna, Serena; DAmato, Mauro; Pedersen, Oluf; Paterson, Andrew ...; Kraaij, Robert; Raes, Jeroen; Zhernakova, Alex ...; visa färre...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Genetik

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi

Artiklar i publikationen: Nature Genetics

Av lärosätet: Linköpings universitet; Stockholms universitet; Karolinska Institutet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se